MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 2734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017434	CAT	2	6	187932	187937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017434	T	7	7	187971	187977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017434	TAA	2	6	188050	188055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017434	TTG	2	6	188078	188083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017434	AAG	2	6	191879	191884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017434	TC	3	6	191889	191894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_017434	AT	3	6	192231	192236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017434	TGT	2	6	192245	192250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017434	ATGC	2	8	192605	192612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017434	GTT	2	6	192613	192618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017434	GCA	2	6	192666	192671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017434	CTTT	2	8	192746	192753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017434	AAG	2	6	192793	192798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017434	T	6	6	192843	192848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017434	ATT	2	6	192856	192861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017434	T	6	6	192872	192877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017434	TATGAA	2	12	194848	194859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017434	AGA	2	6	194904	194909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017434	AAC	2	6	194911	194916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017434	ATA	2	6	194931	194936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017434	T	7	7	194956	194962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017434	TGA	2	6	195066	195071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017434	CTC	2	6	195840	195845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017434	CTA	2	6	196162	196167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017434	ATTT	2	8	196195	196202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017434	A	7	7	196681	196687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017434	AG	3	6	196703	196708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017434	AAT	2	6	196713	196718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017434	T	8	8	196733	196740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017434	T	6	6	196779	196784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017434	TAC	2	6	196823	196828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017434	ATT	2	6	196832	196837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017434	ACGA	2	8	202313	202320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_017434	CTAAG	2	10	202479	202488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
535	NC_017434	T	6	6	202587	202592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017434	GAAA	2	8	202599	202606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017434	A	7	7	202604	202610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017434	T	6	6	203377	203382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017434	CAT	2	6	203406	203411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017434	CT	3	6	203452	203457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017434	AAT	2	6	203499	203504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017434	TAG	2	6	203535	203540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017434	AAT	2	6	203548	203553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017434	AAG	2	6	203646	203651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017434	GA	4	8	206511	206518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017434	T	7	7	206541	206547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017434	CT	4	8	206559	206566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_017434	A	6	6	206568	206573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017434	CCTT	2	8	215733	215740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017434	GAA	2	6	215755	215760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017434	TTG	2	6	215772	215777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017434	A	6	6	215784	215789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017434	A	7	7	217800	217806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017434	TAA	2	6	217807	217812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017434	AG	4	8	217832	217839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017434	A	6	6	217857	217862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017434	GAA	2	6	217867	217872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017434	TA	3	6	219386	219391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017434	GTC	2	6	219405	219410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017434	CTAT	2	8	219460	219467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_017434	T	6	6	219476	219481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017434	ATT	2	6	219578	219583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017434	TCT	2	6	219603	219608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017434	TCC	2	6	219655	219660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017434	ATG	2	6	219678	219683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017434	GCAA	2	8	219703	219710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017434	TTTTAC	2	12	220862	220873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_017434	A	7	7	220924	220930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017434	TAA	2	6	220978	220983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017434	ATTTC	2	10	221005	221014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
571	NC_017434	CT	3	6	221026	221031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017434	CTTG	2	8	221387	221394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_017434	T	6	6	221442	221447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017434	TC	3	6	224027	224032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_017434	AG	3	6	224058	224063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017434	CAATA	2	10	224128	224137	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
577	NC_017434	TAA	2	6	225101	225106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017434	AAAC	2	8	225117	225124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_017434	T	8	8	227592	227599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017434	TGT	2	6	227661	227666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017434	TCCT	2	8	227742	227749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_017434	AAC	2	6	234233	234238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017434	AGA	2	6	234260	234265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017434	GAG	2	6	234277	234282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017434	GCT	2	6	234329	234334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017434	ACC	2	6	234338	234343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_017434	A	6	6	234369	234374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017434	ACT	2	6	234433	234438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017434	CA	3	6	243208	243213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_017434	AAAT	2	8	243357	243364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017434	AAGA	2	8	243376	243383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017434	GT	3	6	243425	243430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017434	T	6	6	243436	243441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017434	TAAA	2	8	246811	246818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017434	ATA	2	6	246833	246838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017434	TTA	2	6	246854	246859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017434	T	6	6	247811	247816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017434	TACAA	2	10	247840	247849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
599	NC_017434	ATA	2	6	247872	247877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017434	GA	3	6	250293	250298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017434	ACT	2	6	250353	250358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017434	TG	3	6	250403	250408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017434	AATA	2	8	250470	250477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017434	T	6	6	250492	250497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017434	T	7	7	250511	250517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017434	A	6	6	250519	250524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017434	ACA	2	6	250619	250624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017434	CTT	2	6	250626	250631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017434	AAG	2	6	250657	250662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017434	GCA	2	6	250676	250681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017434	TTG	2	6	250696	250701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017434	CAA	2	6	251160	251165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017434	AG	3	6	251205	251210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017434	A	8	8	251211	251218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017434	AAG	2	6	251229	251234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017434	TCC	2	6	252069	252074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017434	GAAA	2	8	252090	252097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017434	T	7	7	252111	252117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017434	GCAG	2	8	252139	252146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_017434	AGAA	2	8	252172	252179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017434	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017434	TAT	2	6	252237	252242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017434	ACA	2	6	252278	252283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017434	A	6	6	252327	252332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017434	AAC	2	6	253386	253391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017434	A	6	6	253400	253405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017434	TAA	2	6	253451	253456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017434	TA	3	6	254020	254025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017434	CCAA	2	8	254055	254062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_017434	A	7	7	254079	254085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017434	A	7	7	254520	254526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017434	ATA	2	6	254533	254538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017434	AACCCT	2	12	254579	254590	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017434	AAAC	2	8	254653	254660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_017434	ATTTTT	2	12	255374	255385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017434	GAG	2	6	255502	255507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017434	TAT	2	6	256206	256211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017434	ATA	2	6	256215	256220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017434	AAT	2	6	256239	256244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017434	AG	3	6	256301	256306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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