MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017432	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017432	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017432	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017432	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017432	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017432	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017432	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017432	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017432	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017432	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017432	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017432	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017432	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017432	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017432	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017432	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017432	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017432	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017432	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017432	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017432	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017432	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017432	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017432	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017432	GA	3	6	55535	55540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017432	CT	3	6	56433	56438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017432	GT	3	6	56483	56488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017432	TG	3	6	57187	57192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017432	CT	3	6	58068	58073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017432	GA	3	6	60747	60752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017432	AG	4	8	64772	64779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017432	TA	3	6	69103	69108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017432	CT	3	6	71839	71844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017432	TA	3	6	85201	85206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017432	TC	3	6	90422	90427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017432	GA	3	6	90554	90559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017432	CT	3	6	92904	92909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017432	GA	3	6	93390	93395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017432	GA	3	6	93432	93437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017432	TA	3	6	94049	94054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017432	TC	3	6	99930	99935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017432	AT	3	6	99981	99986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017432	TA	3	6	106657	106662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017432	TG	3	6	115899	115904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017432	CA	3	6	117817	117822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017432	AG	4	8	118485	118492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017432	GA	3	6	120307	120312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017432	TA	3	6	122542	122547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017432	GT	3	6	123531	123536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017432	CT	3	6	128065	128070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017432	TC	3	6	130387	130392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017432	AG	3	6	130464	130469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017432	AG	3	6	130489	130494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017432	TG	3	6	133296	133301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017432	AG	3	6	138149	138154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017432	GA	3	6	138212	138217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017432	AT	3	6	142444	142449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017432	GA	3	6	151681	151686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017432	AG	3	6	157246	157251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017432	TC	3	6	171709	171714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017432	AG	3	6	171841	171846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017432	CT	3	6	171859	171864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017432	TG	3	6	178350	178355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017432	CT	3	6	178495	178500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017432	GA	3	6	184273	184278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017432	AT	3	6	192725	192730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017432	AG	3	6	197196	197201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017432	TC	3	6	200187	200192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017432	AG	3	6	202019	202024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017432	CT	3	6	202031	202036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017432	CT	3	6	203945	203950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017432	GA	4	8	207004	207011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017432	CT	4	8	207052	207059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017432	AG	4	8	218324	218331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017432	TA	3	6	219878	219883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017432	CT	3	6	221518	221523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017432	TC	3	6	224519	224524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017432	AG	3	6	224550	224555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017432	TC	3	6	238750	238755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017432	AG	3	6	238776	238781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017432	CA	3	6	243700	243705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017432	GT	3	6	243917	243922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017432	GA	3	6	250785	250790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017432	TG	3	6	250895	250900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017432	AG	3	6	251697	251702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017432	AG	3	6	252706	252711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017432	TA	3	6	254512	254517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017432	TC	3	6	256828	256833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017432	AG	3	6	258306	258311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017432	TA	3	6	264669	264674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017432	CA	3	6	266476	266481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017432	TC	3	6	268376	268381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017432	TA	3	6	273929	273934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017432	AT	4	8	284489	284496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017432	CT	3	6	285341	285346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017432	TC	4	8	285432	285439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017432	TC	3	6	287123	287128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017432	TC	3	6	287180	287185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017432	CT	3	6	287653	287658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017432	AT	3	6	299674	299679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017432	CA	3	6	302003	302008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017432	GA	3	6	306734	306739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017432	AG	3	6	315940	315945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017432	CT	3	6	347889	347894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017432	CT	3	6	350960	350965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017432	TC	3	6	355186	355191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017432	TC	3	6	359016	359021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017432	CT	3	6	359102	359107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017432	AC	3	6	362435	362440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017432	GA	3	6	364345	364350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017432	TC	3	6	364423	364428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017432	TA	3	6	364624	364629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017432	GT	3	6	367995	368000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017432	CT	4	8	381762	381769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017432	CG	3	6	391600	391605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017432	CA	3	6	392650	392655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017432	TC	3	6	395197	395202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017432	CT	3	6	395687	395692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017432	GA	3	6	395817	395822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017432	GA	3	6	395948	395953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017432	CT	3	6	411031	411036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017432	CT	3	6	429761	429766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017432	CT	3	6	430784	430789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017432	AG	3	6	431131	431136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017432	GA	3	6	432826	432831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017432	AC	3	6	436824	436829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017432	CT	3	6	441095	441100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017432	AC	3	6	441133	441138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017432	CA	3	6	443602	443607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017432	CT	3	6	445006	445011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017432	CT	3	6	454288	454293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017432	AG	3	6	460429	460434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017432	TC	3	6	466967	466972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017432	AT	3	6	467036	467041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017432	GA	4	8	468410	468417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017432	TA	3	6	468453	468458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017432	GA	3	6	468551	468556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017432	TC	3	6	480283	480288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017432	AC	3	6	485814	485819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017432	GA	4	8	485859	485866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017432	CA	3	6	485896	485901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017432	TC	3	6	485937	485942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017432	AC	3	6	490372	490377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017432	AG	3	6	490534	490539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017432	CT	3	6	490553	490558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017432	CT	3	6	493832	493837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017432	CT	3	6	494350	494355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017432	TG	3	6	494383	494388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017432	TA	3	6	494496	494501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017432	CT	4	8	500153	500160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017432	CA	3	6	508223	508228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017432	CT	3	6	509161	509166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017432	TA	3	6	514963	514968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017432	AG	3	6	516861	516866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017432	GA	3	6	517862	517867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.