MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 2638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017432	CA	3	6	596787	596792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_017432	GAA	2	6	596887	596892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017432	A	6	6	596983	596988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017432	A	6	6	597030	597035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017432	ACCT	2	8	597941	597948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_017432	TACA	2	8	597963	597970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_017432	AG	3	6	597977	597982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017432	GCA	2	6	598024	598029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017432	A	7	7	598063	598069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017432	TAT	2	6	601242	601247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017432	T	12	12	601250	601261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017432	AGCA	2	8	601262	601269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_017432	A	6	6	601279	601284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017432	TAC	2	6	601286	601291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017432	GA	3	6	602978	602983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017432	TAG	2	6	603581	603586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017432	AGA	2	6	603596	603601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017432	GGA	2	6	603619	603624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017432	T	6	6	605562	605567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017432	TTC	2	6	605590	605595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017432	CCT	2	6	605609	605614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017432	CTAC	2	8	605651	605658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017432	TAGGGG	2	12	605720	605731	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017432	TA	3	6	605890	605895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017432	AGA	2	6	605927	605932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017432	CCA	2	6	605944	605949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_017432	TTA	2	6	605977	605982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017432	TC	3	6	605992	605997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017432	TCT	2	6	606084	606089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017432	CTT	2	6	606100	606105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017432	CAA	2	6	606108	606113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017432	TTGC	2	8	606195	606202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_017432	CCT	2	6	606225	606230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_017432	CT	3	6	606583	606588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_017432	A	6	6	607085	607090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017432	TTC	2	6	607836	607841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017432	T	6	6	607872	607877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017432	A	10	10	607925	607934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017432	T	7	7	611044	611050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017432	ACC	2	6	611065	611070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_017432	ACT	2	6	611096	611101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017432	TC	3	6	611119	611124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_017432	TAT	2	6	611125	611130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017432	AC	3	6	611143	611148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_017432	ATCC	2	8	611163	611170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_017432	CGC	2	6	611177	611182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_017432	CT	3	6	611200	611205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_017432	TCT	2	6	611225	611230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017432	GAC	2	6	611262	611267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017432	TAC	2	6	611270	611275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017432	ATG	2	6	611287	611292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017432	A	6	6	611322	611327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017432	AC	3	6	611395	611400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017432	CTC	2	6	616536	616541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_017432	A	6	6	616633	616638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017432	CT	3	6	616647	616652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_017432	AG	3	6	616689	616694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017432	A	6	6	616702	616707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017432	GGAA	2	8	616717	616724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017432	A	7	7	616729	616735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017432	TATT	2	8	617629	617636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017432	TAA	2	6	617638	617643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017432	AAAT	2	8	617661	617668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017432	T	7	7	617668	617674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017432	TCTTTT	2	12	617715	617726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1566	NC_017432	T	6	6	617723	617728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017432	ATG	2	6	617729	617734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017432	TTA	2	6	617743	617748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017432	CTT	2	6	618740	618745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017432	T	6	6	620245	620250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017432	CAG	2	6	620288	620293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017432	CT	3	6	621613	621618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017432	CAT	2	6	622168	622173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_017432	CT	3	6	622254	622259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_017432	CCG	2	6	622314	622319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_017432	GAAA	2	8	622349	622356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_017432	GAA	2	6	622494	622499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017432	AGA	2	6	622526	622531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017432	CGA	2	6	622560	622565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017432	CTT	2	6	622624	622629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_017432	AC	4	8	622661	622668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_017432	ATC	2	6	622716	622721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017432	AGG	2	6	622852	622857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017432	A	6	6	622917	622922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017432	TC	3	6	622930	622935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_017432	CCG	2	6	622976	622981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_017432	A	7	7	622990	622996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017432	CTTCT	2	10	622998	623007	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1590	NC_017432	CTC	2	6	623016	623021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_017432	AAG	2	6	623056	623061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017432	AGA	2	6	623120	623125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017432	AAG	2	6	623176	623181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017432	T	6	6	623216	623221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017432	TCG	2	6	623223	623228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017432	TCGC	2	8	623243	623250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_017432	TCT	2	6	623312	623317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017432	GAT	2	6	623363	623368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017432	T	6	6	623396	623401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017432	TAAG	2	8	624681	624688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017432	A	6	6	624717	624722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017432	AGA	2	6	624730	624735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017432	GATT	2	8	624804	624811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017432	TTC	2	6	628437	628442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017432	T	6	6	628462	628467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017432	CCT	2	6	628468	628473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_017432	T	6	6	629087	629092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017432	CT	3	6	629172	629177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_017432	TTTCC	2	10	629178	629187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1610	NC_017432	CTTC	2	8	629213	629220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_017432	ATC	2	6	629226	629231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017432	A	6	6	631645	631650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017432	GTGA	2	8	631687	631694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017432	TCT	2	6	633540	633545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017432	AT	3	6	633564	633569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017432	A	9	9	633572	633580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017432	T	6	6	633604	633609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017432	A	8	8	636586	636593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017432	CTCC	2	8	636597	636604	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1620	NC_017432	A	6	6	636605	636610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017432	TTC	2	6	636618	636623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_017432	TTG	2	6	636644	636649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017432	T	7	7	637117	637123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017432	ATTAA	2	10	637130	637139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017432	A	6	6	637184	637189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017432	T	8	8	639496	639503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017432	TTC	2	6	639507	639512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017432	CCT	2	6	639521	639526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_017432	CCT	2	6	640711	640716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_017432	AAC	2	6	645720	645725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017432	A	6	6	645734	645739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017432	A	8	8	645766	645773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017432	T	7	7	645806	645812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017432	A	6	6	645816	645821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017432	A	7	7	645823	645829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017432	GA	3	6	648699	648704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017432	GA	3	6	648711	648716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017432	AGG	2	6	648743	648748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_017432	A	8	8	648766	648773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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