MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 2638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017432	AAAC	2	8	171869	171876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_017432	T	6	6	172843	172848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017432	AAG	2	6	172863	172868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017432	ATA	2	6	172916	172921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017432	AAC	2	6	172940	172945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017432	ATT	2	6	172968	172973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017432	AGA	2	6	172992	172997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017432	T	7	7	173002	173008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017432	A	6	6	173012	173017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017432	GTAT	2	8	173051	173058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017432	TTA	2	6	173063	173068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017432	A	6	6	173068	173073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017432	ATT	2	6	173160	173165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017432	GGAA	2	8	178239	178246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017432	TGA	2	6	178273	178278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017432	TG	3	6	178350	178355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017432	GCTG	2	8	178406	178413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_017432	GTT	2	6	178421	178426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017432	TCA	2	6	178429	178434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017432	TTG	2	6	178452	178457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017432	CT	3	6	178495	178500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_017432	AGA	2	6	178528	178533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017432	CAA	2	6	178666	178671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017432	TTTC	2	8	178699	178706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_017432	AGT	2	6	178738	178743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017432	GAT	2	6	178773	178778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017432	CTC	2	6	178793	178798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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529	NC_017432	AAG	2	6	178840	178845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017432	TGC	2	6	178908	178913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017432	AGC	2	6	178948	178953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017432	ACT	2	6	179083	179088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017432	T	7	7	179111	179117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017432	TTC	2	6	179129	179134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017432	GAC	2	6	179151	179156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017432	TCA	2	6	179254	179259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017432	GAT	2	6	179260	179265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017432	ATT	3	9	179335	179343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017432	CTG	3	9	179344	179352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017432	GGAAT	2	10	179359	179368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017432	TTGA	2	8	179433	179440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017432	ATG	2	6	179452	179457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017432	TGA	3	9	179461	179469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017432	TGA	2	6	179495	179500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017432	GAG	2	6	179636	179641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017432	AGT	2	6	179647	179652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017432	GAT	2	6	179741	179746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017432	AGA	2	6	179752	179757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017432	GCG	2	6	179776	179781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017432	TGA	2	6	179830	179835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017432	ATA	2	6	179849	179854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017432	TTA	2	6	179869	179874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017432	TGA	2	6	180951	180956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017432	TTCC	2	8	181081	181088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_017432	ACA	2	6	181108	181113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017432	TGT	2	6	181149	181154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017432	AAAC	2	8	181184	181191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_017432	AGAAA	2	10	182471	182480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017432	AAGA	2	8	182492	182499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017432	T	8	8	182516	182523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017432	AGAAAA	2	12	182534	182545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017432	A	7	7	182542	182548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017432	TAT	2	6	184233	184238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017432	GA	3	6	184273	184278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017432	GTT	2	6	185595	185600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017432	GTT	4	12	185993	186004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017432	T	6	6	186010	186015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017432	T	7	7	186018	186024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017432	T	6	6	186030	186035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017432	T	7	7	186080	186086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017432	A	7	7	186102	186108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017432	T	6	6	186125	186130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017432	ATC	2	6	187814	187819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017432	CGATA	2	10	187842	187851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
575	NC_017432	T	6	6	187855	187860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_017432	AGT	2	6	187899	187904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017432	TGC	2	6	187990	187995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017432	AGT	2	6	188058	188063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017432	AGT	2	6	188081	188086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017432	TTG	2	6	188089	188094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017432	TAT	2	6	188169	188174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017432	GGAC	2	8	188283	188290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_017432	AAG	2	6	188393	188398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_017432	CAT	2	6	188425	188430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_017432	TAA	2	6	188542	188547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017432	TTG	2	6	188572	188577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_017432	TAC	2	6	188773	188778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017432	CAT	2	6	188789	188794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_017432	TGT	2	6	192739	192744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017432	AAG	2	6	193287	193292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017432	T	6	6	193337	193342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017432	ATT	2	6	193350	193355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017432	T	6	6	193366	193371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017432	TATGAA	2	12	195342	195353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017432	AGA	2	6	195398	195403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017432	AAC	2	6	195405	195410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017432	ATA	2	6	195425	195430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017432	T	7	7	195450	195456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017432	TGA	2	6	195560	195565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017432	CTC	2	6	196333	196338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_017432	CTA	2	6	196655	196660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017432	ATTT	2	8	196688	196695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017432	A	7	7	197174	197180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017432	AG	3	6	197196	197201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017432	AAT	2	6	197206	197211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017432	T	8	8	197226	197233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017432	T	6	6	197272	197277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017432	TAC	2	6	197316	197321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017432	ATT	2	6	197325	197330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_017432	CTT	2	6	200159	200164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017432	A	8	8	200169	200176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017432	TC	3	6	200187	200192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017432	CTT	2	6	200196	200201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017432	A	6	6	201965	201970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017432	AG	3	6	202019	202024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017432	CT	3	6	202031	202036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_017432	TGC	2	6	202073	202078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017432	AGG	2	6	202094	202099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017432	ACGA	2	8	202806	202813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_017432	CTAAG	2	10	202972	202981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
634	NC_017432	T	6	6	203080	203085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017432	GAAA	2	8	203092	203099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017432	A	7	7	203097	203103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017432	T	6	6	203870	203875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_017432	CT	3	6	203945	203950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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