MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017431	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017431	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017431	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017431	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017431	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017431	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017431	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017431	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017431	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017431	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017431	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017431	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017431	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017431	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017431	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017431	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017431	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017431	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017431	GA	3	6	36385	36390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017431	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017431	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017431	CT	3	6	40125	40130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017431	CT	3	6	42317	42322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017431	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017431	AG	3	6	42716	42721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017431	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017431	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017431	TG	4	8	51397	51404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017431	GA	3	6	55715	55720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017431	CT	3	6	56613	56618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017431	GT	3	6	56663	56668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017431	TG	3	6	57301	57306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017431	GA	3	6	60860	60865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017431	AG	4	8	64879	64886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017431	TA	3	6	85308	85313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017431	TC	3	6	90529	90534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017431	GA	3	6	90661	90666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017431	CT	3	6	93011	93016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017431	GA	3	6	93539	93544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017431	TA	3	6	94155	94160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017431	TC	3	6	100031	100036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017431	AT	3	6	100082	100087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017431	GC	3	6	102188	102193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017431	TA	3	6	106758	106763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017431	TG	3	6	116012	116017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017431	AG	4	8	118599	118606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017431	GA	3	6	120421	120426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017431	TA	3	6	122656	122661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017431	GT	3	6	123645	123650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017431	CT	3	6	128181	128186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017431	TC	3	6	130503	130508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017431	TG	3	6	133412	133417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017431	AG	3	6	138267	138272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017431	GA	3	6	138330	138335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017431	AT	3	6	142562	142567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017431	AG	3	6	157367	157372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017431	TC	3	6	171830	171835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017431	AG	3	6	171962	171967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017431	CT	3	6	171980	171985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017431	TG	3	6	178471	178476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017431	GA	3	6	183269	183274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017431	TC	3	6	183676	183681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017431	GA	3	6	183908	183913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017431	AT	3	6	192365	192370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017431	AG	3	6	197142	197147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017431	TC	3	6	200134	200139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017431	AG	3	6	201966	201971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017431	CT	3	6	203892	203897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017431	GA	4	8	206953	206960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017431	CT	4	8	207001	207008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017431	AG	4	8	218237	218244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017431	CA	3	6	218296	218301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017431	TA	3	6	219791	219796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017431	CT	3	6	221431	221436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017431	TC	3	6	224432	224437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017431	AG	3	6	224463	224468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017431	TC	3	6	238663	238668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017431	AG	3	6	238689	238694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017431	CA	3	6	243613	243618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017431	GT	3	6	243830	243835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017431	GA	3	6	250698	250703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017431	TG	3	6	250808	250813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017431	AG	3	6	251610	251615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017431	AG	3	6	252619	252624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017431	TA	3	6	254425	254430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017431	TC	3	6	256732	256737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017431	AG	3	6	258210	258215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017431	TA	3	6	264570	264575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017431	CA	3	6	266377	266382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017431	TA	3	6	273830	273835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017431	AT	4	8	284390	284397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017431	CT	3	6	285242	285247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017431	TC	4	8	285333	285340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017431	TC	3	6	287024	287029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017431	TC	3	6	287081	287086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017431	CT	3	6	287554	287559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017431	AT	3	6	299568	299573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017431	CA	3	6	301897	301902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017431	AC	3	6	301938	301943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017431	GA	3	6	306628	306633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017431	AG	3	6	315848	315853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017431	CT	3	6	347815	347820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017431	CT	3	6	350887	350892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017431	TC	3	6	355113	355118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017431	CT	3	6	359029	359034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017431	AC	3	6	362362	362367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017431	GA	3	6	364274	364279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017431	TA	3	6	364554	364559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017431	GC	3	6	366083	366088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017431	TC	3	6	366387	366392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017431	TA	3	6	366457	366462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017431	AC	3	6	367169	367174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017431	CT	4	8	367341	367348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017431	CT	3	6	367574	367579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017431	CA	3	6	367583	367588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017431	CT	4	8	381671	381678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017431	CG	3	6	391510	391515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017431	CA	3	6	392560	392565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017431	TC	3	6	395107	395112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017431	CT	3	6	395597	395602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017431	GA	3	6	395727	395732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017431	GA	3	6	395858	395863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017431	CT	3	6	410950	410955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017431	CT	3	6	429678	429683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017431	CT	3	6	430701	430706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017431	AG	3	6	431048	431053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017431	GA	3	6	432743	432748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017431	AC	3	6	436742	436747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017431	CT	3	6	441021	441026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017431	AC	3	6	441059	441064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017431	CA	3	6	443528	443533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017431	CT	3	6	444928	444933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017431	CT	3	6	454210	454215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017431	CT	3	6	456663	456668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017431	AG	3	6	460351	460356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017431	TC	3	6	466889	466894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017431	AT	3	6	466958	466963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017431	GA	4	8	468332	468339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017431	TA	3	6	468375	468380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017431	GA	3	6	468473	468478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017431	AC	3	6	485782	485787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017431	GA	4	8	485827	485834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017431	CA	3	6	485864	485869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017431	TC	3	6	485905	485910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017431	AC	3	6	490340	490345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017431	AG	3	6	490501	490506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017431	CT	3	6	490520	490525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017431	CT	3	6	493799	493804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017431	CT	3	6	494317	494322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017431	TG	3	6	494350	494355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017431	TA	3	6	494463	494468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017431	CT	4	8	503087	503094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.