MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 2696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017431	CA	3	6	592900	592905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_017431	TTC	2	6	595079	595084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017431	CTTC	2	8	595086	595093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017431	CA	3	6	596807	596812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_017431	CAAA	2	8	596928	596935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_017431	GGC	2	6	596936	596941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017431	CA	3	6	596973	596978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_017431	GAA	2	6	597073	597078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017431	A	6	6	597169	597174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017431	A	6	6	597216	597221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017431	ACCT	2	8	598127	598134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_017431	TACA	2	8	598149	598156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_017431	AG	3	6	598163	598168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017431	GCA	2	6	598210	598215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017431	A	6	6	598249	598254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017431	TAT	2	6	601427	601432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017431	T	12	12	601435	601446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017431	AGCA	2	8	601447	601454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_017431	A	6	6	601464	601469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017431	TAC	2	6	601471	601476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017431	GA	3	6	603163	603168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017431	TAG	2	6	603766	603771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017431	AGA	2	6	603781	603786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017431	GGA	2	6	603804	603809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017431	TTC	2	6	605775	605780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017431	CTTC	2	8	605794	605801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_017431	CTAC	2	8	605836	605843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017431	TAGGGG	2	12	605905	605916	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017431	TA	3	6	606075	606080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017431	AGA	2	6	606112	606117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017431	CCA	2	6	606129	606134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_017431	TTA	2	6	606162	606167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017431	TC	3	6	606177	606182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017431	TCT	2	6	606269	606274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017431	CTT	2	6	606285	606290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017431	CAA	2	6	606293	606298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017431	TTGC	2	8	606380	606387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_017431	CCT	2	6	606410	606415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_017431	CT	3	6	606768	606773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_017431	A	6	6	607270	607275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017431	TTC	2	6	608021	608026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017431	T	6	6	608057	608062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017431	A	9	9	608099	608107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017431	T	8	8	611217	611224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017431	ACC	2	6	611239	611244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017431	ACT	2	6	611270	611275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017431	TC	3	6	611293	611298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_017431	ATT	2	6	611300	611305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017431	AC	3	6	611317	611322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_017431	ATCC	2	8	611337	611344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_017431	CGC	2	6	611350	611355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_017431	CT	3	6	611373	611378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_017431	TCT	2	6	611398	611403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017431	GAC	2	6	611435	611440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017431	TAC	2	6	611443	611448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017431	ATG	2	6	611460	611465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017431	A	6	6	611495	611500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017431	AC	3	6	611568	611573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_017431	CTC	2	6	616709	616714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_017431	A	6	6	616808	616813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017431	CT	3	6	616822	616827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_017431	AG	3	6	616864	616869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017431	A	6	6	616877	616882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017431	GGAA	2	8	616892	616899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017431	A	7	7	616904	616910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017431	TATT	2	8	617804	617811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017431	TAA	2	6	617813	617818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017431	AAAT	2	8	617836	617843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017431	T	7	7	617843	617849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017431	TCTTTT	2	12	617890	617901	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1571	NC_017431	T	6	6	617898	617903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017431	ATG	2	6	617904	617909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017431	TTA	2	6	617918	617923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017431	CTT	2	6	618915	618920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017431	T	6	6	620420	620425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017431	CAG	2	6	620463	620468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_017431	T	7	7	621816	621822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017431	T	6	6	621827	621832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017431	GTT	2	6	621846	621851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017431	T	6	6	621862	621867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017431	TTCT	2	8	621877	621884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_017431	TCT	2	6	623488	623493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017431	GAT	2	6	623539	623544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017431	T	6	6	623572	623577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017431	TAAG	2	8	624857	624864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_017431	GATT	2	8	624980	624987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017431	TTC	2	6	628614	628619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017431	T	6	6	628639	628644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017431	CCT	2	6	628645	628650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_017431	T	6	6	629264	629269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017431	CT	3	6	629349	629354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_017431	CTTC	2	8	629390	629397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1598	NC_017431	GTGA	2	8	631864	631871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017431	TCT	2	6	633717	633722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017431	AT	3	6	633741	633746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017431	A	11	11	633749	633759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017431	T	6	6	633783	633788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017431	A	8	8	636765	636772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017431	T	6	6	636783	636788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017431	GGAG	2	8	636789	636796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017431	TTC	2	6	636797	636802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017431	TTG	2	6	636823	636828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017431	T	7	7	637296	637302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017431	ATTAA	2	10	637309	637318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017431	A	6	6	637363	637368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017431	T	8	8	639675	639682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017431	TTC	2	6	639686	639691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017431	CCT	2	6	639700	639705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1617	NC_017431	A	8	8	645945	645952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017431	A	8	8	645964	645971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017431	T	7	7	645984	645990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017431	A	6	6	645994	645999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017431	A	7	7	646001	646007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017431	GA	3	6	648877	648882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017431	GA	3	6	648889	648894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017431	AGG	2	6	648921	648926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017431	CCT	2	6	648935	648940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_017431	A	7	7	648945	648951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017431	AC	3	6	648965	648970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017431	GCT	2	6	648971	648976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017431	TTA	2	6	649015	649020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017431	ATTA	2	8	649046	649053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017431	TAG	2	6	649089	649094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017431	TTATTT	2	12	649102	649113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017431	T	7	7	649111	649117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017431	TCGTC	2	10	650206	650215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1635	NC_017431	AGA	2	6	650233	650238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017431	T	6	6	651716	651721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017431	GT	3	6	651732	651737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017431	CTTT	2	8	653063	653070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1639	NC_017431	AAC	2	6	654156	654161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1641	NC_017431	A	7	7	654186	654192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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