MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 2696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017431	T	6	6	182289	182294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017431	T	7	7	182296	182302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017431	AAAG	2	8	182348	182355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017431	ACT	2	6	182908	182913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017431	TAG	2	6	182942	182947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017431	GCA	2	6	182997	183002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017431	TCGC	2	8	183040	183047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017431	AGA	2	6	183051	183056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017431	GCA	2	6	183060	183065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017431	GAA	2	6	183088	183093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017431	AGA	2	6	183127	183132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017431	GA	3	6	183269	183274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017431	GTT	2	6	183280	183285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017431	GAG	2	6	183301	183306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017431	GAA	2	6	183321	183326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017431	TTG	2	6	183332	183337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017431	AGG	2	6	183371	183376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017431	AGA	2	6	183467	183472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017431	TGA	2	6	183489	183494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017431	CAG	3	9	183562	183570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017431	GTA	2	6	183605	183610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017431	GTTG	2	8	183645	183652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017431	GGA	3	9	183660	183668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017431	TC	3	6	183676	183681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017431	ATT	2	6	183695	183700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017431	A	7	7	183725	183731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017431	T	8	8	183737	183744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017431	ATA	2	6	183787	183792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017431	A	6	6	183792	183797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017431	TAT	2	6	183868	183873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017431	GA	3	6	183908	183913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017431	GTT	2	6	185230	185235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017431	GTT	4	12	185628	185639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017431	T	6	6	185645	185650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017431	T	7	7	185653	185659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017431	T	6	6	185665	185670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017431	T	7	7	185715	185721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017431	A	7	7	185737	185743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017431	T	6	6	185760	185765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017431	ATC	2	6	187455	187460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017431	CGATA	2	10	187483	187492	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_017431	T	6	6	187496	187501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017431	TCC	2	6	187516	187521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017431	ACA	3	9	187522	187530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017431	AGT	2	6	187540	187545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017431	AAAC	2	8	187565	187572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_017431	TGC	2	6	187631	187636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017431	AGT	2	6	187699	187704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017431	AGT	2	6	187722	187727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017431	TTG	2	6	187730	187735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017431	TAT	2	6	187810	187815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017431	T	6	6	187829	187834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017431	GCA	2	6	187882	187887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017431	CTT	2	6	187897	187902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017431	GGAC	2	8	187924	187931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017431	AAG	2	6	188034	188039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017431	TTG	2	6	188056	188061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017431	CAT	2	6	188066	188071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017431	T	7	7	188105	188111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017431	TAA	2	6	188184	188189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017431	TTG	2	6	188212	188217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017431	CTC	2	6	188287	188292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017431	CAC	2	6	188333	188338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017431	TAC	2	6	188414	188419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017431	CAT	2	6	188430	188435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017431	CTC	2	6	188646	188651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_017431	TTA	2	6	188670	188675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017431	AT	3	6	192365	192370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017431	TGT	2	6	192379	192384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017431	AAG	2	6	192927	192932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017431	T	6	6	192977	192982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017431	ATT	2	6	192990	192995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017431	T	6	6	193006	193011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017431	TATGAA	2	12	194982	194993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017431	AGA	2	6	195038	195043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017431	AAC	2	6	195045	195050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017431	ATA	2	6	195065	195070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017431	T	7	7	195090	195096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017431	TGA	2	6	195200	195205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017431	CTC	2	6	196280	196285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_017431	GGA	2	6	196336	196341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017431	A	7	7	197120	197126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017431	AG	3	6	197142	197147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017431	AAT	2	6	197152	197157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017431	T	9	9	197172	197180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017431	T	6	6	197219	197224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017431	TAC	2	6	197263	197268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017431	ATT	2	6	197272	197277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017431	A	8	8	200067	200074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017431	CTT	2	6	200106	200111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017431	A	8	8	200116	200123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017431	TC	3	6	200134	200139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017431	CTT	2	6	200143	200148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017431	A	6	6	201912	201917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017431	AG	3	6	201966	201971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017431	TGC	2	6	202020	202025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017431	AGG	2	6	202041	202046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017431	ACGA	2	8	202753	202760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_017431	CTAAG	2	10	202919	202928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_017431	T	6	6	203026	203031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017431	GAAA	2	8	203038	203045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017431	A	7	7	203043	203049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017431	T	6	6	203817	203822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017431	TAAA	2	8	203839	203846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017431	CT	3	6	203892	203897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_017431	AAT	2	6	203939	203944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017431	TAG	2	6	203975	203980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017431	AAT	2	6	203988	203993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017431	AAG	2	6	204086	204091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017431	CTT	2	6	204097	204102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017431	GA	4	8	206953	206960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017431	T	7	7	206983	206989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017431	CT	4	8	207001	207008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_017431	A	6	6	207010	207015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017431	CCTT	2	8	216175	216182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017431	TTG	2	6	216201	216206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017431	A	6	6	216213	216218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017431	A	7	7	218205	218211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017431	TAA	2	6	218212	218217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017431	AG	4	8	218237	218244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017431	A	6	6	218262	218267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017431	CA	3	6	218296	218301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_017431	TTC	2	6	219748	219753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017431	TA	3	6	219791	219796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017431	GTC	2	6	219810	219815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017431	CTAT	2	8	219865	219872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_017431	T	6	6	219881	219886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017431	ATT	2	6	219983	219988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017431	TCT	2	6	220009	220014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017431	GTC	2	6	220037	220042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017431	TCC	2	6	220061	220066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017431	ATG	2	6	220084	220089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017431	GCAA	2	8	220109	220116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_017431	TTTTAC	2	12	221267	221278	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
635	NC_017431	A	7	7	221329	221335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017431	TAA	2	6	221383	221388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017431	ATTTC	2	10	221410	221419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
638	NC_017431	CT	3	6	221431	221436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_017431	AATT	2	8	221443	221450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017431	CTTG	2	8	221792	221799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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