MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017430	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017430	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017430	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017430	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017430	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017430	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017430	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017430	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017430	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017430	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017430	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017430	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017430	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017430	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017430	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017430	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017430	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017430	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017430	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017430	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017430	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017430	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017430	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017430	GA	3	6	55616	55621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017430	CT	3	6	56514	56519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017430	GT	3	6	56564	56569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017430	TG	3	6	57271	57276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017430	CT	3	6	58152	58157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017430	GA	3	6	60832	60837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017430	AG	4	8	64857	64864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017430	TA	3	6	69188	69193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017430	CT	3	6	71924	71929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017430	TA	3	6	85371	85376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017430	TC	3	6	90592	90597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017430	GA	3	6	90724	90729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017430	CT	3	6	93074	93079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017430	GA	3	6	93560	93565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017430	GA	3	6	93602	93607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017430	TA	3	6	94219	94224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017430	TC	3	6	100100	100105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017430	AT	3	6	100151	100156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017430	GA	3	6	100428	100433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017430	AG	3	6	100564	100569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017430	GA	3	6	101219	101224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017430	AG	3	6	101289	101294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017430	AC	3	6	101371	101376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017430	TC	3	6	101399	101404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017430	GA	3	6	101445	101450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017430	GA	3	6	101691	101696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017430	TA	3	6	106826	106831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017430	TG	3	6	116068	116073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017430	CA	3	6	117986	117991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017430	AG	4	8	118654	118661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017430	GA	3	6	120476	120481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017430	TA	3	6	122711	122716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017430	GT	3	6	123700	123705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017430	CT	3	6	128234	128239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017430	TC	3	6	130556	130561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017430	AG	3	6	130633	130638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017430	AG	3	6	130658	130663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017430	TG	3	6	133465	133470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017430	GA	3	6	138383	138388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017430	AT	3	6	142615	142620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017430	GA	3	6	151852	151857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017430	AG	3	6	157417	157422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017430	TC	3	6	171881	171886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017430	AG	3	6	172013	172018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017430	CT	3	6	172031	172036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017430	TG	3	6	178522	178527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017430	GA	3	6	183308	183313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017430	TC	3	6	183715	183720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017430	GA	3	6	183947	183952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017430	AT	3	6	192404	192409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017430	AG	3	6	196873	196878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017430	TC	3	6	199865	199870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017430	AG	3	6	201697	201702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017430	CT	3	6	201709	201714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017430	CT	3	6	203623	203628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017430	GA	4	8	206682	206689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017430	CT	4	8	206730	206737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017430	AG	4	8	218002	218009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017430	TA	3	6	219556	219561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017430	CT	3	6	221196	221201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017430	TC	3	6	224197	224202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017430	AG	3	6	224228	224233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017430	TC	3	6	238428	238433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017430	AG	3	6	238454	238459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017430	CA	3	6	243378	243383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017430	GT	3	6	243595	243600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017430	GA	3	6	250463	250468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017430	TG	3	6	250573	250578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017430	AG	3	6	251375	251380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017430	AG	3	6	251400	251405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017430	AG	3	6	252383	252388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017430	TA	3	6	254189	254194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017430	AG	3	6	256479	256484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017430	TC	3	6	256505	256510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017430	AG	3	6	257983	257988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017430	TA	3	6	264346	264351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017430	CA	3	6	266153	266158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017430	TC	3	6	268053	268058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017430	TA	3	6	273606	273611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017430	AT	4	8	284166	284173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017430	CT	3	6	285018	285023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017430	TC	4	8	285109	285116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017430	TC	3	6	286800	286805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017430	TC	3	6	286857	286862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017430	CT	3	6	287330	287335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017430	AT	3	6	299346	299351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017430	CA	3	6	301675	301680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017430	GA	3	6	306406	306411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017430	AG	3	6	315612	315617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017430	CT	3	6	347567	347572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017430	CT	3	6	350638	350643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017430	TC	3	6	354864	354869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017430	TC	3	6	358694	358699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017430	CT	3	6	358780	358785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017430	AC	3	6	362113	362118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017430	GA	3	6	364023	364028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017430	TC	3	6	364101	364106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017430	TA	3	6	364302	364307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017430	CT	4	8	381331	381338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017430	CG	3	6	391169	391174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017430	CA	3	6	392219	392224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017430	TC	3	6	394766	394771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017430	CT	3	6	395256	395261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017430	GA	3	6	395386	395391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017430	GA	3	6	395517	395522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017430	CT	3	6	410600	410605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017430	CT	3	6	429330	429335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017430	CT	3	6	430353	430358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017430	AG	3	6	430700	430705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017430	GA	3	6	432395	432400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017430	AC	3	6	436393	436398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017430	CT	3	6	440664	440669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017430	AC	3	6	440702	440707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017430	CA	3	6	443171	443176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017430	CT	3	6	444575	444580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017430	CT	3	6	453857	453862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017430	AG	3	6	459998	460003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017430	TC	3	6	466536	466541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017430	AT	3	6	466605	466610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017430	GA	4	8	467979	467986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017430	TA	3	6	468022	468027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017430	GA	3	6	468120	468125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017430	TC	3	6	479852	479857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017430	AC	3	6	485383	485388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017430	GA	4	8	485428	485435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017430	CA	3	6	485465	485470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017430	TC	3	6	485506	485511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017430	AC	3	6	489941	489946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017430	AG	3	6	490103	490108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017430	CT	3	6	490122	490127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.