MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017430	TATGGA	2	12	813	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017430	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017430	TAAAGA	2	12	48966	48977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017430	GAAAAG	2	12	56392	56403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017430	AGTTGT	2	12	57743	57754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017430	TTGTTC	2	12	58663	58674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017430	AAAAAT	2	12	60967	60978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017430	ATCTAG	2	12	76782	76793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017430	TTTTAG	2	12	116052	116063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017430	TAAAAA	2	12	120648	120659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017430	AGAAAA	2	12	182249	182260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017430	TATGAA	2	12	195021	195032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017430	TTTTAC	2	12	221032	221043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017430	AACCCT	2	12	254748	254759	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017430	ATTTTT	2	12	255552	255563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017430	AGGAGA	2	12	270654	270665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017430	ATATTA	2	12	279552	279563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017430	AAAAAG	2	12	323711	323722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017430	AGAATA	2	12	361189	361200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017430	TTTTAA	2	12	409236	409247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017430	TAACTA	2	12	502764	502775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017430	AAGAAA	2	12	502777	502788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017430	AGAATA	2	12	508752	508763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017430	AACTAA	2	12	514485	514496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017430	TCCCTC	2	12	548136	548147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017430	AAAAAT	2	12	566109	566120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017430	TAGGGG	2	12	605275	605286	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017430	TCTTTT	2	12	617270	617281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017430	TTATTT	2	12	648480	648491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017430	TATTTT	2	12	754419	754430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017430	GAGAAA	2	12	801884	801895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017430	TTTTCT	2	12	804342	804353	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017430	ATTTTT	2	12	808121	808132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017430	TTTTTA	2	12	834558	834569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017430	TAAGGA	2	12	855522	855533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017430	CCGGAG	2	12	856440	856451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017430	CCTCTA	2	12	869586	869597	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017430	TAAGGA	2	12	877565	877576	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017430	CCGGAG	2	12	878483	878494	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017430	GACGGC	2	12	920912	920923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017430	AAACAA	2	12	922600	922611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017430	TTGTAA	2	12	1014109	1014120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017430	ATTTTT	2	12	1038088	1038099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017430	TAAAAT	2	12	1041711	1041722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.