MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 2720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017430	CCT	2	6	574006	574011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_017430	AGCA	2	8	574614	574621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_017430	CAA	2	6	574662	574667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017430	A	6	6	574666	574671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017430	CAAA	3	12	574676	574687	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_017430	AG	3	6	574720	574725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017430	CTT	2	6	576502	576507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017430	GAA	2	6	576543	576548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017430	ATT	2	6	576617	576622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017430	AAG	2	6	576639	576644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017430	A	6	6	576666	576671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017430	A	7	7	576702	576708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017430	ATAG	2	8	576733	576740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017430	C	6	6	579292	579297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1515	NC_017430	G	6	6	579313	579318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017430	CT	3	6	579781	579786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_017430	GCAC	2	8	579802	579809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_017430	AAAGG	2	10	581116	581125	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017430	CTC	2	6	581748	581753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_017430	TAT	2	6	581772	581777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017430	A	6	6	581795	581800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017430	CCA	2	6	581875	581880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_017430	ACG	2	6	581892	581897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017430	AAG	2	6	581930	581935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017430	GCAC	2	8	581941	581948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_017430	A	8	8	581987	581994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017430	CT	3	6	585923	585928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017430	CA	3	6	592255	592260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017430	TTC	2	6	594449	594454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017430	CTTC	2	8	594456	594463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_017430	CA	3	6	596177	596182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_017430	CAAA	2	8	596298	596305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_017430	GGC	2	6	596306	596311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017430	CA	3	6	596343	596348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_017430	GAA	2	6	596443	596448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017430	A	6	6	596539	596544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017430	A	6	6	596585	596590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017430	ACCT	2	8	597496	597503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_017430	TACA	2	8	597518	597525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_017430	AG	3	6	597532	597537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017430	GCA	2	6	597579	597584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017430	A	7	7	597618	597624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017430	TAT	2	6	600797	600802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017430	T	12	12	600805	600816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017430	AGCA	2	8	600817	600824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_017430	A	6	6	600834	600839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017430	TAC	2	6	600841	600846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017430	GA	3	6	602533	602538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017430	TAG	2	6	603136	603141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017430	AGA	2	6	603151	603156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017430	GGA	2	6	603174	603179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017430	T	6	6	605117	605122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017430	TTC	2	6	605145	605150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017430	CCT	2	6	605164	605169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_017430	CTAC	2	8	605206	605213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_017430	TAGGGG	2	12	605275	605286	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_017430	AGA	2	6	605482	605487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017430	CCA	2	6	605499	605504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_017430	TTA	2	6	605532	605537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017430	TC	3	6	605547	605552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_017430	TCT	2	6	605639	605644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017430	CTT	2	6	605655	605660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017430	CAA	2	6	605663	605668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017430	TTGC	2	8	605750	605757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_017430	CCT	2	6	605780	605785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_017430	CT	3	6	606138	606143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1570	NC_017430	T	6	6	607427	607432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017430	A	10	10	607480	607489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017430	T	7	7	610599	610605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1574	NC_017430	ACT	2	6	610651	610656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1576	NC_017430	TAT	2	6	610680	610685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_017430	TAC	2	6	610825	610830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017430	ATG	2	6	610842	610847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_017430	AC	3	6	610950	610955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1590	NC_017430	AG	3	6	616244	616249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017430	A	6	6	616257	616262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017430	GGAA	2	8	616272	616279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017430	A	7	7	616284	616290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017430	TTA	2	6	617298	617303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017430	CTT	2	6	618295	618300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017430	T	6	6	619800	619805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017430	CAG	2	6	619843	619848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_017430	CAT	2	6	621723	621728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_017430	GAA	2	6	622049	622054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_017430	TC	3	6	622485	622490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017430	CCG	2	6	622531	622536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_017430	A	7	7	622545	622551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017430	CTTCT	2	10	622553	622562	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1623	NC_017430	CTC	2	6	622571	622576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017430	AAG	2	6	622611	622616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017430	AGA	2	6	622675	622680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1633	NC_017430	TAAG	2	8	624236	624243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017430	A	6	6	624272	624277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017430	AGA	2	6	624285	624290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017430	GATT	2	8	624359	624366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017430	TTC	2	6	627993	627998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_017430	T	6	6	628018	628023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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