MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017429	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017429	GAAAAG	2	12	56311	56322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017429	AGTTGT	2	12	57659	57670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017429	TCTTGT	2	12	58577	58588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017429	AAAAAT	2	12	60882	60893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017429	ATCTAG	2	12	76611	76622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017429	TTTTAG	2	12	115883	115894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017429	TAAAAA	2	12	120479	120490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017429	AGAAAA	2	12	182534	182545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017429	TATGAA	2	12	195342	195353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017429	TTTTAC	2	12	221354	221365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017429	AACCCT	2	12	255071	255082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017429	ATTTTT	2	12	255875	255886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017429	AGGAGA	2	12	270977	270988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017429	ATATTA	2	12	279875	279886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017429	AAAAAG	2	12	324038	324049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017429	AGAATA	2	12	361510	361521	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017429	TTTTAA	2	12	409666	409677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017429	TAACTA	2	12	503195	503206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017429	AAGAAA	2	12	503208	503219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017429	AGAATA	2	12	509183	509194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017429	AACTAA	2	12	514915	514926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017429	TCCCTC	2	12	548579	548590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017429	AAAAAT	2	12	566551	566562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017429	TAGGGG	2	12	605719	605730	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017429	TCTTTT	2	12	617714	617725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017429	TTATTT	2	12	648923	648934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017429	TATTTT	2	12	754869	754880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017429	GAGAAA	2	12	802333	802344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017429	TTTTCT	2	12	804791	804802	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017429	ATTTTT	2	12	808570	808581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017429	TTTTTA	2	12	835008	835019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017429	TAAGGA	2	12	855972	855983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017429	CCGGAG	2	12	856890	856901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017429	CCTCTA	2	12	870036	870047	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017429	TAAGGA	2	12	878018	878029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017429	CCGGAG	2	12	878936	878947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017429	GACGGC	2	12	921367	921378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017429	AAACAA	2	12	923055	923066	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017429	TTGTAA	2	12	1014563	1014574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017429	ATTTTT	2	12	1038542	1038553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017429	TAAAAT	2	12	1042167	1042178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.