MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 1271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017429	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017429	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017429	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017429	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017429	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017429	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017429	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017429	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017429	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017429	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017429	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017429	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017429	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017429	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017429	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017429	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017429	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017429	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017429	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017429	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017429	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017429	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017429	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017429	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017429	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017429	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017429	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017429	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017429	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017429	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017429	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017429	TAG	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017429	CTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017429	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017429	ATT	2	6	13373	13378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017429	AAG	2	6	13390	13395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017429	TTA	2	6	13416	13421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017429	AAG	2	6	13450	13455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017429	AAC	2	6	13534	13539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017429	CTT	2	6	14957	14962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017429	GTT	2	6	17630	17635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017429	GAA	2	6	18374	18379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017429	AAT	3	9	18438	18446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017429	TCT	2	6	18466	18471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017429	CTT	3	9	19892	19900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017429	CCT	2	6	20565	20570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017429	GGA	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017429	AGA	3	9	20651	20659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017429	TGG	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017429	AAC	2	6	20909	20914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017429	AGC	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017429	AGG	2	6	21015	21020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017429	TGA	2	6	21127	21132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017429	TCC	2	6	21244	21249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017429	AAT	2	6	21420	21425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017429	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017429	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017429	TAA	2	6	27880	27885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017429	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017429	CTG	2	6	33121	33126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017429	CTT	2	6	36478	36483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017429	TAA	2	6	38816	38821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017429	AAG	2	6	38857	38862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017429	CTC	2	6	40135	40140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017429	AAG	2	6	40220	40225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017429	GAT	2	6	42676	42681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017429	AAG	2	6	42682	42687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017429	GGA	2	6	42734	42739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017429	TAA	2	6	42832	42837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017429	ACT	2	6	44064	44069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017429	AAG	2	6	45915	45920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017429	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017429	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017429	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017429	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017429	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017429	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017429	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017429	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017429	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017429	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017429	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017429	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017429	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017429	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017429	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017429	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017429	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017429	GAT	2	6	52081	52086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017429	AAG	2	6	52159	52164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017429	AAT	2	6	52186	52191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017429	ATT	2	6	52198	52203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017429	TGG	2	6	55689	55694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017429	TGT	2	6	55731	55736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017429	TCC	2	6	56326	56331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017429	AGT	3	9	56415	56423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017429	GAG	2	6	56446	56451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017429	TGG	2	6	56469	56474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017429	TGT	2	6	56492	56497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017429	AGT	2	6	56502	56507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017429	GAA	2	6	56545	56550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017429	GTT	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017429	AGA	2	6	56821	56826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017429	CAG	2	6	56984	56989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017429	TTG	2	6	57006	57011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017429	TGT	2	6	57084	57089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017429	TAA	2	6	57252	57257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017429	ACT	2	6	57268	57273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017429	TTA	2	6	57274	57279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017429	GAA	3	9	57292	57300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017429	ATT	2	6	57303	57308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017429	ATT	2	6	57322	57327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017429	TAA	2	6	57394	57399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017429	TCC	2	6	57407	57412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017429	TGA	2	6	57463	57468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017429	TGT	2	6	57493	57498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017429	GGA	2	6	57500	57505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017429	GTT	2	6	57506	57511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017429	GCT	2	6	57545	57550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017429	GAT	2	6	57563	57568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017429	TGA	2	6	57580	57585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017429	TCC	2	6	57595	57600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017429	AGA	2	6	57730	57735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017429	CTA	2	6	57746	57751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017429	TGT	2	6	57988	57993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017429	GTT	2	6	58077	58082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017429	CAC	2	6	58210	58215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017429	AGG	2	6	58261	58266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017429	TCT	2	6	58277	58282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017429	CAA	2	6	58458	58463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017429	GCT	2	6	58487	58492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017429	TGC	2	6	58513	58518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017429	ATC	2	6	58525	58530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017429	TGT	2	6	58560	58565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017429	CTT	2	6	58617	58622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017429	TTC	2	6	58648	58653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017429	TGG	2	6	58674	58679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017429	TCC	2	6	58735	58740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017429	TGT	2	6	58895	58900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_017429	AAG	2	6	60822	60827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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