MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 2670

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017429	T	6	6	995842	995847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_017429	TA	3	6	996365	996370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017429	TGA	2	6	997313	997318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017429	TAT	2	6	997326	997331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_017429	CCTT	2	8	997356	997363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_017429	A	6	6	998970	998975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_017429	T	7	7	998976	998982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_017429	T	7	7	998985	998991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017429	T	6	6	998993	998998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_017429	TC	3	6	999014	999019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_017429	TAA	2	6	999022	999027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017429	ATA	2	6	999030	999035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_017429	CTTT	2	8	999070	999077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_017429	GA	3	6	999095	999100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_017429	TCT	2	6	999115	999120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_017429	TTC	2	6	999151	999156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_017429	GGAA	2	8	999172	999179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_017429	GGA	2	6	999185	999190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_017429	ATT	2	6	999200	999205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_017429	A	6	6	999474	999479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_017429	CTAT	2	8	1001572	1001579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_017429	AGA	2	6	1001588	1001593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_017429	TGG	2	6	1002848	1002853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_017429	AAG	2	6	1002865	1002870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_017429	CA	3	6	1002913	1002918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_017429	TAA	2	6	1002952	1002957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_017429	T	8	8	1002977	1002984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_017429	A	6	6	1004801	1004806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_017429	GAAG	2	8	1004816	1004823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_017429	AG	3	6	1004836	1004841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_017429	CGCC	2	8	1006255	1006262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2532	NC_017429	CGGGG	2	10	1006278	1006287	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2533	NC_017429	CTG	2	6	1008026	1008031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_017429	AG	3	6	1008085	1008090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_017429	CT	3	6	1008099	1008104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_017429	AGT	2	6	1008165	1008170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_017429	TCA	2	6	1008182	1008187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_017429	GAG	2	6	1008255	1008260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_017429	G	7	7	1008260	1008266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_017429	CAA	2	6	1008300	1008305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_017429	AG	3	6	1008388	1008393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_017429	T	6	6	1008414	1008419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_017429	AAG	2	6	1008420	1008425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_017429	TATTT	2	10	1008437	1008446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_017429	GTG	2	6	1008464	1008469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017429	T	6	6	1008482	1008487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_017429	GAT	2	6	1008539	1008544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_017429	CTT	2	6	1008579	1008584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_017429	CTGT	2	8	1008652	1008659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_017429	TA	3	6	1008669	1008674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_017429	ATT	2	6	1008699	1008704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_017429	TAA	2	6	1010084	1010089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_017429	TTG	2	6	1012018	1012023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017429	TAA	2	6	1012035	1012040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017429	TTGTAA	2	12	1014563	1014574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017429	GTT	2	6	1014586	1014591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017429	GTT	2	6	1014619	1014624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_017429	A	6	6	1014633	1014638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017429	TTA	2	6	1014658	1014663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_017429	T	6	6	1014703	1014708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_017429	CAAGC	2	10	1014746	1014755	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_017429	T	9	9	1014898	1014906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_017429	ATG	2	6	1015035	1015040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017429	GAT	2	6	1015070	1015075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_017429	CGA	2	6	1015081	1015086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_017429	CAA	2	6	1015129	1015134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_017429	AGA	2	6	1015270	1015275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_017429	GGT	2	6	1015287	1015292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_017429	ATG	2	6	1015293	1015298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_017429	AAC	2	6	1015304	1015309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_017429	TCT	2	6	1015328	1015333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_017429	TCT	2	6	1015368	1015373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_017429	AGG	2	6	1015421	1015426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_017429	TCT	2	6	1015473	1015478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_017429	T	8	8	1015478	1015485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_017429	CTAT	2	8	1015530	1015537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_017429	TTC	2	6	1015538	1015543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_017429	GA	3	6	1015571	1015576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_017429	GAA	2	6	1015609	1015614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_017429	GAA	2	6	1015641	1015646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_017429	TGA	2	6	1015679	1015684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_017429	A	6	6	1015738	1015743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_017429	TGT	2	6	1015760	1015765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_017429	AAG	2	6	1015912	1015917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_017429	TCTG	2	8	1015959	1015966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2586	NC_017429	GA	4	8	1016002	1016009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017429	ATA	2	6	1016043	1016048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017429	AGG	2	6	1018073	1018078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017429	GCA	2	6	1018127	1018132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_017429	AT	3	6	1018153	1018158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017429	AGG	2	6	1018163	1018168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_017429	CAT	2	6	1018179	1018184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_017429	GTA	2	6	1018205	1018210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_017429	GAA	2	6	1018218	1018223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_017429	T	8	8	1018263	1018270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017429	AGA	2	6	1018322	1018327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017429	AGA	2	6	1018337	1018342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_017429	GGT	2	6	1018411	1018416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_017429	TCT	2	6	1018506	1018511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_017429	GT	3	6	1018526	1018531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_017429	T	6	6	1018557	1018562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_017429	TTA	2	6	1019806	1019811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_017429	T	6	6	1019842	1019847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_017429	TAGAA	2	10	1019865	1019874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_017429	TCC	2	6	1019886	1019891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_017429	AGG	2	6	1019925	1019930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_017429	ATA	2	6	1019942	1019947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_017429	GAAA	2	8	1019989	1019996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_017429	GAT	2	6	1019997	1020002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_017429	TTA	2	6	1024314	1024319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_017429	AAT	2	6	1024328	1024333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_017429	AAAC	2	8	1024373	1024380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_017429	TTA	2	6	1024396	1024401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017429	A	7	7	1024407	1024413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_017429	CTG	2	6	1024422	1024427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_017429	TC	3	6	1024474	1024479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2617	NC_017429	TTAA	2	8	1025773	1025780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_017429	AAAG	2	8	1025787	1025794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_017429	AT	3	6	1025796	1025801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_017429	T	6	6	1025818	1025823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_017429	ATT	2	6	1031976	1031981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_017429	AG	3	6	1031993	1031998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_017429	ATT	2	6	1032042	1032047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_017429	T	6	6	1032050	1032055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_017429	TAAT	2	8	1032067	1032074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_017429	TC	3	6	1032079	1032084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_017429	TG	3	6	1032091	1032096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_017429	TTTTC	2	10	1038233	1038242	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2629	NC_017429	GTT	2	6	1038293	1038298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_017429	GAT	2	6	1038309	1038314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_017429	A	6	6	1038336	1038341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_017429	CT	3	6	1038349	1038354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_017429	AG	3	6	1038363	1038368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_017429	CAAA	2	8	1038388	1038395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_017429	T	8	8	1038405	1038412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_017429	A	6	6	1038416	1038421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_017429	AAG	2	6	1038500	1038505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_017429	TGG	2	6	1038534	1038539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_017429	ATTTTT	2	12	1038542	1038553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_017429	AAT	2	6	1038554	1038559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_017429	A	6	6	1038560	1038565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_017429	TTA	2	6	1038598	1038603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_017429	T	6	6	1038615	1038620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_017429	TAC	2	6	1038666	1038671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2645	NC_017429	CA	3	6	1038766	1038771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2646	NC_017429	AGA	2	6	1038802	1038807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_017429	TCA	2	6	1038810	1038815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2648	NC_017429	A	8	8	1039224	1039231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_017429	AG	4	8	1039243	1039250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_017429	A	6	6	1042104	1042109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_017429	AAT	2	6	1042113	1042118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_017429	TATT	2	8	1042135	1042142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_017429	T	7	7	1042148	1042154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_017429	TAAAAT	2	12	1042167	1042178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_017429	TTTTA	2	10	1042183	1042192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2656	NC_017429	GGTT	2	8	1042199	1042206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_017429	AGG	2	6	1042228	1042233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_017429	TCT	2	6	1042253	1042258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_017429	GGAT	2	8	1042267	1042274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_017429	TAA	3	9	1042303	1042311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_017429	GTA	2	6	1042347	1042352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2662	NC_017429	AGT	2	6	1042378	1042383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_017429	GA	3	6	1042422	1042427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_017429	AAG	2	6	1042534	1042539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_017429	CAA	2	6	1042548	1042553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2666	NC_017429	AGT	2	6	1042574	1042579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_017429	GTG	2	6	1042590	1042595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_017429	CAG	2	6	1042626	1042631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2669	NC_017429	AGTG	2	8	1042757	1042764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2670	NC_017429	TGGC	2	8	1042791	1042798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.