MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 2670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017429	TTC	2	6	594892	594897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017429	CTTC	2	8	594899	594906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_017429	CA	3	6	596620	596625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017429	CAAA	2	8	596741	596748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_017429	GGC	2	6	596749	596754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017429	TA	3	6	596768	596773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017429	CA	3	6	596786	596791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_017429	GAA	2	6	596886	596891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017429	A	6	6	596982	596987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017429	A	6	6	597029	597034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017429	ACCT	2	8	597940	597947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_017429	TACA	2	8	597962	597969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_017429	AG	3	6	597976	597981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017429	GCA	2	6	598023	598028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017429	A	7	7	598062	598068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017429	TAT	2	6	601241	601246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017429	T	12	12	601249	601260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017429	AGCA	2	8	601261	601268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_017429	A	6	6	601278	601283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017429	TAC	2	6	601285	601290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017429	GA	3	6	602977	602982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017429	TAG	2	6	603580	603585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017429	AGA	2	6	603595	603600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017429	GGA	2	6	603618	603623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017429	T	6	6	605561	605566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017429	TTC	2	6	605589	605594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017429	CCT	2	6	605608	605613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1529	NC_017429	TAGGGG	2	12	605719	605730	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1531	NC_017429	AGA	2	6	605926	605931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017429	CCA	2	6	605943	605948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_017429	TTA	2	6	605976	605981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017429	TC	3	6	605991	605996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_017429	TCT	2	6	606083	606088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1537	NC_017429	CAA	2	6	606107	606112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1539	NC_017429	CCT	2	6	606224	606229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1544	NC_017429	A	10	10	607924	607933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017429	T	7	7	611043	611049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_017429	TAT	2	6	611124	611129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017429	AC	3	6	611142	611147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_017429	ATCC	2	8	611162	611169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_017429	CGC	2	6	611176	611181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_017429	CT	3	6	611199	611204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017429	TCT	2	6	611224	611229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017429	GAC	2	6	611261	611266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017429	TAC	2	6	611269	611274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1562	NC_017429	CT	3	6	616646	616651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_017429	AG	3	6	616688	616693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017429	A	6	6	616701	616706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017429	GGAA	2	8	616716	616723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017429	A	7	7	616728	616734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017429	TATT	2	8	617628	617635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_017429	ATG	2	6	617728	617733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017429	TTA	2	6	617742	617747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017429	CTT	2	6	618739	618744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_017429	CCG	2	6	622975	622980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1599	NC_017429	AAG	2	6	623175	623180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_017429	GAT	2	6	623362	623367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017429	T	6	6	623395	623400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017429	TAAG	2	8	624680	624687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017429	A	6	6	624716	624721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017429	AGA	2	6	624729	624734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017429	GATT	2	8	624803	624810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_017429	CT	3	6	629171	629176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_017429	TTTCC	2	10	629177	629186	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_017429	CTTC	2	8	629212	629219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1621	NC_017429	AT	3	6	633563	633568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017429	A	9	9	633571	633579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017429	T	6	6	633603	633608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_017429	CTCC	2	8	636596	636603	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1626	NC_017429	A	6	6	636604	636609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_017429	ATTAA	2	10	637129	637138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017429	A	6	6	637183	637188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017429	T	8	8	639495	639502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_017429	CCT	2	6	640710	640715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1637	NC_017429	A	6	6	645733	645738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017429	A	8	8	645765	645772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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