MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans 809 chromosome

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017317	CAGTA	2	10	14694	14703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017317	CTTTT	2	10	26968	26977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017317	GACAC	2	10	28060	28069	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017317	ATTTT	2	10	39354	39363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017317	CTCTT	2	10	44574	44583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017317	CATCA	2	10	62692	62701	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017317	TGAGG	2	10	79171	79180	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017317	CATGT	2	10	125425	125434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017317	AAAAT	2	10	128409	128418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017317	TAATT	2	10	130193	130202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017317	TGATG	2	10	184601	184610	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017317	TGTAG	2	10	189503	189512	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017317	TTAGA	2	10	191074	191083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017317	GAAGT	2	10	211508	211517	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017317	GTACC	2	10	217271	217280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017317	TAAGG	2	10	218227	218236	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017317	GCATA	2	10	227414	227423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017317	ATTTT	2	10	235784	235793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017317	TAATA	2	10	253236	253245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017317	GGCGG	2	10	272101	272110	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017317	TGCGC	2	10	278987	278996	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017317	GAAAA	2	10	288824	288833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017317	ATAAA	2	10	289299	289308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017317	AGTTC	2	10	289781	289790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017317	CGAGA	2	10	290146	290155	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017317	TGCGT	2	10	306213	306222	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017317	AAATA	2	10	345976	345985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017317	CACAC	2	10	390335	390344	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017317	GTTTT	2	10	396412	396421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017317	AAAAG	2	10	413656	413665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017317	TTCAC	2	10	427755	427764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017317	AGGGG	2	10	437461	437470	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017317	GGAAA	2	10	451374	451383	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017317	TTTGG	2	10	451862	451871	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017317	GAAAA	2	10	456170	456179	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017317	AAGAA	2	10	457726	457735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017317	GCGTT	2	10	471968	471977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017317	AGGAA	2	10	479756	479765	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017317	TTAGA	2	10	482203	482212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017317	AGGAA	2	10	484665	484674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017317	TCAAC	2	10	501121	501130	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017317	CGTAG	2	10	513891	513900	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017317	TGCCT	2	10	542911	542920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017317	ATTTT	2	10	551299	551308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017317	ACGCA	2	10	566180	566189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017317	AGGGG	2	10	576550	576559	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017317	CGCGG	2	10	582571	582580	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017317	CTTCT	2	10	590746	590755	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017317	CTGGA	2	10	610849	610858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017317	AAAAT	2	10	612004	612013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017317	CGTTG	2	10	624567	624576	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017317	AATGC	2	10	632428	632437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017317	ACCAG	2	10	658525	658534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017317	TTGGG	2	10	665893	665902	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017317	CATTT	2	10	667877	667886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017317	GAGGG	2	10	680747	680756	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017317	TGTGG	2	10	690561	690570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017317	TCGTG	2	10	691839	691848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017317	CGTCA	2	10	692175	692184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017317	GTTGT	2	10	692600	692609	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017317	GGGAG	2	10	693266	693275	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017317	TGACA	2	10	695863	695872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017317	GCGAA	2	10	696192	696201	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017317	TGGGG	2	10	713023	713032	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017317	CTCTT	2	10	718070	718079	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017317	GTGAA	2	10	718116	718125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017317	CTGTG	2	10	719194	719203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017317	GGGGT	2	10	720266	720275	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017317	TCAAA	2	10	732853	732862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017317	ATAAG	2	10	737980	737989	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017317	AAAAC	2	10	757048	757057	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017317	GTTTT	2	10	762098	762107	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017317	TGGGG	2	10	762173	762182	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017317	GCCTC	2	10	774702	774711	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017317	GGGAA	2	10	806672	806681	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017317	TTTTC	2	10	806973	806982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017317	AAAAG	2	10	829563	829572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017317	TAGGT	2	10	834372	834381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017317	GTTTT	2	10	848565	848574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017317	CACCC	2	10	863487	863496	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_017317	GGCTG	2	10	874745	874754	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017317	GAATC	2	10	894829	894838	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017317	CAGCG	2	10	927793	927802	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017317	TTTCC	2	10	931970	931979	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017317	GAAAG	2	10	932791	932800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017317	AAGGA	2	10	938189	938198	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017317	ATAAG	2	10	953923	953932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017317	GGGCT	2	10	976385	976394	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017317	GCATG	2	10	1004908	1004917	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017317	CTCAT	2	10	1025400	1025409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017317	CGTAA	2	10	1027921	1027930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017317	CGTGA	2	10	1040342	1040351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017317	GCACG	2	10	1044204	1044213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017317	CTAGC	2	10	1065140	1065149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017317	CTTTG	2	10	1067600	1067609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017317	AGCAC	2	10	1069706	1069715	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017317	TGGTG	2	10	1084520	1084529	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017317	GAACA	2	10	1088408	1088417	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017317	GGTGC	2	10	1092570	1092579	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017317	CGAGT	2	10	1099052	1099061	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017317	GGAAT	2	10	1100093	1100102	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017317	AAACA	2	10	1104508	1104517	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017317	TGTTT	2	10	1104547	1104556	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017317	TGAAT	2	10	1105317	1105326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017317	ATTCA	2	10	1116513	1116522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017317	TGTGG	2	10	1121417	1121426	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017317	TCGTG	2	10	1122695	1122704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017317	CGTCA	2	10	1123031	1123040	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017317	GTTGT	2	10	1123456	1123465	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017317	GGGAG	2	10	1124122	1124131	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017317	TGACA	2	10	1126721	1126730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017317	TCACA	2	10	1150311	1150320	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017317	GTTTT	2	10	1165874	1165883	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017317	GGAAG	2	10	1181768	1181777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017317	CTGTG	2	10	1182736	1182745	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017317	AAAGT	2	10	1188918	1188927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017317	TTACT	2	10	1198567	1198576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017317	CTGTG	2	10	1202543	1202552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017317	TAACG	2	10	1220511	1220520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017317	CTTAC	2	10	1223666	1223675	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017317	TTAGC	2	10	1223830	1223839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017317	CGGGG	2	10	1229342	1229351	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017317	CAATG	2	10	1248500	1248509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017317	GTTGT	2	10	1248545	1248554	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017317	CCCGG	2	10	1248793	1248802	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017317	TGATC	2	10	1249080	1249089	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017317	AGCTG	2	10	1249097	1249106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017317	CAACC	2	10	1292228	1292237	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017317	CTGTG	2	10	1303351	1303360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017317	TCTTT	2	10	1305612	1305621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017317	GGTTT	2	10	1313089	1313098	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017317	TTCTT	2	10	1315220	1315229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017317	ACCCC	2	10	1348431	1348440	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_017317	ACAAG	2	10	1365631	1365640	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017317	AAAAT	2	10	1377517	1377526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017317	CCATG	2	10	1377710	1377719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017317	TACCG	2	10	1409367	1409376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017317	AAAAG	2	10	1411282	1411291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017317	GACTA	2	10	1411308	1411317	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017317	GAACG	2	10	1439170	1439179	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017317	CCCCA	2	10	1441003	1441012	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_017317	GGGGC	2	10	1481383	1481392	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017317	GCCCC	2	10	1481411	1481420	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
144	NC_017317	CTGTG	2	10	1497020	1497029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017317	TTTCA	2	10	1508010	1508019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_017317	CGTTG	2	10	2501974	2501983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.