MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017308	TTC	2	6	1161654	1161659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017308	ATTC	2	8	1161721	1161728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_017308	AC	3	6	1161740	1161745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_017308	AACC	2	8	1161772	1161779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_017308	ATC	2	6	1161795	1161800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017308	TAA	2	6	1161865	1161870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017308	TTC	2	6	1161871	1161876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017308	CCA	2	6	1161881	1161886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_017308	GTA	2	6	1166664	1166669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017308	AAGG	2	8	1166674	1166681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017308	T	6	6	1166724	1166729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017308	TTA	2	6	1166739	1166744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017308	TCC	2	6	1167722	1167727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_017308	TCA	2	6	1167757	1167762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017308	T	6	6	1167817	1167822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017308	CTT	2	6	1167904	1167909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017308	ATTA	2	8	1167965	1167972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017308	GAA	2	6	1167988	1167993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017308	CTTT	2	8	1168027	1168034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_017308	CAAA	2	8	1168055	1168062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_017308	GGAC	2	8	1168080	1168087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_017308	TCA	2	6	1171385	1171390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017308	AAT	2	6	1171482	1171487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017308	GTAG	2	8	1171494	1171501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017308	TGAA	2	8	1171514	1171521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017308	CAGA	2	8	1174885	1174892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_017308	CAC	2	6	1175248	1175253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017308	AAGCTC	2	12	1178108	1178119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017308	ATG	2	6	1178154	1178159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017308	CTTT	2	8	1178166	1178173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_017308	ACT	2	6	1178198	1178203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017308	ATG	2	6	1179105	1179110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017308	AGA	2	6	1180467	1180472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017308	ATC	2	6	1181529	1181534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017308	GAA	2	6	1181539	1181544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017308	T	6	6	1181644	1181649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017308	ACC	2	6	1181676	1181681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_017308	TGT	2	6	1181713	1181718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017308	CA	3	6	1181747	1181752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_017308	GGA	2	6	1181777	1181782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017308	TTG	2	6	1181810	1181815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017308	AGCT	2	8	1182932	1182939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_017308	ACT	2	6	1182974	1182979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017308	GTT	2	6	1187628	1187633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017308	AGTC	2	8	1187712	1187719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_017308	GCT	2	6	1187732	1187737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017308	GTT	2	6	1187740	1187745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017308	TC	3	6	1187746	1187751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_017308	ACG	2	6	1187797	1187802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017308	GAT	2	6	1189647	1189652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017308	TCC	2	6	1190303	1190308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017308	TGC	2	6	1190331	1190336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017308	AC	3	6	1190372	1190377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_017308	AAG	2	6	1192206	1192211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017308	A	6	6	1192242	1192247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017308	CTT	2	6	1194712	1194717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017308	T	6	6	1195272	1195277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017308	CTGT	2	8	1195317	1195324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_017308	CTTT	2	8	1195351	1195358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_017308	CA	3	6	1195377	1195382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_017308	ACC	2	6	1197464	1197469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_017308	GAA	2	6	1197492	1197497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017308	CTTA	2	8	1198739	1198746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017308	ATA	2	6	1198822	1198827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017308	TAA	2	6	1198842	1198847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017308	GAA	2	6	1198857	1198862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017308	GAA	2	6	1200174	1200179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017308	TG	3	6	1200608	1200613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017308	CTG	2	6	1200629	1200634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017308	TCC	2	6	1201561	1201566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_017308	TAT	2	6	1201578	1201583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017308	TAG	2	6	1210546	1210551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017308	TTG	2	6	1210617	1210622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017308	TCT	2	6	1210669	1210674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017308	CAC	2	6	1210675	1210680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_017308	GAT	2	6	1212738	1212743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017308	TAT	2	6	1212768	1212773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017308	TTC	2	6	1212833	1212838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017308	TAA	2	6	1212915	1212920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017308	CAG	2	6	1212923	1212928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017308	CTT	2	6	1212970	1212975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017308	AAC	2	6	1213019	1213024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017308	ATCA	2	8	1213044	1213051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_017308	TCG	2	6	1213145	1213150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017308	AACT	2	8	1213199	1213206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4087	NC_017308	CTT	2	6	1215715	1215720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017308	TC	3	6	1219800	1219805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_017308	CAG	2	6	1220781	1220786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_017308	CTGAA	2	10	1222565	1222574	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_017308	CA	3	6	1222735	1222740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_017308	TGCGC	2	10	1222854	1222863	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4093	NC_017308	TTG	2	6	1225560	1225565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017308	AGC	2	6	1225596	1225601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017308	CTT	2	6	1225650	1225655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017308	CTA	2	6	1225687	1225692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017308	ATTCC	2	10	1225714	1225723	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4098	NC_017308	AG	3	6	1227183	1227188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017308	AG	3	6	1227213	1227218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017308	TAA	2	6	1227258	1227263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017308	CTC	2	6	1228643	1228648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017308	TGC	2	6	1228659	1228664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017308	CAAA	2	8	1228692	1228699	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_017308	GAT	3	9	1228708	1228716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017308	CG	3	6	1230644	1230649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_017308	CTT	2	6	1230840	1230845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017308	CCT	2	6	1231788	1231793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_017308	CGG	2	6	1231896	1231901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017308	CAT	2	6	1231944	1231949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017308	TCA	2	6	1231982	1231987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017308	AAT	2	6	1232018	1232023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017308	TCG	2	6	1232027	1232032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_017308	TTTG	2	8	1232072	1232079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017308	TCT	2	6	1232111	1232116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017308	CAA	2	6	1232203	1232208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017308	CTT	2	6	1232291	1232296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017308	GCC	2	6	1232372	1232377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_017308	TCA	2	6	1232378	1232383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017308	GAT	2	6	1232392	1232397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017308	ATT	2	6	1232461	1232466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017308	TTG	2	6	1232608	1232613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017308	TCT	2	6	1232627	1232632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017308	AGT	2	6	1232639	1232644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017308	GCA	2	6	1232768	1232773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017308	TAA	2	6	1232781	1232786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017308	TCA	2	6	1232795	1232800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017308	ATG	2	6	1232801	1232806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017308	AC	3	6	1232862	1232867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_017308	TC	3	6	1232952	1232957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_017308	GA	3	6	1232974	1232979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017308	TCT	2	6	1233008	1233013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017308	GCA	2	6	1233047	1233052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017308	CTTT	2	8	1233099	1233106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_017308	TCC	2	6	1233209	1233214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_017308	GCAGA	2	10	1233216	1233225	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4136	NC_017308	TCC	2	6	1233302	1233307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4137	NC_017308	GAG	2	6	1233336	1233341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_017308	GCT	2	6	1233412	1233417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_017308	ACG	2	6	1233420	1233425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_017308	CAA	2	6	1233468	1233473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_017308	TAA	2	6	1233525	1233530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_017308	TCT	2	6	1233538	1233543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_017308	GTT	2	6	1233549	1233554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_017308	AGC	2	6	1233679	1233684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_017308	CTT	2	6	1233822	1233827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4150	NC_017308	GC	3	6	1234051	1234056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4152	NC_017308	GC	3	6	1234139	1234144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_017308	GCA	2	6	1234169	1234174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_017308	TCC	2	6	1234363	1234368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4163	NC_017308	TCAA	2	8	1234420	1234427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4164	NC_017308	GCACG	2	10	1234457	1234466	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4165	NC_017308	CGG	2	6	1234481	1234486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4166	NC_017308	GA	4	8	1234521	1234528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_017308	GTT	2	6	1234532	1234537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4174	NC_017308	ACTT	2	8	1240361	1240368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4175	NC_017308	TGA	2	6	1240417	1240422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4204	NC_017308	CCG	2	6	1248002	1248007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4232	NC_017308	ATCGT	2	10	1259130	1259139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4233	NC_017308	TTG	2	6	1259810	1259815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_017308	GTAT	2	8	1259828	1259835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_017308	CA	3	6	1259836	1259841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4236	NC_017308	A	6	6	1259844	1259849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_017308	CA	3	6	1259907	1259912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4240	NC_017308	ATT	2	6	1259938	1259943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_017308	CA	3	6	1259963	1259968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4242	NC_017308	TC	3	6	1260000	1260005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_017308	CAAGAA	2	12	1260023	1260034	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4244	NC_017308	ACTA	2	8	1260059	1260066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4245	NC_017308	TGG	2	6	1260080	1260085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_017308	GTG	2	6	1260862	1260867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_017308	GCT	2	6	1260945	1260950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_017308	ACG	2	6	1260997	1261002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_017308	T	6	6	1261047	1261052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017308	CTA	2	6	1262013	1262018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_017308	CCCTAT	2	12	1262060	1262071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_017308	TATG	2	8	1262160	1262167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_017308	GTT	2	6	1262174	1262179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_017308	GCA	2	6	1264486	1264491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_017308	ACA	2	6	1264510	1264515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_017308	GA	3	6	1264544	1264549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_017308	GTT	2	6	1264556	1264561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_017308	CGC	2	6	1264613	1264618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4259	NC_017308	TTG	3	9	1265672	1265680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_017308	CTA	2	6	1267328	1267333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_017308	CTTAC	2	10	1269620	1269629	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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