MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017308	CCT	2	6	381484	381489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_017308	AGC	2	6	381499	381504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017308	T	6	6	381519	381524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017308	C	6	6	382354	382359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1505	NC_017308	GTA	2	6	384908	384913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017308	TCGC	2	8	384948	384955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017308	ACTA	2	8	384958	384965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017308	GCA	2	6	384969	384974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017308	A	6	6	385030	385035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017308	GA	3	6	385073	385078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017308	CTTG	2	8	385145	385152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_017308	CTAAAA	2	12	385196	385207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1513	NC_017308	TGG	2	6	385227	385232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017308	GGT	2	6	385238	385243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017308	AG	4	8	385322	385329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017308	G	6	6	385341	385346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017308	T	6	6	385389	385394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017308	AG	3	6	385439	385444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017308	TTTA	2	8	385452	385459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017308	GA	3	6	385475	385480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017308	AGG	2	6	385551	385556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017308	CGAGC	2	10	387443	387452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1523	NC_017308	T	6	6	387507	387512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017308	TGC	2	6	387533	387538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017308	TGA	2	6	387585	387590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017308	GATGC	2	10	387644	387653	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_017308	GCA	2	6	387701	387706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017308	TGAA	2	8	387815	387822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017308	ATTG	2	8	387883	387890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017308	TGC	2	6	387951	387956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017308	GAT	2	6	388014	388019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017308	CATG	2	8	388143	388150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_017308	GAT	2	6	388194	388199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017308	AAG	2	6	388202	388207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017308	GAC	2	6	388294	388299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017308	GGC	2	6	388329	388334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017308	C	6	6	388361	388366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1538	NC_017308	AGT	2	6	388370	388375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017308	T	7	7	388382	388388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017308	GCTG	2	8	388450	388457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_017308	TAT	2	6	388486	388491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017308	TG	3	6	388574	388579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017308	TCT	2	6	388588	388593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017308	C	6	6	388648	388653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1545	NC_017308	TTTC	2	8	388656	388663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_017308	CATC	2	8	388736	388743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_017308	CCG	2	6	388777	388782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_017308	CAG	2	6	388812	388817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017308	CAC	2	6	388828	388833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_017308	ATA	2	6	388899	388904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017308	CGCCCG	2	12	388926	388937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_017308	GTG	2	6	388944	388949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017308	T	6	6	388991	388996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017308	TTA	2	6	389007	389012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017308	TGG	2	6	389085	389090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017308	TCG	2	6	389243	389248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017308	TAT	2	6	389265	389270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017308	TGC	2	6	389445	389450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017308	CTCCG	2	10	389469	389478	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1560	NC_017308	TGGCT	2	10	389693	389702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_017308	CAA	2	6	389721	389726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017308	CTAA	2	8	389833	389840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017308	AGA	2	6	389847	389852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017308	AGCGC	2	10	389902	389911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1565	NC_017308	GAG	2	6	389932	389937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017308	AGC	2	6	389955	389960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017308	GAA	2	6	389983	389988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017308	GCT	2	6	390103	390108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017308	CGG	2	6	390171	390176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017308	GGC	2	6	390271	390276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017308	GCT	2	6	390285	390290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017308	GCGGA	2	10	390345	390354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_017308	GC	3	6	390362	390367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_017308	GA	4	8	390420	390427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017308	GTG	2	6	391293	391298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017308	TGG	2	6	391332	391337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017308	GGGTG	2	10	391372	391381	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017308	TTG	2	6	391387	391392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017308	TAA	2	6	391427	391432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017308	TCCG	2	8	391849	391856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_017308	AGGAA	2	10	392704	392713	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017308	CA	3	6	393360	393365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_017308	GAG	2	6	393370	393375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017308	TCT	2	6	393392	393397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017308	GTC	2	6	393440	393445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_017308	GAG	2	6	394546	394551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017308	TG	3	6	395135	395140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017308	AAT	2	6	397576	397581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017308	GGA	2	6	397585	397590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017308	CGC	2	6	397612	397617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_017308	ATG	2	6	399211	399216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017308	AGTC	2	8	399228	399235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1595	NC_017308	AC	3	6	405861	405866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1597	NC_017308	TGG	2	6	405920	405925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017308	TGG	2	6	406528	406533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017308	AGGC	2	8	406561	406568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_017308	GAA	2	6	406587	406592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017308	GTC	2	6	406610	406615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017308	TCT	2	6	406634	406639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017308	TG	3	6	406716	406721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017308	GCA	2	6	406744	406749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_017308	GCC	2	6	406772	406777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_017308	CTGG	2	8	406804	406811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_017308	AGAC	2	8	406819	406826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_017308	TCA	2	6	406836	406841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017308	T	6	6	407818	407823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017308	TGG	2	6	407850	407855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017308	GGC	2	6	407856	407861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017308	CG	3	6	407900	407905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_017308	ATA	2	6	408001	408006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017308	TAG	2	6	409745	409750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017308	GCG	2	6	409869	409874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017308	AAAC	2	8	409936	409943	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1621	NC_017308	TTC	2	6	410230	410235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_017308	CCGAGA	2	12	410297	410308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017308	G	6	6	410339	410344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017308	CGT	2	6	410345	410350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017308	AAGAC	2	10	410367	410376	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_017308	GCAG	2	8	410427	410434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_017308	AGA	2	6	410469	410474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017308	TGAG	2	8	410480	410487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017308	TG	3	6	410594	410599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_017308	CGGA	2	8	410752	410759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_017308	CCA	2	6	410788	410793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_017308	AGC	2	6	410840	410845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_017308	AAG	2	6	411205	411210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_017308	GATT	2	8	411256	411263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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