MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017308	AATTTC	2	12	1481219	1481230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5002	NC_017308	AAT	3	9	1481231	1481239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017308	TTA	2	6	1481276	1481281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017308	AG	3	6	1481308	1481313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017308	TCC	2	6	1481322	1481327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_017308	AAT	2	6	1482751	1482756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017308	CTGT	2	8	1484279	1484286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_017308	CGC	2	6	1485394	1485399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_017308	TGG	2	6	1485405	1485410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017308	GGTTC	2	10	1486058	1486067	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_017308	GCAC	2	8	1486077	1486084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_017308	TA	3	6	1486272	1486277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017308	CGG	2	6	1486281	1486286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017308	CCT	2	6	1486299	1486304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_017308	A	7	7	1486362	1486368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017308	GAA	2	6	1486445	1486450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017308	GTT	3	9	1486460	1486468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017308	CAC	2	6	1486471	1486476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017308	AGG	2	6	1486477	1486482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017308	AAG	2	6	1488628	1488633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017308	CGA	2	6	1488640	1488645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017308	CCTG	2	8	1488650	1488657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_017308	GCT	2	6	1488706	1488711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017308	ATG	2	6	1488715	1488720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017308	A	6	6	1488722	1488727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017308	AGG	2	6	1492156	1492161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017308	TTC	2	6	1492273	1492278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017308	TGC	2	6	1492355	1492360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017308	TAG	2	6	1492414	1492419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017308	GCA	2	6	1492427	1492432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017308	TCT	2	6	1493799	1493804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017308	ACTT	2	8	1493854	1493861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_017308	AAG	2	6	1493877	1493882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017308	T	6	6	1493978	1493983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017308	T	6	6	1493988	1493993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017308	CAA	2	6	1493994	1493999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017308	A	7	7	1494005	1494011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017308	A	6	6	1494026	1494031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017308	ATT	2	6	1494073	1494078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017308	A	6	6	1494403	1494408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017308	TTTA	2	8	1494409	1494416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017308	TATT	2	8	1494436	1494443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017308	TCA	2	6	1494511	1494516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017308	CT	3	6	1494518	1494523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_017308	ATCC	2	8	1494581	1494588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_017308	TC	3	6	1494615	1494620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017308	TGC	3	9	1495193	1495201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017308	TTCA	3	12	1497251	1497262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017308	CGC	2	6	1497264	1497269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_017308	CAT	2	6	1497307	1497312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017308	ACT	2	6	1497315	1497320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017308	GCG	3	9	1497345	1497353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017308	GGC	2	6	1497400	1497405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017308	TTC	2	6	1497416	1497421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017308	ACA	2	6	1497454	1497459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017308	A	6	6	1497526	1497531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017308	TCC	2	6	1499667	1499672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_017308	AAT	2	6	1499721	1499726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017308	GCA	2	6	1499744	1499749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017308	GCA	2	6	1506647	1506652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017308	ATC	2	6	1506659	1506664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017308	CTTC	2	8	1508202	1508209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017308	CGA	2	6	1510221	1510226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017308	ACG	2	6	1510244	1510249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017308	GAG	2	6	1510264	1510269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017308	CGACG	2	10	1510861	1510870	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5067	NC_017308	CTT	2	6	1510962	1510967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017308	CGTCAT	2	12	1511045	1511056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017308	CAG	2	6	1512129	1512134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017308	CGT	2	6	1512142	1512147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017308	TTAA	2	8	1512162	1512169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017308	GAA	2	6	1512197	1512202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017308	ACC	2	6	1512818	1512823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_017308	CAA	2	6	1512843	1512848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017308	AAT	2	6	1512939	1512944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017308	TCC	2	6	1513106	1513111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017308	TACC	2	8	1513131	1513138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_017308	GCCA	2	8	1513175	1513182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_017308	CATA	2	8	1513186	1513193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_017308	A	6	6	1513193	1513198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_017308	CAG	2	6	1513758	1513763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017308	GTT	3	9	1519158	1519166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017308	CTG	2	6	1519192	1519197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017308	GCG	2	6	1519217	1519222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017308	AGGC	2	8	1519232	1519239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_017308	GTC	2	6	1519244	1519249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_017308	TCT	2	6	1524989	1524994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017308	T	6	6	1524994	1524999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017308	AGG	2	6	1525017	1525022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017308	AAAGC	2	10	1525108	1525117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5103	NC_017308	AACC	2	8	1525173	1525180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_017308	CAT	2	6	1525217	1525222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5107	NC_017308	CTT	2	6	1527008	1527013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_017308	CG	3	6	1527020	1527025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_017308	CGA	2	6	1528271	1528276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017308	TCG	2	6	1528277	1528282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017308	AATGC	2	10	1528285	1528294	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_017308	T	7	7	1529314	1529320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017308	CTAG	2	8	1529341	1529348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017308	ACA	2	6	1529355	1529360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017308	TA	3	6	1529363	1529368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017308	CA	3	6	1529372	1529377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_017308	A	6	6	1529380	1529385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017308	GAAA	2	8	1530107	1530114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017308	GAAG	2	8	1530163	1530170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017308	CAA	2	6	1530270	1530275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017308	CG	3	6	1530281	1530286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_017308	ACC	2	6	1530337	1530342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_017308	CCA	2	6	1530344	1530349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_017308	CCA	2	6	1530385	1530390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_017308	TAA	2	6	1530399	1530404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017308	A	6	6	1530422	1530427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017308	CAC	2	6	1530451	1530456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017308	ATA	2	6	1530510	1530515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017308	A	6	6	1530543	1530548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017308	GCA	2	6	1530551	1530556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017308	A	6	6	1530576	1530581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017308	AGC	2	6	1530818	1530823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_017308	TCA	2	6	1530832	1530837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_017308	GCT	2	6	1530843	1530848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_017308	T	6	6	1530866	1530871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017308	TTTC	2	8	1533692	1533699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5140	NC_017308	TCA	2	6	1535482	1535487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_017308	CCT	2	6	1535540	1535545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_017308	TTTC	2	8	1535549	1535556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5143	NC_017308	GA	3	6	1535585	1535590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5146	NC_017308	ATT	2	6	1535706	1535711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5171	NC_017308	ATC	2	6	1540725	1540730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5247	NC_017308	CAT	2	6	1557105	1557110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_017308	ACGTT	2	10	1557182	1557191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5250	NC_017308	T	6	6	1558168	1558173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_017308	ACT	2	6	1558654	1558659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_017308	TC	3	6	1558729	1558734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_017308	AGC	2	6	1560344	1560349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_017308	GAT	2	6	1560410	1560415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_017308	GAA	2	6	1560563	1560568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_017308	ACG	2	6	1560639	1560644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_017308	GCC	2	6	1560707	1560712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5258	NC_017308	AGGGC	2	10	1560730	1560739	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5259	NC_017308	TTTGC	2	10	1560763	1560772	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5261	NC_017308	CAA	2	6	1561194	1561199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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