MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017308	AAT	2	6	1336260	1336265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017308	TTG	2	6	1337859	1337864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017308	CTT	2	6	1339665	1339670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017308	CCAT	2	8	1339703	1339710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_017308	ACT	3	9	1340188	1340196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017308	ACA	2	6	1342123	1342128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017308	TTTCA	2	10	1343045	1343054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4508	NC_017308	T	7	7	1343059	1343065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017308	GCAC	2	8	1343074	1343081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_017308	TAA	2	6	1343083	1343088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017308	CCA	2	6	1343124	1343129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_017308	TGC	2	6	1344737	1344742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_017308	GTG	2	6	1344784	1344789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017308	ACT	2	6	1345169	1345174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017308	CGTA	2	8	1345221	1345228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_017308	CT	3	6	1346532	1346537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_017308	TCA	2	6	1349732	1349737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017308	TTTA	2	8	1349762	1349769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017308	GAA	2	6	1350451	1350456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017308	GCA	2	6	1350465	1350470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_017308	TGC	2	6	1350484	1350489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_017308	TC	3	6	1353520	1353525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_017308	C	6	6	1353542	1353547	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4524	NC_017308	TCT	2	6	1353584	1353589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_017308	CAA	2	6	1353591	1353596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_017308	CTTTT	2	10	1355122	1355131	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4527	NC_017308	T	6	6	1355128	1355133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017308	TGTC	2	8	1355282	1355289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_017308	AGA	2	6	1355300	1355305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017308	AAGAA	2	10	1355311	1355320	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017308	GT	3	6	1357667	1357672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017308	A	6	6	1357677	1357682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017308	CTG	2	6	1358159	1358164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017308	GGAA	2	8	1358185	1358192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017308	GAACA	2	10	1358208	1358217	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4536	NC_017308	GCT	2	6	1358250	1358255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_017308	TTC	2	6	1361179	1361184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017308	CCT	2	6	1362741	1362746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_017308	GTT	2	6	1362758	1362763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017308	ATT	2	6	1362779	1362784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017308	ATG	2	6	1365765	1365770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017308	CA	3	6	1365777	1365782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_017308	CTG	2	6	1368263	1368268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_017308	TGC	2	6	1368321	1368326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_017308	TGC	2	6	1368381	1368386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_017308	GCA	2	6	1368492	1368497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_017308	TGC	2	6	1368501	1368506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_017308	TCT	2	6	1368511	1368516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_017308	AGA	2	6	1368539	1368544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017308	AGT	2	6	1368585	1368590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017308	CTTG	2	8	1368593	1368600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_017308	TAGC	2	8	1368616	1368623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_017308	TC	3	6	1368651	1368656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_017308	GGAA	2	8	1368667	1368674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017308	CCTA	2	8	1368705	1368712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_017308	CA	3	6	1369197	1369202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_017308	AGT	2	6	1369222	1369227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017308	AAT	2	6	1369275	1369280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017308	TC	3	6	1369291	1369296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_017308	AGA	2	6	1369325	1369330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017308	ATCT	2	8	1370981	1370988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_017308	GAT	2	6	1371969	1371974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017308	GCA	2	6	1371979	1371984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_017308	CTG	2	6	1371989	1371994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_017308	CTT	2	6	1372010	1372015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_017308	CTT	2	6	1372043	1372048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_017308	CAA	2	6	1372086	1372091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_017308	ACTT	2	8	1372119	1372126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_017308	GTC	2	6	1372134	1372139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_017308	GCA	2	6	1372159	1372164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_017308	GCT	2	6	1372201	1372206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_017308	TTTG	2	8	1372212	1372219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017308	TCA	2	6	1372276	1372281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_017308	GCT	2	6	1372286	1372291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_017308	TCA	2	6	1372366	1372371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4577	NC_017308	TCT	2	6	1372677	1372682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_017308	TAC	2	6	1372808	1372813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4581	NC_017308	TTC	2	6	1373060	1373065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4584	NC_017308	TGTCA	2	10	1373189	1373198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4585	NC_017308	GAA	2	6	1373236	1373241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4588	NC_017308	CAA	2	6	1373462	1373467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_017308	CAG	2	6	1373477	1373482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4596	NC_017308	GAA	2	6	1375288	1375293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017308	ATA	2	6	1375348	1375353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017308	ACGGT	2	10	1375365	1375374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4599	NC_017308	CCCGC	2	10	1377942	1377951	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4600	NC_017308	CAA	2	6	1378507	1378512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017308	AAG	2	6	1380471	1380476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017308	CTTG	2	8	1380486	1380493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_017308	TCC	2	6	1381155	1381160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_017308	ATC	2	6	1381173	1381178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4607	NC_017308	GGA	2	6	1381277	1381282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017308	AGT	2	6	1381365	1381370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017308	TCC	2	6	1381378	1381383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_017308	TGG	2	6	1381394	1381399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017308	GCT	2	6	1381400	1381405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_017308	ACCT	2	8	1382499	1382506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_017308	TTC	2	6	1384101	1384106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017308	AG	3	6	1384154	1384159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017308	ACC	2	6	1384207	1384212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_017308	CA	3	6	1384259	1384264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_017308	AAC	2	6	1384290	1384295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_017308	CGCAAA	2	12	1384354	1384365	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_017308	A	6	6	1384363	1384368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017308	AGA	2	6	1385556	1385561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017308	T	6	6	1385580	1385585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017308	ATT	3	9	1385586	1385594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017308	ACGC	2	8	1385644	1385651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_017308	TAG	2	6	1385713	1385718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4626	NC_017308	CA	3	6	1387170	1387175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_017308	AATCTA	2	12	1387183	1387194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4628	NC_017308	TCC	2	6	1387241	1387246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4630	NC_017308	ACG	2	6	1387388	1387393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4753	NC_017308	AG	3	6	1427021	1427026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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