MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 6877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017306	CAA	2	6	1978606	1978611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017306	TA	4	8	1980326	1980333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017306	GAC	2	6	1980335	1980340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017306	CGA	2	6	1980351	1980356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017306	CAG	2	6	1980359	1980364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017306	AACC	2	8	1980396	1980403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_017306	C	7	7	1981920	1981926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5508	NC_017306	CAT	2	6	1981985	1981990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017306	TAT	2	6	1981991	1981996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017306	ACAGCC	2	12	1982025	1982036	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_017306	GACT	2	8	1982061	1982068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017306	AAG	2	6	1984114	1984119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017306	TGC	2	6	1984174	1984179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017306	GA	3	6	1984187	1984192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017306	CATA	2	8	1984215	1984222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_017306	CCA	2	6	1984293	1984298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_017306	AGA	2	6	1984382	1984387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017306	CAGC	2	8	1984420	1984427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_017306	CTT	2	6	1984595	1984600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017306	CGA	2	6	1984645	1984650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017306	AAC	2	6	1984754	1984759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017306	TCA	2	6	1984836	1984841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017306	CTTT	2	8	1984989	1984996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_017306	CAT	2	6	1985038	1985043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017306	ACCT	2	8	1985071	1985078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_017306	TTCTT	2	10	1985084	1985093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5527	NC_017306	GTCC	2	8	1985140	1985147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_017306	GCT	2	6	1985196	1985201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017306	AAC	2	6	1985254	1985259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017306	CCA	2	6	1985300	1985305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_017306	ATT	2	6	1985506	1985511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017306	CCA	2	6	1985540	1985545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_017306	TTA	2	6	1985591	1985596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017306	CAG	2	6	1985616	1985621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017306	ACC	2	6	1985692	1985697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_017306	TTTC	2	8	1985779	1985786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_017306	AGA	2	6	1985902	1985907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017306	CGG	2	6	1986036	1986041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017306	GGA	2	6	1986113	1986118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017306	TC	3	6	1986189	1986194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_017306	TTTTCA	2	12	1986393	1986404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5542	NC_017306	GCA	2	6	1986446	1986451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017306	TCT	2	6	1986454	1986459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017306	AT	3	6	1986460	1986465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017306	TAAAT	2	10	1986499	1986508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017306	ATT	2	6	1986538	1986543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017306	CCA	2	6	1986731	1986736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_017306	AGG	2	6	1992920	1992925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017306	ACA	2	6	2002190	2002195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_017306	GCTT	2	8	2009586	2009593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_017306	TG	4	8	2011609	2011616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017306	GGC	2	6	2013859	2013864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017306	GCC	2	6	2014381	2014386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_017306	AG	3	6	2014445	2014450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017306	CGT	2	6	2014480	2014485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017306	CGT	2	6	2014531	2014536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017306	TGT	2	6	2014600	2014605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017306	TTG	2	6	2014698	2014703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017306	AAC	2	6	2014727	2014732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017306	GCTTT	2	10	2014779	2014788	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5561	NC_017306	GAC	2	6	2014842	2014847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_017306	ATG	2	6	2014868	2014873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017306	TCT	2	6	2014908	2014913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017306	GCCC	2	8	2014974	2014981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5565	NC_017306	CG	3	6	2015042	2015047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_017306	AGG	2	6	2015049	2015054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017306	GTA	2	6	2015080	2015085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017306	ACCAA	2	10	2015105	2015114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5569	NC_017306	GCA	2	6	2015147	2015152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017306	CAA	2	6	2015202	2015207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_017306	CTT	2	6	2015218	2015223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017306	AGG	2	6	2015392	2015397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017306	TAA	2	6	2015439	2015444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017306	TTC	2	6	2015486	2015491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017306	GAA	2	6	2015504	2015509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017306	ACC	2	6	2015576	2015581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_017306	TG	3	6	2015608	2015613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017306	CG	3	6	2015659	2015664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_017306	TAG	2	6	2015696	2015701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_017306	TAA	2	6	2015832	2015837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017306	ATG	2	6	2015876	2015881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017306	CTG	2	6	2015889	2015894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_017306	ATTT	3	12	2016262	2016273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017306	ATTT	2	8	2016331	2016338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017306	ATAA	2	8	2016343	2016350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017306	AT	3	6	2016381	2016386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_017306	TAA	2	6	2022861	2022866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017306	A	6	6	2022903	2022908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017306	CTAA	2	8	2022929	2022936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_017306	TCA	2	6	2024288	2024293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_017306	TACA	2	8	2024297	2024304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5597	NC_017306	TCT	2	6	2024314	2024319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017306	TATT	2	8	2026318	2026325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017306	T	6	6	2026327	2026332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017306	A	6	6	2026348	2026353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_017306	AAAT	2	8	2026374	2026381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017306	CTC	2	6	2027594	2027599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_017306	CGAT	2	8	2027628	2027635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_017306	GTA	2	6	2027773	2027778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017306	TTTCC	2	10	2027988	2027997	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5606	NC_017306	GCG	2	6	2028008	2028013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_017306	ATC	2	6	2028014	2028019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_017306	ACA	2	6	2028116	2028121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_017306	CCA	2	6	2028123	2028128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_017306	GCC	2	6	2028213	2028218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_017306	CGGT	2	8	2028238	2028245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_017306	GAA	2	6	2028266	2028271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017306	AAT	2	6	2028333	2028338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017306	ATA	2	6	2028346	2028351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017306	CGG	2	6	2028460	2028465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_017306	CCG	2	6	2028475	2028480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_017306	GTG	2	6	2028481	2028486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017306	A	6	6	2028516	2028521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017306	GCT	2	6	2028524	2028529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_017306	T	6	6	2028644	2028649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017306	CTC	2	6	2028677	2028682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_017306	CTA	2	6	2029328	2029333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5625	NC_017306	CTA	2	6	2031350	2031355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_017306	TAG	2	6	2031365	2031370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017306	CTT	2	6	2031371	2031376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_017306	AC	3	6	2031386	2031391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_017306	ACG	2	6	2031452	2031457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_017306	CAG	2	6	2031503	2031508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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