MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017305	T	6	6	1148319	1148324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017305	TGT	2	6	1149327	1149332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017305	CAT	2	6	1151882	1151887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017305	TGT	2	6	1151890	1151895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017305	CAAAA	2	10	1151921	1151930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3006	NC_017305	CATT	2	8	1151965	1151972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_017305	AACA	2	8	1152007	1152014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_017305	CTAT	2	8	1152109	1152116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_017305	CCCGG	2	10	1152169	1152178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3010	NC_017305	CTA	2	6	1152220	1152225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017305	C	6	6	1152246	1152251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3012	NC_017305	GGC	2	6	1152369	1152374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017305	GC	3	6	1152611	1152616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_017305	TTGG	2	8	1152621	1152628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017305	TGC	2	6	1152668	1152673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017305	CCA	2	6	1152681	1152686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_017305	GAT	2	6	1152726	1152731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017305	ATA	2	6	1153097	1153102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017305	CGA	2	6	1154092	1154097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_017305	TCG	2	6	1156716	1156721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_017305	AAG	2	6	1160855	1160860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017305	ATC	2	6	1160926	1160931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017305	TCA	2	6	1160964	1160969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017305	TG	3	6	1160979	1160984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017305	TAAAG	2	10	1161014	1161023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017305	TCT	2	6	1161774	1161779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017305	ATTT	2	8	1161788	1161795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017305	T	7	7	1162428	1162434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017305	CAT	2	6	1164109	1164114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017305	AAGA	2	8	1166955	1166962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017305	GATT	2	8	1167004	1167011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017305	AGG	2	6	1168867	1168872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017305	AAC	2	6	1168890	1168895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_017305	CTT	2	6	1168929	1168934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017305	ATT	2	6	1169183	1169188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017305	CCCA	2	8	1169230	1169237	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3037	NC_017305	CCG	2	6	1169281	1169286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_017305	CCTT	2	8	1169309	1169316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017305	GTAT	2	8	1169350	1169357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017305	GAC	3	9	1170130	1170138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017305	GCT	2	6	1170149	1170154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017305	CAG	2	6	1170177	1170182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017305	AGA	2	6	1170191	1170196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017305	GC	3	6	1173030	1173035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_017305	AGT	2	6	1173759	1173764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017305	TACC	2	8	1176250	1176257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_017305	TTA	2	6	1176498	1176503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017305	TAC	2	6	1176535	1176540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_017305	TGG	2	6	1176622	1176627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017305	CAA	2	6	1178003	1178008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017305	TAAT	2	8	1178087	1178094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017305	AGA	2	6	1180267	1180272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017305	TTA	2	6	1180294	1180299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017305	TAAA	2	8	1180305	1180312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017305	ACC	2	6	1180320	1180325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_017305	TCT	2	6	1180356	1180361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017305	CGG	2	6	1182054	1182059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017305	TGG	2	6	1182121	1182126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017305	ATTC	2	8	1188757	1188764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_017305	AC	3	6	1188776	1188781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_017305	AACC	2	8	1188808	1188815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_017305	ATC	2	6	1188831	1188836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017305	TAA	2	6	1188901	1188906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017305	TTC	2	6	1188907	1188912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017305	CCA	2	6	1188917	1188922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_017305	GTA	2	6	1193700	1193705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017305	AAGG	2	8	1193710	1193717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017305	T	6	6	1193760	1193765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017305	TTA	2	6	1193775	1193780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017305	TCC	2	6	1194758	1194763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017305	TCA	2	6	1194793	1194798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017305	T	6	6	1194853	1194858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017305	CTT	2	6	1194940	1194945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017305	ATTA	2	8	1195001	1195008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017305	GAA	2	6	1195024	1195029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017305	CTTT	2	8	1195063	1195070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_017305	CAAA	2	8	1195091	1195098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_017305	GGAC	2	8	1195116	1195123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_017305	TCA	2	6	1197229	1197234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017305	TCA	2	6	1198421	1198426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017305	AAT	2	6	1198518	1198523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017305	GTAG	2	8	1198530	1198537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017305	CAGA	2	8	1201920	1201927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_017305	CAC	2	6	1202283	1202288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_017305	ATG	2	6	1205180	1205185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017305	CTTT	2	8	1205192	1205199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_017305	ACT	2	6	1205224	1205229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017305	ATG	2	6	1206131	1206136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017305	TCG	2	6	1207370	1207375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017305	TGC	2	6	1207380	1207385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_017305	AGA	2	6	1207493	1207498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017305	ATC	2	6	1208555	1208560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017305	GAA	2	6	1208565	1208570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017305	T	6	6	1208670	1208675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017305	ACC	2	6	1208702	1208707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_017305	TGT	2	6	1208739	1208744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017305	CA	3	6	1208773	1208778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_017305	GGA	2	6	1208803	1208808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017305	TTG	2	6	1208836	1208841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017305	AGCT	2	8	1209958	1209965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_017305	ACT	2	6	1210000	1210005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_017305	AGTC	2	8	1214736	1214743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_017305	GCT	2	6	1214756	1214761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017305	GTT	2	6	1214764	1214769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017305	TC	3	6	1214770	1214775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_017305	ACG	2	6	1214821	1214826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017305	GAT	2	6	1216671	1216676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017305	TCC	2	6	1217327	1217332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_017305	TGC	2	6	1217355	1217360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017305	AC	3	6	1217396	1217401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_017305	AAG	2	6	1219230	1219235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017305	A	6	6	1219266	1219271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017305	CTT	2	6	1221736	1221741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017305	T	7	7	1222295	1222301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017305	CTG	2	6	1222345	1222350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017305	CTTT	2	8	1222375	1222382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_017305	GAA	2	6	1224516	1224521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017305	CTTA	2	8	1225763	1225770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_017305	ATA	2	6	1225846	1225851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017305	TAA	2	6	1225866	1225871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017305	GAA	2	6	1225881	1225886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017305	GAA	2	6	1227198	1227203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017305	TG	3	6	1227632	1227637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017305	CTG	2	6	1227653	1227658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017305	TCC	2	6	1228585	1228590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_017305	TAT	2	6	1228602	1228607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017305	CTA	2	6	1228914	1228919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_017305	TAG	2	6	1237570	1237575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017305	TTG	2	6	1237641	1237646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017305	TCT	2	6	1237693	1237698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017305	CAC	2	6	1237699	1237704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_017305	TCG	2	6	1240169	1240174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_017305	AACT	2	8	1240223	1240230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_017305	CTT	2	6	1241454	1241459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_017305	TC	3	6	1246824	1246829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_017305	CAG	2	6	1247805	1247810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3138	NC_017305	TGCGC	2	10	1249878	1249887	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3139	NC_017305	TTG	2	6	1252584	1252589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3145	NC_017305	AG	3	6	1254237	1254242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3152	NC_017305	CTT	2	6	1257864	1257869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_017305	CCT	2	6	1258812	1258817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3159	NC_017305	ACTT	2	8	1267386	1267393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3162	NC_017305	CTT	2	6	1268435	1268440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3238	NC_017305	CTTAC	2	10	1296684	1296693	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3246	NC_017305	AAG	2	6	1301857	1301862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_017305	CATTC	2	10	1302416	1302425	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3250	NC_017305	GTG	2	6	1302806	1302811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_017305	TAA	2	6	1303929	1303934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_017305	TATC	2	8	1305314	1305321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_017305	CTG	2	6	1305353	1305358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_017305	GATA	2	8	1305419	1305426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_017305	GAG	2	6	1306776	1306781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_017305	ATT	2	6	1306917	1306922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_017305	TTAC	2	8	1306943	1306950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3258	NC_017305	GC	3	6	1306956	1306961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_017305	CCAA	2	8	1306964	1306971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_017305	GCA	2	6	1308844	1308849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_017305	GGA	2	6	1310778	1310783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_017305	GA	3	6	1310841	1310846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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