MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017305	TTAAG	2	10	184399	184408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017305	AGCC	2	8	184420	184427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017305	AGG	2	6	184433	184438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017305	TTA	2	6	186118	186123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017305	AAT	2	6	186131	186136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017305	GTA	2	6	186197	186202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017305	CTT	2	6	186260	186265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017305	AGGTG	2	10	186270	186279	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017305	ATCT	2	8	186295	186302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017305	GCT	2	6	186303	186308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017305	CCT	2	6	186353	186358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017305	A	6	6	186496	186501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017305	AGA	2	6	186524	186529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017305	GAA	2	6	186557	186562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017305	CCT	2	6	186572	186577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017305	GCA	2	6	186578	186583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017305	TTGCA	2	10	186603	186612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
518	NC_017305	AAG	2	6	189916	189921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017305	AGC	2	6	189923	189928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017305	CAATG	2	10	192400	192409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017305	CTG	2	6	192410	192415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017305	CTA	2	6	192438	192443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017305	A	6	6	192516	192521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017305	CAGT	2	8	195076	195083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_017305	TTA	2	6	195104	195109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017305	ATGG	2	8	196662	196669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017305	AAG	3	9	196694	196702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017305	TCAC	2	8	202699	202706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017305	T	6	6	202744	202749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017305	TA	3	6	202799	202804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017305	GGT	2	6	205901	205906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017305	GCG	2	6	205919	205924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017305	AC	3	6	205930	205935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017305	GCG	2	6	206040	206045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017305	ATT	2	6	206090	206095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017305	AAG	2	6	206978	206983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017305	TTC	2	6	207014	207019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017305	ATTCT	2	10	207109	207118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_017305	AGA	2	6	207342	207347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017305	CAA	2	6	207404	207409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017305	GAAT	2	8	207417	207424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017305	TCA	2	6	207600	207605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017305	TTC	2	6	207620	207625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017305	AT	3	6	207630	207635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017305	AGT	2	6	207731	207736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017305	AAGC	2	8	207754	207761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_017305	CGC	2	6	207775	207780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017305	AAGC	2	8	207851	207858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_017305	CAG	2	6	207911	207916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017305	T	6	6	207935	207940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017305	CTTT	2	8	207965	207972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_017305	ATC	2	6	207979	207984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017305	TCAC	2	8	208143	208150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017305	GCT	2	6	208171	208176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017305	TGT	2	6	208179	208184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017305	CGG	2	6	208206	208211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017305	GGA	2	6	208237	208242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017305	CCA	2	6	208262	208267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017305	CAG	2	6	208290	208295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017305	ATCT	2	8	208328	208335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_017305	ATC	2	6	208404	208409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017305	ACGA	2	8	208435	208442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_017305	GAC	2	6	208483	208488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017305	AAG	2	6	208498	208503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017305	CTA	2	6	209078	209083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017305	CGG	2	6	209135	209140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017305	GTG	2	6	209158	209163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017305	CGG	2	6	209184	209189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017305	ATTG	2	8	209239	209246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017305	CTC	2	6	209280	209285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017305	TGC	2	6	209289	209294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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573	NC_017305	ATC	2	6	209416	209421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017305	GCA	2	6	209472	209477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_017305	CGAA	2	8	210491	210498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_017305	GC	3	6	210499	210504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_017305	GTA	2	6	210557	210562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017305	AGG	2	6	214558	214563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017305	TGA	2	6	214760	214765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_017305	AGT	2	6	215697	215702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_017305	TAG	2	6	217327	217332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017305	TAGA	2	8	222968	222975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_017305	GTA	2	6	222989	222994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_017305	GCCC	2	8	224798	224805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
620	NC_017305	C	7	7	224803	224809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_017305	GGC	2	6	224821	224826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017305	C	6	6	224836	224841	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
623	NC_017305	GCC	2	6	224850	224855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017305	TAG	2	6	225130	225135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017305	GTCT	2	8	225156	225163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017305	CGAGA	2	10	225335	225344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
627	NC_017305	AC	4	8	225370	225377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017305	TCG	2	6	225378	225383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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630	NC_017305	TAA	2	6	226551	226556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017305	AG	3	6	226621	226626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017305	CAAAA	2	10	228957	228966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
633	NC_017305	A	6	6	228963	228968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017305	AAC	2	6	228972	228977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017305	AAC	2	6	228997	229002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_017305	ATT	2	6	232211	232216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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