MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 16050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017304	TA	3	6	3553285	3553290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_017304	TA	3	6	3553304	3553309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_017304	AAAC	2	8	3553321	3553328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_017304	ATA	2	6	3553343	3553348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017304	CT	3	6	3553358	3553363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16006	NC_017304	AAT	2	6	3553373	3553378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_017304	CATAT	2	10	3553382	3553391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16008	NC_017304	TAA	2	6	3553396	3553401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017304	T	6	6	3553422	3553427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017304	A	7	7	3553446	3553452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_017304	ATA	2	6	3553461	3553466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_017304	T	6	6	3553478	3553483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017304	ATA	2	6	3553489	3553494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_017304	TA	3	6	3553501	3553506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017304	GTTTT	2	10	3554408	3554417	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_017304	TGC	2	6	3554454	3554459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_017304	TTAA	2	8	3554469	3554476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_017304	T	9	9	3554515	3554523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017304	A	6	6	3554524	3554529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_017304	TCGT	2	8	3554533	3554540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16021	NC_017304	TCC	2	6	3558631	3558636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_017304	CAG	2	6	3558644	3558649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_017304	TAT	2	6	3558656	3558661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_017304	CAA	2	6	3558694	3558699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_017304	ATA	2	6	3558774	3558779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_017304	T	6	6	3558780	3558785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_017304	T	6	6	3558787	3558792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_017304	T	6	6	3558830	3558835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_017304	T	6	6	3560342	3560347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_017304	TCT	2	6	3560948	3560953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_017304	TAAA	2	8	3560963	3560970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_017304	T	6	6	3561144	3561149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_017304	TA	3	6	3561159	3561164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_017304	AAAT	2	8	3561191	3561198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_017304	TAAA	2	8	3561205	3561212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_017304	TAT	2	6	3561263	3561268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_017304	TA	3	6	3561301	3561306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_017304	ATTTT	2	10	3561360	3561369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_017304	T	7	7	3561366	3561372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_017304	T	7	7	3561388	3561394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_017304	ATA	2	6	3561418	3561423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017304	TAA	2	6	3561449	3561454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017304	TAA	2	6	3561480	3561485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017304	TTG	2	6	3561488	3561493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017304	A	6	6	3561505	3561510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017304	T	6	6	3561512	3561517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_017304	TATAT	2	10	3561555	3561564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_017304	GTT	2	6	3561565	3561570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_017304	AAC	2	6	3561574	3561579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_017304	ATT	2	6	3561589	3561594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.