MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 6312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017303	GCTG	2	8	400796	400803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_017303	TCT	2	6	400813	400818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017303	TAT	2	6	400832	400837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017303	GGA	2	6	400897	400902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017303	TG	3	6	400920	400925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017303	TCT	2	6	400934	400939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017303	TTC	2	6	401002	401007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017303	CATC	2	8	401081	401088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_017303	GCGGA	2	10	403237	403246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_017303	GC	3	6	403254	403259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_017303	GA	3	6	403312	403317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017303	GTG	2	6	404185	404190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017303	TGG	2	6	404224	404229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017303	GGGTG	2	10	404264	404273	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017303	TGT	2	6	404280	404285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017303	TAA	2	6	404319	404324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017303	TCCG	2	8	404741	404748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_017303	ACC	2	6	404786	404791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017303	AAC	2	6	404794	404799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017303	AGGAA	2	10	405596	405605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017303	CA	3	6	406252	406257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_017303	TCT	2	6	406289	406294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017303	GTC	2	6	406337	406342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017303	GAG	2	6	407443	407448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017303	TG	3	6	408032	408037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017303	CG	3	6	408081	408086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017303	AAAAGC	2	12	408105	408116	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1028	NC_017303	GGA	2	6	408141	408146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017303	AAT	2	6	410473	410478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017303	GGA	2	6	410482	410487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017303	CGC	2	6	410509	410514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017303	ATG	2	6	412108	412113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017303	AGTC	2	8	412125	412132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_017303	C	6	6	413599	413604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1035	NC_017303	ACT	2	6	413625	413630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017303	GAA	2	6	418652	418657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017303	AC	3	6	418761	418766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017303	GGGA	2	8	418776	418783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017303	AGGC	2	8	419461	419468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_017303	GAA	2	6	419487	419492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017303	GTC	2	6	419510	419515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017303	TG	3	6	419616	419621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017303	GCA	2	6	419644	419649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017303	CAC	2	6	419664	419669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017303	GCC	2	6	419672	419677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017303	CTGG	2	8	419704	419711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_017303	AGAC	2	8	419719	419726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_017303	TCA	2	6	419736	419741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017303	T	6	6	420718	420723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017303	TGG	2	6	420750	420755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017303	GGC	2	6	420756	420761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017303	CG	3	6	420800	420805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_017303	ATA	2	6	420901	420906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017303	AAG	2	6	424104	424109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017303	CTT	2	6	424127	424132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017303	ATG	2	6	426295	426300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_017303	TTGA	2	8	426921	426928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017303	TTCT	2	8	426954	426961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_017303	GCA	2	6	426999	427004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017303	TCA	2	6	427016	427021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017303	TGT	2	6	427031	427036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017303	CAA	2	6	427216	427221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017303	GTT	2	6	427229	427234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017303	TGC	2	6	427307	427312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017303	GTT	2	6	427328	427333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017303	TGC	2	6	427380	427385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017303	GCT	2	6	429114	429119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017303	GTA	2	6	429166	429171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017303	ACCC	2	8	429205	429212	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1071	NC_017303	AGGGCT	2	12	429753	429764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1072	NC_017303	GAA	2	6	429783	429788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017303	AAG	2	6	429814	429819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017303	CTT	2	6	429828	429833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_017303	GTT	2	6	432143	432148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017303	CGA	2	6	432155	432160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_017303	AG	3	6	434652	434657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017303	A	6	6	434670	434675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017303	TCG	2	6	434676	434681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_017303	GAT	2	6	434801	434806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017303	GCT	2	6	436312	436317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017303	AAG	2	6	436323	436328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017303	AAT	2	6	436363	436368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017303	CAT	2	6	436457	436462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017303	GAA	2	6	436508	436513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017303	T	6	6	436546	436551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_017303	ATC	2	6	436657	436662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017303	ATGC	2	8	436821	436828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_017303	TCG	2	6	439564	439569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017303	TGG	2	6	439621	439626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017303	CTT	2	6	441580	441585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017303	TTA	2	6	443258	443263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017303	AGGA	2	8	443342	443349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017303	A	6	6	444910	444915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017303	GATGT	2	10	447523	447532	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017303	CTTA	2	8	447590	447597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_017303	CGG	2	6	448491	448496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017303	TG	3	6	448521	448526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017303	CGA	2	6	448605	448610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017303	CTG	2	6	450327	450332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017303	TTC	2	6	451238	451243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017303	TGA	2	6	451283	451288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017303	AGT	2	6	451320	451325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017303	GGTGG	2	10	451409	451418	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017303	GA	3	6	452514	452519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017303	ATTG	2	8	452596	452603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017303	TAT	2	6	452630	452635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017303	GAT	2	6	452672	452677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017303	TCC	2	6	452680	452685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_017303	GCATC	2	10	452692	452701	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_017303	GAT	2	6	452771	452776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017303	TGC	2	6	452833	452838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017303	CGCAA	2	10	452871	452880	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1121	NC_017303	TTG	2	6	452907	452912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017303	GTG	2	6	452927	452932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017303	GCA	2	6	452965	452970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017303	GTC	2	6	453031	453036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017303	TTG	2	6	453081	453086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017303	GCG	2	6	453094	453099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017303	GCC	2	6	453607	453612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_017303	CGT	2	6	453624	453629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017303	GCTGT	2	10	453638	453647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1130	NC_017303	ACA	2	6	453683	453688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017303	CGT	2	6	454199	454204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017303	TAT	2	6	454237	454242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017303	TAT	2	6	454249	454254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017303	GCG	2	6	454347	454352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017303	G	9	9	454416	454424	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1437	NC_017303	GTT	2	6	596878	596883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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