MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 6314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017301	A	6	6	2222094	2222099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017301	ATT	2	6	2222124	2222129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017301	CA	3	6	2222153	2222158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_017301	ACC	2	6	2222164	2222169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_017301	CAC	2	6	2222170	2222175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_017301	CAA	3	9	2222178	2222186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017301	CA	3	6	2222189	2222194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_017301	CAC	2	6	2222199	2222204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_017301	CAA	2	6	2222210	2222215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_017301	CAT	2	6	2222243	2222248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_017301	CAACA	2	10	2222270	2222279	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6012	NC_017301	AAC	2	6	2222280	2222285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_017301	CAACA	2	10	2222298	2222307	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_017301	CA	3	6	2222306	2222311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_017301	ACA	3	9	2222309	2222317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017301	CA	3	6	2222324	2222329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_017301	CCA	2	6	2222341	2222346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_017301	AGC	2	6	2222353	2222358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017301	CA	4	8	2222366	2222373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017301	A	7	7	2222393	2222399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017301	ACA	2	6	2222403	2222408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017301	ACCA	2	8	2222412	2222419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_017301	AAAAAC	2	12	2222430	2222441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6024	NC_017301	AGG	2	6	2222451	2222456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017301	C	6	6	2222532	2222537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6026	NC_017301	TGACG	2	10	2222581	2222590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6027	NC_017301	GT	3	6	2222595	2222600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017301	TG	3	6	2222764	2222769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017301	ATG	2	6	2222790	2222795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017301	TCC	2	6	2222816	2222821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_017301	TC	3	6	2222838	2222843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_017301	CCA	2	6	2222852	2222857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_017301	CACGA	2	10	2222917	2222926	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6034	NC_017301	GAC	2	6	2222930	2222935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017301	CAC	2	6	2222943	2222948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_017301	TTC	2	6	2223016	2223021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_017301	CCG	2	6	2223049	2223054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_017301	CTC	2	6	2223232	2223237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_017301	TCC	2	6	2223280	2223285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_017301	GAC	2	6	2223394	2223399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_017301	ACC	2	6	2223407	2223412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_017301	GCT	2	6	2223471	2223476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017301	CTT	2	6	2223496	2223501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_017301	CTG	2	6	2223620	2223625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_017301	CAA	2	6	2223723	2223728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_017301	A	6	6	2223759	2223764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017301	CCA	2	6	2223769	2223774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_017301	CA	4	8	2223773	2223780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_017301	CGC	2	6	2223925	2223930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_017301	A	6	6	2223966	2223971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017301	ACCA	2	8	2223987	2223994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_017301	CCAA	2	8	2224010	2224017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_017301	A	6	6	2224025	2224030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017301	CAAC	2	8	2224035	2224042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_017301	A	8	8	2224043	2224050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017301	TGC	2	6	2224380	2224385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017301	A	6	6	2224420	2224425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017301	TAT	2	6	2224426	2224431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017301	ACA	2	6	2224462	2224467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017301	CACCCA	2	12	2224468	2224479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_017301	CA	4	8	2224478	2224485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_017301	AAT	2	6	2224519	2224524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017301	CAA	2	6	2224572	2224577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017301	TG	3	6	2224582	2224587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017301	GTCG	2	8	2224612	2224619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_017301	AC	3	6	2224639	2224644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_017301	CAACA	2	10	2224648	2224657	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6068	NC_017301	CA	3	6	2224656	2224661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_017301	AAC	3	9	2224700	2224708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_017301	TAAC	2	8	2227098	2227105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_017301	GCC	2	6	2227126	2227131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_017301	AC	3	6	2227138	2227143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_017301	A	6	6	2227179	2227184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017301	CGA	2	6	2227200	2227205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_017301	ATG	2	6	2227246	2227251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_017301	CT	3	6	2228730	2228735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_017301	CTG	2	6	2228748	2228753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_017301	TG	3	6	2229746	2229751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_017301	ACC	2	6	2229817	2229822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_017301	GCCG	2	8	2229882	2229889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_017301	AT	3	6	2229940	2229945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017301	ATT	2	6	2230048	2230053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017301	A	6	6	2230065	2230070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017301	GAA	2	6	2230071	2230076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_017301	TA	3	6	2230079	2230084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_017301	CG	3	6	2230273	2230278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_017301	CTC	2	6	2230661	2230666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_017301	CAA	2	6	2230711	2230716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_017301	TTG	2	6	2230732	2230737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017301	ACA	2	6	2230750	2230755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_017301	CTT	2	6	2230756	2230761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_017301	AGA	2	6	2230822	2230827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017301	CAC	2	6	2231076	2231081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_017301	CAG	2	6	2233492	2233497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_017301	CAT	2	6	2233518	2233523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_017301	GCTT	2	8	2233573	2233580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_017301	AAT	2	6	2233626	2233631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017301	ATC	2	6	2233662	2233667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_017301	AC	3	6	2233715	2233720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_017301	ACC	2	6	2236572	2236577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_017301	GACGC	2	10	2236608	2236617	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6102	NC_017301	CTA	2	6	2236628	2236633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_017301	TGC	2	6	2238626	2238631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017301	TCCC	2	8	2238633	2238640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6105	NC_017301	TC	3	6	2238674	2238679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_017301	GTG	2	6	2238718	2238723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017301	ATA	2	6	2238976	2238981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017301	ATGCA	2	10	2239071	2239080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6109	NC_017301	AATA	2	8	2239102	2239109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017301	CAT	2	6	2239121	2239126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017301	GCA	2	6	2239129	2239134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017301	A	7	7	2239156	2239162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017301	CCAT	2	8	2239179	2239186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_017301	TGT	2	6	2239215	2239220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017301	CGT	2	6	2239243	2239248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_017301	GTG	2	6	2239796	2239801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017301	CTTT	2	8	2240390	2240397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_017301	TG	3	6	2240419	2240424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017301	TTC	2	6	2240436	2240441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017301	GAA	2	6	2240486	2240491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017301	CAG	2	6	2240501	2240506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017301	AGCCT	2	10	2241055	2241064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6123	NC_017301	TA	3	6	2242889	2242894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017301	AAT	2	6	2242895	2242900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017301	TGCA	2	8	2242942	2242949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_017301	ACA	2	6	2242968	2242973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_017301	ACT	2	6	2243034	2243039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_017301	TTAT	2	8	2245342	2245349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017301	GT	3	6	2245467	2245472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017301	CCAG	2	8	2245477	2245484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_017301	AT	3	6	2246001	2246006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017301	AAG	2	6	2246007	2246012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_017301	CTC	2	6	2246619	2246624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_017301	TTC	2	6	2246625	2246630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6136	NC_017301	TGC	2	6	2246666	2246671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_017301	CTAT	2	8	2302148	2302155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6253	NC_017301	ATCA	2	8	2302220	2302227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_017301	CAC	2	6	2302285	2302290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6257	NC_017301	TCAA	2	8	2302410	2302417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6263	NC_017301	CCTT	2	8	2308290	2308297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6264	NC_017301	CA	3	6	2309987	2309992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_017301	CAC	2	6	2310062	2310067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6268	NC_017301	TTC	2	6	2310192	2310197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6269	NC_017301	CTTTT	2	10	2310255	2310264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6270	NC_017301	AAG	2	6	2310266	2310271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6272	NC_017301	GGC	2	6	2314387	2314392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6273	NC_017301	AGAAA	2	10	2314399	2314408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6280	NC_017301	TTC	2	6	2318114	2318119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6281	NC_017301	TA	3	6	2318898	2318903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6282	NC_017301	AAAG	2	8	2318959	2318966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_017301	AT	3	6	2319060	2319065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6286	NC_017301	TGG	2	6	2321720	2321725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6289	NC_017301	AAG	2	6	2322450	2322455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6290	NC_017301	T	6	6	2324573	2324578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6291	NC_017301	CCA	2	6	2325418	2325423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6308	NC_017301	CTAG	2	8	2327651	2327658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6310	NC_017301	TC	3	6	2327749	2327754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6311	NC_017301	CA	3	6	2327881	2327886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6312	NC_017301	AAC	2	6	2328107	2328112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6313	NC_017301	TTG	2	6	2328175	2328180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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