MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 6346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017300	ACA	2	6	1583416	1583421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017300	GCC	2	6	1583436	1583441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_017300	AGT	2	6	1583512	1583517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017300	AGAA	2	8	1584593	1584600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017300	TCT	2	6	1584619	1584624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017300	T	7	7	1584624	1584630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017300	CAT	2	6	1584636	1584641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017300	ATCT	2	8	1584805	1584812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_017300	T	6	6	1585710	1585715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017300	ACT	2	6	1586196	1586201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017300	TC	3	6	1586271	1586276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_017300	ACA	2	6	1586370	1586375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017300	AGC	2	6	1587886	1587891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017300	GAT	2	6	1587952	1587957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017300	GCA	2	6	1588251	1588256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017300	GAA	2	6	1588267	1588272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017300	GGA	2	6	1588711	1588716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017300	TCC	2	6	1588744	1588749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_017300	TCT	2	6	1589400	1589405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017300	CTGG	2	8	1591154	1591161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_017300	GAC	2	6	1591965	1591970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017300	CGG	2	6	1592045	1592050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017300	GAA	2	6	1592066	1592071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017300	GTG	2	6	1592085	1592090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017300	GAG	2	6	1592197	1592202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017300	GCTG	2	8	1592222	1592229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_017300	CG	3	6	1592261	1592266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_017300	CAC	2	6	1592300	1592305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017300	AAG	2	6	1592403	1592408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017300	C	7	7	1592479	1592485	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4031	NC_017300	CGC	2	6	1592508	1592513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_017300	ACG	2	6	1592549	1592554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017300	GCT	2	6	1592562	1592567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017300	TCC	2	6	1592576	1592581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_017300	CCG	2	6	1592609	1592614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_017300	GCG	2	6	1592641	1592646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017300	CCT	2	6	1592741	1592746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_017300	CGA	2	6	1592763	1592768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017300	GAC	2	6	1592791	1592796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017300	GCA	2	6	1592893	1592898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017300	TCA	2	6	1592963	1592968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017300	CGT	2	6	1593012	1593017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017300	AGA	2	6	1593029	1593034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017300	CGA	2	6	1593036	1593041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017300	CGT	2	6	1593090	1593095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017300	GCC	2	6	1593152	1593157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_017300	CAT	2	6	1593636	1593641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4049	NC_017300	CGG	2	6	1593755	1593760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017300	TCG	2	6	1593842	1593847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017300	CTG	2	6	1593864	1593869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017300	CGA	2	6	1593882	1593887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017300	TCGA	2	8	1593892	1593899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_017300	CCT	2	6	1593923	1593928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_017300	CGA	2	6	1593936	1593941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017300	TGG	2	6	1593965	1593970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017300	CGC	2	6	1594023	1594028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_017300	GCG	2	6	1594052	1594057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017300	CTA	2	6	1594066	1594071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017300	GTT	2	6	1594074	1594079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017300	TCGA	2	8	1594174	1594181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_017300	GACC	2	8	1594204	1594211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_017300	AAGC	2	8	1594239	1594246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017300	AAC	2	6	1594321	1594326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017300	CTGA	2	8	1594353	1594360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_017300	CAC	2	6	1594427	1594432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4068	NC_017300	GAA	2	6	1594530	1594535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4070	NC_017300	GCC	2	6	1594552	1594557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4074	NC_017300	AGA	2	6	1594739	1594744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017300	CATC	2	8	1595195	1595202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4084	NC_017300	ACC	2	6	1595257	1595262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_017300	CAA	2	6	1597511	1597516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_017300	TCAT	2	8	1597850	1597857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4094	NC_017300	CTAT	2	8	1598075	1598082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_017300	GGC	2	6	1598127	1598132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4103	NC_017300	CG	3	6	1598656	1598661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_017300	GC	3	6	1598700	1598705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_017300	TCGA	2	8	1598743	1598750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_017300	GTG	2	6	1598759	1598764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017300	GCTG	2	8	1598805	1598812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_017300	AGG	2	6	1598822	1598827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017300	AACG	2	8	1598913	1598920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_017300	CTG	2	6	1598933	1598938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017300	TCG	2	6	1599121	1599126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017300	TGA	2	6	1599204	1599209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4114	NC_017300	CTG	2	6	1599319	1599324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_017300	TAC	2	6	1599576	1599581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017300	CGA	2	6	1599626	1599631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4120	NC_017300	TCG	2	6	1599723	1599728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017300	GAA	3	9	1599848	1599856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017300	CAA	2	6	1599875	1599880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017300	TTG	2	6	1599898	1599903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017300	GACC	2	8	1599989	1599996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_017300	ACC	2	6	1600053	1600058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017300	ACG	2	6	1600084	1600089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017300	CGA	2	6	1600142	1600147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017300	ATGT	2	8	1600227	1600234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017300	TCG	2	6	1600273	1600278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017300	AGC	2	6	1600321	1600326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017300	TTC	2	6	1600350	1600355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017300	CGA	2	6	1600409	1600414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017300	GGT	2	6	1600436	1600441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017300	AGAC	2	8	1602388	1602395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_017300	TACC	2	8	1602991	1602998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_017300	ATC	2	6	1603007	1603012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_017300	AGA	2	6	1603065	1603070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_017300	TCC	2	6	1603290	1603295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_017300	C	10	10	1603302	1603311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4140	NC_017300	GCA	2	6	1603315	1603320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_017300	GTT	2	6	1604153	1604158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_017300	CTT	2	6	1604384	1604389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_017300	AAG	2	6	1604418	1604423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_017300	CAA	2	6	1604487	1604492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_017300	GCGA	2	8	1604494	1604501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4147	NC_017300	GTT	2	6	1604511	1604516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_017300	CAA	2	6	1604602	1604607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4149	NC_017300	CCCA	2	8	1604624	1604631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4150	NC_017300	CAA	2	6	1604647	1604652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_017300	AGA	2	6	1604661	1604666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_017300	AT	3	6	1604951	1604956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_017300	TG	3	6	1604996	1605001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_017300	CGG	2	6	1605015	1605020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_017300	CA	3	6	1605094	1605099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4156	NC_017300	CT	3	6	1605110	1605115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4157	NC_017300	GCT	2	6	1605165	1605170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4158	NC_017300	CTAC	2	8	1605192	1605199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4159	NC_017300	CAG	2	6	1605259	1605264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4160	NC_017300	A	6	6	1605265	1605270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_017300	AAG	2	6	1605279	1605284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_017300	CA	3	6	1605555	1605560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4163	NC_017300	CCA	2	6	1605575	1605580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_017300	AACG	2	8	1605699	1605706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4165	NC_017300	C	9	9	1607944	1607952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4166	NC_017300	TGAA	2	8	1607956	1607963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_017300	TCCCC	2	10	1607994	1608003	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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4171	NC_017300	TAA	2	6	1609242	1609247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4172	NC_017300	AAGGC	2	10	1609256	1609265	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4174	NC_017300	GGC	2	6	1609290	1609295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4182	NC_017300	CCA	2	6	1612044	1612049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4188	NC_017300	TA	3	6	1615074	1615079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4201	NC_017300	TC	3	6	1617651	1617656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4202	NC_017300	CT	4	8	1617811	1617818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4203	NC_017300	TAA	2	6	1617840	1617845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4215	NC_017300	ACTC	2	8	1621521	1621528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4241	NC_017300	GCC	2	6	1640279	1640284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4242	NC_017300	CCG	2	6	1640316	1640321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4243	NC_017300	CTG	2	6	1640324	1640329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_017300	GCT	2	6	1640341	1640346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_017300	CTG	2	6	1640389	1640394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_017300	TCT	2	6	1640914	1640919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_017300	C	6	6	1640965	1640970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4249	NC_017300	GT	3	6	1640996	1641001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017300	TC	3	6	1641030	1641035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4251	NC_017300	GT	4	8	1643877	1643884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017300	ATC	2	6	1643910	1643915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_017300	TTTA	2	8	1643927	1643934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_017300	GCT	2	6	1643944	1643949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_017300	AAT	2	6	1643954	1643959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_017300	CAC	2	6	1644065	1644070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_017300	GAG	2	6	1644086	1644091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_017300	ATTA	2	8	1644164	1644171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_017300	CCA	2	6	1644241	1644246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_017300	AGC	2	6	1644248	1644253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_017300	CTG	2	6	1644280	1644285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_017300	CCG	2	6	1644295	1644300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_017300	TGGC	2	8	1644351	1644358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4264	NC_017300	CTG	2	6	1644370	1644375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_017300	GC	3	6	1644401	1644406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_017300	ACG	2	6	1644422	1644427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4268	NC_017300	GCT	2	6	1644495	1644500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4361	NC_017300	CCCA	2	8	1687335	1687342	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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4376	NC_017300	CATCA	2	10	1688400	1688409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4384	NC_017300	ATC	2	6	1688578	1688583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4385	NC_017300	A	6	6	1688591	1688596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_017300	GGT	2	6	1688616	1688621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4389	NC_017300	TCT	2	6	1688815	1688820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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