MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 6346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017300	CTT	2	6	424144	424149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017300	ATG	2	6	426312	426317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017300	AC	3	6	426420	426425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017300	TTGA	2	8	426938	426945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017300	TTCT	2	8	426971	426978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017300	GCA	2	6	427016	427021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017300	TCA	2	6	427033	427038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017300	TGT	2	6	427048	427053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017300	CAA	2	6	427233	427238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017300	GTT	2	6	427246	427251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017300	TGC	2	6	427324	427329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017300	GTT	2	6	427345	427350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017300	TGC	2	6	427397	427402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017300	TC	3	6	427560	427565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_017300	TGC	2	6	427691	427696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017300	TTC	2	6	427698	427703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017300	TGG	2	6	427756	427761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017300	CAC	2	6	427790	427795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017300	CG	3	6	427810	427815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_017300	TCT	2	6	427848	427853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017300	GGAA	2	8	427886	427893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017300	CGA	2	6	427895	427900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017300	GGT	2	6	427919	427924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017300	TGC	2	6	427973	427978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017300	GT	3	6	427990	427995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017300	GAA	2	6	428121	428126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017300	ATT	2	6	428127	428132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017300	GTG	2	6	428142	428147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017300	GC	3	6	428260	428265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017300	ATC	2	6	428379	428384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017300	GTT	2	6	428412	428417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017300	GAT	2	6	428427	428432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017300	GAA	2	6	428471	428476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017300	TGAG	2	8	428482	428489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017300	CGT	2	6	428493	428498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017300	CTG	2	6	428571	428576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017300	ATTCCG	2	12	428586	428597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017300	GGT	2	6	428634	428639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017300	TTTGG	2	10	428732	428741	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017300	CCG	2	6	428865	428870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_017300	GTAT	2	8	428873	428880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017300	GCT	2	6	428921	428926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017300	GCTAC	2	10	428997	429006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_017300	CTG	2	6	429062	429067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017300	GCT	2	6	429130	429135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017300	GTA	2	6	429182	429187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017300	ACCC	2	8	429221	429228	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_017300	AGGGCT	2	12	429769	429780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1049	NC_017300	GAA	2	6	429799	429804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017300	AAG	2	6	429830	429835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017300	CTT	2	6	429844	429849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017300	TTG	2	6	432105	432110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017300	CA	3	6	432153	432158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_017300	GTT	2	6	432159	432164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017300	CGA	2	6	432171	432176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017300	A	6	6	434454	434459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017300	GTT	2	6	434539	434544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017300	AG	3	6	434668	434673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017300	A	6	6	434686	434691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017300	TCG	2	6	434692	434697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017300	CCG	2	6	434711	434716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_017300	TAT	2	6	434754	434759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017300	GAT	2	6	434817	434822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017300	GCT	2	6	436328	436333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017300	AAG	2	6	436339	436344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017300	AAT	2	6	436379	436384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017300	CAT	2	6	436473	436478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017300	GAA	2	6	436524	436529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017300	T	6	6	436562	436567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017300	TCT	3	9	436590	436598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017300	ATC	2	6	436673	436678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017300	ATGC	2	8	436837	436844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017300	TCG	2	6	439580	439585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017300	TGG	2	6	439637	439642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017300	CTT	2	6	441596	441601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017300	TTA	2	6	443277	443282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017300	AGGA	2	8	443361	443368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017300	A	6	6	444929	444934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017300	GATGT	2	10	447554	447563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017300	CTTA	2	8	447621	447628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_017300	CGG	2	6	448522	448527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017300	TG	3	6	448552	448557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017300	CGA	2	6	448636	448641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017300	CTG	2	6	450358	450363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017300	TTC	2	6	451269	451274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017300	TGA	2	6	451314	451319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017300	AGT	2	6	451351	451356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017300	GGTGG	2	10	451440	451449	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017300	GA	3	6	452545	452550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017300	ATTG	2	8	452627	452634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017300	TAT	2	6	452661	452666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017300	GAT	2	6	452703	452708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017300	TCC	2	6	452711	452716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_017300	GCATC	2	10	452723	452732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_017300	GAT	2	6	452802	452807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017300	TGC	2	6	452864	452869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017300	CGCAA	2	10	452902	452911	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1098	NC_017300	TTG	2	6	452938	452943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017300	GTG	2	6	452958	452963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017300	GCA	2	6	452996	453001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017300	GTC	2	6	453062	453067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017300	TTG	2	6	453112	453117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017300	GCG	2	6	453125	453130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017300	GCC	2	6	453638	453643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_017300	CGT	2	6	453655	453660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017300	GCTGT	2	10	453669	453678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_017300	ACA	2	6	453714	453719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017300	CGT	2	6	454230	454235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017300	TAT	2	6	454268	454273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017300	TAT	2	6	454280	454285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017300	G	8	8	454447	454454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017300	CAC	2	6	455542	455547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017300	AAC	2	6	455551	455556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017300	ACA	2	6	455620	455625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017300	CAA	2	6	455629	455634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017300	ACG	2	6	461500	461505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017300	AGCC	2	8	461521	461528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017300	AAG	2	6	461614	461619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017300	TA	3	6	461691	461696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017300	CGCA	2	8	461715	461722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017300	GAT	2	6	461746	461751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017300	TCG	2	6	461783	461788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017300	TGA	2	6	461808	461813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017300	CGT	2	6	461847	461852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017300	TCG	2	6	461964	461969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017300	GCC	2	6	462001	462006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_017300	TCA	2	6	462191	462196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017300	AGGTG	2	10	462216	462225	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017300	CGG	2	6	462267	462272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017300	GTA	2	6	462274	462279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017300	GCTC	2	8	462352	462359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017300	GGC	2	6	462382	462387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017300	GCC	2	6	462445	462450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1403	NC_017300	CGAGC	2	10	578792	578801	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1404	NC_017300	CGT	2	6	578869	578874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_017300	TCG	2	6	578952	578957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_017300	CGCA	2	8	579032	579039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1407	NC_017300	CTC	2	6	579053	579058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_017300	GCA	2	6	579085	579090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_017300	TCA	2	6	579580	579585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_017300	CGA	2	6	579638	579643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_017300	G	7	7	579694	579700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_017300	TTTG	2	8	579811	579818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_017300	GAA	2	6	579840	579845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_017300	TCC	2	6	579895	579900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1430	NC_017300	TGA	2	6	580050	580055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_017300	GC	3	6	580297	580302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1433	NC_017300	TCG	2	6	580331	580336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_017300	GC	3	6	580368	580373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1435	NC_017300	CAC	2	6	580452	580457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1437	NC_017300	CAC	2	6	580601	580606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1438	NC_017300	GC	3	6	580624	580629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1439	NC_017300	GGT	2	6	580641	580646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_017300	GTA	2	6	580668	580673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_017300	GC	3	6	580719	580724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_017300	TAA	2	6	580755	580760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_017300	GCTT	2	8	580918	580925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1448	NC_017300	GAA	2	6	580941	580946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_017300	CTG	2	6	580971	580976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1453	NC_017300	TGC	2	6	581173	581178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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