MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 6346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017300	CTCCC	2	10	2228425	2228434	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6002	NC_017300	TCA	2	6	2228479	2228484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017300	GGT	2	6	2228504	2228509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017300	CAG	2	6	2228523	2228528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017300	GCT	2	6	2228542	2228547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_017300	CA	3	6	2228572	2228577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_017300	CAC	2	6	2228623	2228628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_017300	CA	3	6	2228678	2228683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_017300	CA	3	6	2228695	2228700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_017300	CGTT	2	8	2228747	2228754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_017300	ACT	2	6	2228759	2228764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017300	TCT	2	6	2228784	2228789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_017300	CA	3	6	2228862	2228867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_017300	A	6	6	2228997	2229002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017300	AC	3	6	2229005	2229010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_017300	CAAA	2	8	2229018	2229025	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_017300	A	6	6	2229023	2229028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017300	ATT	2	6	2229053	2229058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017300	CA	3	6	2229082	2229087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017300	ACC	2	6	2229093	2229098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_017300	CAC	2	6	2229099	2229104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_017300	CAA	3	9	2229107	2229115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017300	CA	3	6	2229118	2229123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_017300	CAC	2	6	2229128	2229133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_017300	CAA	2	6	2229139	2229144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017300	CAT	2	6	2229172	2229177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_017300	CAACA	2	10	2229199	2229208	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6029	NC_017300	CAACA	2	10	2229227	2229236	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6030	NC_017300	CA	3	6	2229235	2229240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_017300	ACA	3	9	2229238	2229246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_017300	CA	3	6	2229253	2229258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_017300	CCA	2	6	2229270	2229275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_017300	AGC	2	6	2229282	2229287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017300	CA	4	8	2229295	2229302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_017300	A	7	7	2229322	2229328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017300	ACA	2	6	2229332	2229337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017300	ACCA	2	8	2229341	2229348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6040	NC_017300	AGG	2	6	2229380	2229385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017300	C	6	6	2229461	2229466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6042	NC_017300	TGACG	2	10	2229510	2229519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6043	NC_017300	GT	3	6	2229524	2229529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017300	TG	3	6	2229693	2229698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017300	ATG	2	6	2229719	2229724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6047	NC_017300	TC	3	6	2229767	2229772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_017300	CCA	2	6	2229781	2229786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_017300	CACGA	2	10	2229846	2229855	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6050	NC_017300	GAC	2	6	2229859	2229864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6052	NC_017300	TTC	2	6	2229945	2229950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6056	NC_017300	GAC	2	6	2230323	2230328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6058	NC_017300	GCT	2	6	2230400	2230405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017300	CTT	2	6	2230425	2230430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017300	CTG	2	6	2230549	2230554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_017300	CAA	2	6	2230652	2230657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_017300	A	6	6	2230688	2230693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017300	CCA	2	6	2230698	2230703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_017300	CA	4	8	2230702	2230709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_017300	CGC	2	6	2230854	2230859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6067	NC_017300	ACCA	2	8	2230916	2230923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_017300	CCAA	2	8	2230939	2230946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_017300	A	6	6	2230954	2230959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017300	CAAC	2	8	2230964	2230971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_017300	A	7	7	2230972	2230978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017300	TGC	2	6	2231308	2231313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_017300	A	6	6	2231348	2231353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017300	TAT	2	6	2231354	2231359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6080	NC_017300	TG	3	6	2231510	2231515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017300	GTCG	2	8	2231540	2231547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6083	NC_017300	CAACA	2	10	2231576	2231585	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6084	NC_017300	CA	3	6	2231584	2231589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_017300	TAAC	2	8	2233937	2233944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6088	NC_017300	A	6	6	2234018	2234023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017300	CGA	2	6	2234039	2234044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_017300	ATG	2	6	2234085	2234090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_017300	CTG	2	6	2235587	2235592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_017300	GCCG	2	8	2236721	2236728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_017300	AT	3	6	2236779	2236784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_017300	GAA	2	6	2236910	2236915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017300	TA	3	6	2236918	2236923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017300	CG	3	6	2237112	2237117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_017300	CTC	2	6	2237500	2237505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6104	NC_017300	TTG	2	6	2237571	2237576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017300	ACA	2	6	2237589	2237594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_017300	CTT	2	6	2237595	2237600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_017300	GCTT	2	8	2240415	2240422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6119	NC_017300	ATGCA	2	10	2245912	2245921	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6120	NC_017300	AATA	2	8	2245943	2245950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017300	CAT	2	6	2245962	2245967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6127	NC_017300	GTG	2	6	2246636	2246641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017300	CTTT	2	8	2247230	2247237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_017300	TG	3	6	2247259	2247264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017300	TTC	2	6	2247276	2247281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017300	GAA	2	6	2247326	2247331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017300	CAG	2	6	2247341	2247346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_017300	AGCCT	2	10	2247895	2247904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6134	NC_017300	TA	3	6	2249729	2249734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_017300	AAT	2	6	2249735	2249740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_017300	TGCA	2	8	2249782	2249789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6143	NC_017300	GT	3	6	2252307	2252312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6147	NC_017300	AAG	2	6	2252848	2252853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6154	NC_017300	TGC	2	6	2253507	2253512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6161	NC_017300	TCC	2	6	2263221	2263226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6165	NC_017300	CCA	2	6	2263349	2263354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6169	NC_017300	A	6	6	2263784	2263789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6179	NC_017300	TAA	2	6	2267720	2267725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6182	NC_017300	CAG	2	6	2268179	2268184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6229	NC_017300	ATTT	2	8	2291331	2291338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6243	NC_017300	TCC	2	6	2296526	2296531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6250	NC_017300	CCA	2	6	2297003	2297008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6251	NC_017300	CGT	2	6	2297117	2297122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6253	NC_017300	CGCC	2	8	2297297	2297304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6254	NC_017300	TCT	2	6	2297491	2297496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_017300	CGC	2	6	2297505	2297510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_017300	T	6	6	2298480	2298485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_017300	GAT	2	6	2298489	2298494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_017300	ATA	2	6	2298503	2298508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_017300	GGGCC	2	10	2298511	2298520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6261	NC_017300	CCAGC	2	10	2298533	2298542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6262	NC_017300	TTTA	2	8	2298545	2298552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_017300	AGG	2	6	2299911	2299916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_017300	GCC	2	6	2299952	2299957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6269	NC_017300	A	6	6	2300217	2300222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_017300	CGGC	2	8	2300253	2300260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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