MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 1485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	GGTAA	2	10	9497	9506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017297	TCGTG	2	10	10288	10297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017297	TAAGT	2	10	12027	12036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017297	AAAAT	2	10	13878	13887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017297	ATTAT	2	10	22264	22273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017297	ATTAA	2	10	23668	23677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017297	TATTT	2	10	23740	23749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017297	ATATA	2	10	29348	29357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017297	ATATT	2	10	32957	32966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017297	AATAA	2	10	33015	33024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017297	TAATA	2	10	36567	36576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017297	ATAAA	2	10	37049	37058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017297	GGTAA	2	10	44121	44130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017297	TCGTG	2	10	44912	44921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017297	TAAGT	2	10	46651	46660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017297	AAAAT	2	10	48502	48511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017297	GGTAA	2	10	50639	50648	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017297	TCGTG	2	10	51430	51439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017297	TAAGT	2	10	53169	53178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017297	AAAAT	2	10	55020	55029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017297	TTATA	2	10	55518	55527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017297	GGTAA	2	10	58504	58513	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017297	TCGTG	2	10	59295	59304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017297	TAAGT	2	10	61034	61043	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017297	AAAAT	2	10	62885	62894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017297	TTATA	2	10	64616	64625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017297	GGTAA	2	10	65511	65520	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017297	TCGTG	2	10	66302	66311	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017297	TAAGT	2	10	68041	68050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017297	AAAAT	2	10	69892	69901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017297	ATTAT	2	10	71139	71148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017297	GGTAA	2	10	71791	71800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017297	TCGTG	2	10	72582	72591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017297	TAAGT	2	10	74321	74330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017297	AAAAT	2	10	76172	76181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017297	TTGAA	2	10	77510	77519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017297	GAATA	2	10	81595	81604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017297	AGGAT	2	10	88253	88262	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017297	AATGG	2	10	88500	88509	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017297	AAATT	2	10	88685	88694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017297	AAAGA	2	10	89241	89250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017297	AAGAA	2	10	89366	89375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017297	ATTTA	2	10	90337	90346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017297	TACAA	2	10	90595	90604	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017297	TTTAA	2	10	91002	91011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017297	AAGTT	2	10	91896	91905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017297	TATAA	2	10	94452	94461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017297	ATTTT	2	10	95523	95532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017297	TAATA	2	10	95995	96004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017297	TTATG	2	10	114924	114933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017297	GAAAT	2	10	115623	115632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017297	TTCTA	2	10	120950	120959	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017297	GAAAG	2	10	129071	129080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017297	ATAAA	2	10	129438	129447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017297	ATTAT	2	10	129568	129577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017297	TAATT	2	10	129970	129979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017297	TTATG	2	10	131631	131640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017297	ACAAA	2	10	134210	134219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017297	ATTTT	2	10	136543	136552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017297	TTTAA	2	10	138035	138044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017297	ACTTA	2	10	149576	149585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017297	ATAAA	2	10	160940	160949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017297	TAATA	2	10	169124	169133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017297	ATATA	2	10	171642	171651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017297	AAATA	2	10	180179	180188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017297	ATAAA	2	10	180192	180201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017297	ATTAT	2	10	180215	180224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017297	TAATT	2	10	182012	182021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017297	GTCTA	2	10	191135	191144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017297	TATTT	2	10	191255	191264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017297	AAATA	2	10	195188	195197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017297	TAAAG	2	10	195782	195791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017297	TTTTA	2	10	198980	198989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017297	TATTT	2	10	206489	206498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017297	TAATT	2	10	208053	208062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017297	TTTAT	2	10	211433	211442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017297	AGAAA	2	10	214881	214890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017297	AAAAT	2	10	215287	215296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017297	GATTT	2	10	218924	218933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017297	TAAAA	2	10	222485	222494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017297	TAAAA	2	10	222576	222585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017297	AAATT	2	10	225409	225418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017297	ATTAT	2	10	227927	227936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017297	ATTTA	2	10	228369	228378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017297	TAATT	2	10	232477	232486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017297	TTTTG	2	10	236755	236764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017297	ATTAT	2	10	239140	239149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017297	TAAAT	2	10	243849	243858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017297	ATTTT	2	10	249837	249846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017297	TTTAT	2	10	249854	249863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017297	AATTT	2	10	251332	251341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017297	TAATT	2	10	262943	262952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017297	GGTTT	2	10	264094	264103	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017297	AATTT	2	10	272229	272238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017297	ATTTT	2	10	275731	275740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017297	TATAT	2	10	276193	276202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017297	ATATT	2	10	277628	277637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017297	TTTTA	2	10	278265	278274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017297	ATAGT	2	10	278361	278370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017297	GAAAA	2	10	280284	280293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017297	TATAA	2	10	280391	280400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017297	TTAAT	2	10	282468	282477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017297	ATTCC	2	10	283342	283351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017297	ATTAT	2	10	287038	287047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017297	TTAAA	2	10	296018	296027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017297	ATTAA	2	10	297594	297603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017297	AAATA	2	10	302840	302849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017297	AAAGC	2	10	304605	304614	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017297	TGGAA	2	10	304707	304716	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017297	AACTA	2	10	305085	305094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017297	AAAAT	2	10	305198	305207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017297	ATATA	2	10	306135	306144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017297	CTTAT	2	10	310696	310705	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017297	ACTTT	2	10	310968	310977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017297	TTATA	2	10	321367	321376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017297	AATAA	2	10	326480	326489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017297	ATTAT	2	10	331966	331975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017297	ATACC	2	10	333137	333146	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017297	TAACT	2	10	335371	335380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017297	AAAAT	2	10	335628	335637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017297	ATATA	2	10	337905	337914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017297	ATGTA	2	10	351355	351364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017297	ATATA	2	10	351419	351428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017297	ATTAG	2	10	353471	353480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017297	GTAAA	2	10	353601	353610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017297	TTTAG	2	10	360060	360069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017297	ATAAA	2	10	360116	360125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017297	ATATA	2	10	360135	360144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017297	TTATT	2	10	361358	361367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017297	TATTT	2	10	376705	376714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017297	ATTAT	2	10	376754	376763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017297	ACTAT	2	10	378717	378726	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017297	TTATT	2	10	383374	383383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017297	TTTTA	2	10	383493	383502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017297	TAGCT	2	10	384563	384572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017297	TTTTA	2	10	384657	384666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017297	TCAAT	2	10	384796	384805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017297	ATATA	2	10	384885	384894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017297	GTTAA	2	10	385556	385565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017297	AATAA	2	10	385573	385582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017297	AATAA	2	10	386953	386962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017297	ATTTA	2	10	388726	388735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017297	TTATT	2	10	391149	391158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017297	AAGAA	2	10	391660	391669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017297	AAACA	2	10	393509	393518	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017297	AATTT	2	10	399508	399517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017297	TTTAA	2	10	401527	401536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017297	AAATA	2	10	404504	404513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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