MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 chromosome

Total Repeats: 4111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017297	TTAT	2	8	1369	1376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017297	TAAT	2	8	2987	2994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017297	CTTC	2	8	9321	9328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017297	GGTA	2	8	10457	10464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017297	TTCT	2	8	10783	10790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017297	GTTT	2	8	10852	10859	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017297	AGAA	2	8	11196	11203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017297	AGGT	2	8	12626	12633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017297	TGCT	2	8	13013	13020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017297	AATT	2	8	19373	19380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017297	TATT	2	8	22301	22308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017297	AATA	2	8	22318	22325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017297	TAAA	2	8	23717	23724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017297	AAAG	2	8	24315	24322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017297	ATAA	2	8	25989	25996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017297	TAAA	2	8	28651	28658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017297	TAAA	2	8	32374	32381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017297	AATA	2	8	32406	32413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017297	TATT	2	8	32921	32928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017297	GGAA	2	8	33299	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017297	TTAA	2	8	43531	43538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017297	GATA	2	8	43681	43688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017297	CTTC	2	8	43945	43952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017297	GGTA	2	8	45081	45088	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017297	TTCT	2	8	45407	45414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017297	GTTT	2	8	45476	45483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017297	AGAA	2	8	45820	45827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017297	AGGT	2	8	47250	47257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017297	TGCT	2	8	47637	47644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017297	AAAT	2	8	48548	48555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017297	TCCT	2	8	49565	49572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017297	TAGT	2	8	49841	49848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017297	CTTC	2	8	50463	50470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017297	GGTA	2	8	51599	51606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017297	TTCT	2	8	51925	51932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017297	GTTT	2	8	51994	52001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017297	AGAA	2	8	52338	52345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017297	AGGT	2	8	53768	53775	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017297	TGCT	2	8	54155	54162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017297	AAAT	2	8	55066	55073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017297	AAAT	2	8	55385	55392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017297	TCTA	2	8	55447	55454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017297	ATTT	2	8	57656	57663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017297	GAAA	2	8	58058	58065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017297	CTTC	2	8	58328	58335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017297	GGTA	2	8	59464	59471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017297	TTCT	2	8	59790	59797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017297	GTTT	2	8	59859	59866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017297	AGAA	2	8	60203	60210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017297	AGGT	2	8	61633	61640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017297	TGCT	2	8	62020	62027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017297	AAAT	2	8	62931	62938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017297	ATGC	2	8	63570	63577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017297	TAAA	2	8	64647	64654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017297	CTTC	2	8	65335	65342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017297	GGTA	2	8	66471	66478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017297	TTCT	2	8	66797	66804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017297	GTTT	2	8	66866	66873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017297	AGAA	2	8	67210	67217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017297	AGGT	2	8	68640	68647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017297	TGCT	2	8	69027	69034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017297	AAAT	2	8	69938	69945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017297	AAAT	2	8	70256	70263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017297	GTAT	2	8	71075	71082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017297	AAAT	2	8	71234	71241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017297	ATGA	2	8	71348	71355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017297	CTTC	2	8	71615	71622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017297	GGTA	2	8	72751	72758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017297	TTCT	2	8	73077	73084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017297	GTTT	2	8	73146	73153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017297	AGAA	2	8	73490	73497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017297	AGGT	2	8	74920	74927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017297	TGCT	2	8	75307	75314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017297	AAAT	2	8	76218	76225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017297	AAAT	2	8	76548	76555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017297	ATTT	2	8	79613	79620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017297	AACA	2	8	79658	79665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017297	AGGA	2	8	87804	87811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017297	ATTT	2	8	89065	89072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017297	GAAA	2	8	89379	89386	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017297	TAAT	2	8	89902	89909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017297	ATTA	2	8	90350	90357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017297	ATAA	2	8	90842	90849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017297	ACAT	2	8	90932	90939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017297	ATTT	2	8	91737	91744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017297	ATAA	2	8	94093	94100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017297	CTGT	2	8	94407	94414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017297	AAAG	2	8	94695	94702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017297	GAAT	2	8	94830	94837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017297	TAGC	2	8	95136	95143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017297	CATA	2	8	95144	95151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017297	TAAA	2	8	98829	98836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017297	ATTT	2	8	102387	102394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017297	TAAA	2	8	105065	105072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017297	TTTA	2	8	105101	105108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017297	GTGG	2	8	106459	106466	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017297	AAGA	2	8	106715	106722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017297	ATGA	2	8	106735	106742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017297	AGAA	2	8	106782	106789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017297	GAAT	2	8	106914	106921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017297	AGAT	2	8	109845	109852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017297	ATTA	2	8	110855	110862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017297	TAAA	2	8	110935	110942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017297	TTAC	2	8	114465	114472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017297	TAAA	2	8	115217	115224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017297	AATG	2	8	115269	115276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017297	ATTT	2	8	115433	115440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017297	ATTA	2	8	115865	115872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017297	AATT	2	8	115877	115884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017297	TAAT	2	8	115956	115963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017297	ATTA	2	8	117924	117931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017297	TATT	2	8	117945	117952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017297	AAGC	2	8	120935	120942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017297	AGAA	2	8	121184	121191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017297	ATAA	2	8	123037	123044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017297	AGTT	2	8	123055	123062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017297	ATTA	2	8	123090	123097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017297	ATAA	2	8	123116	123123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017297	GATT	2	8	123190	123197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017297	AAGT	2	8	123282	123289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017297	AATA	2	8	126704	126711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017297	GAAT	2	8	127998	128005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017297	TAAA	2	8	128349	128356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017297	TCAA	2	8	128593	128600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017297	GGAA	2	8	128700	128707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017297	AATT	2	8	129174	129181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017297	TAGA	2	8	129393	129400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017297	AATA	2	8	129601	129608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017297	AAAT	2	8	130320	130327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017297	AGAT	2	8	130470	130477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017297	AAAG	2	8	130680	130687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017297	AAAT	2	8	131186	131193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017297	ATAA	2	8	131548	131555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017297	ATAA	2	8	133314	133321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017297	ATTA	2	8	133383	133390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017297	ATAA	2	8	133614	133621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017297	AAAT	2	8	134501	134508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017297	GGGA	2	8	136556	136563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017297	TATT	2	8	138006	138013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017297	ATTA	2	8	139442	139449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017297	TAAA	2	8	139801	139808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017297	TTCT	2	8	140011	140018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017297	ATTT	2	8	140095	140102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017297	ATTT	2	8	140254	140261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017297	TGAA	2	8	140515	140522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017297	TAAA	2	8	144036	144043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017297	TAAA	2	8	144069	144076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017297	TGAT	2	8	146528	146535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017297	GGGA	2	8	147980	147987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017297	TACA	2	8	154451	154458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017297	AGTA	2	8	157543	157550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017297	TAAA	2	8	161038	161045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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