MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	CT	3	6	469	474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017293	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017293	CT	3	6	1053	1058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017293	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017293	CG	3	6	1581	1586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017293	GC	3	6	2868	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017293	GC	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017293	GC	3	6	5042	5047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017293	GC	3	6	5114	5119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017293	GC	3	6	8241	8246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017293	GC	3	6	8309	8314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017293	GA	3	6	8839	8844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017293	GC	3	6	9251	9256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017293	CA	4	8	11975	11982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017293	GC	3	6	15296	15301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017293	CG	3	6	15437	15442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017293	CA	3	6	15574	15579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017293	GC	4	8	15719	15726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017293	GC	3	6	16325	16330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017293	GC	3	6	16400	16405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017293	AT	3	6	21754	21759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017293	GC	3	6	22033	22038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017293	GA	3	6	28011	28016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017293	AC	3	6	28139	28144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017293	GC	3	6	28373	28378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017293	AT	3	6	28513	28518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017293	GC	3	6	28871	28876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017293	TC	3	6	29167	29172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017293	AC	3	6	29301	29306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017293	GT	3	6	31165	31170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017293	GC	3	6	31299	31304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017293	CG	3	6	32181	32186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017293	GA	3	6	34033	34038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017293	TG	3	6	34508	34513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017293	CA	4	8	34526	34533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017293	CA	3	6	35936	35941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017293	GA	3	6	37555	37560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017293	GA	3	6	37595	37600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017293	GT	3	6	37890	37895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017293	GC	3	6	37913	37918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017293	CG	3	6	38314	38319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017293	CG	4	8	38529	38536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017293	GC	3	6	44580	44585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017293	GA	3	6	45366	45371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017293	TA	3	6	45726	45731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017293	CA	3	6	45872	45877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017293	GC	3	6	45885	45890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017293	TG	3	6	47626	47631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017293	CT	3	6	48212	48217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017293	CT	3	6	52014	52019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017293	AC	3	6	52686	52691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017293	GC	3	6	52714	52719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017293	CG	3	6	52987	52992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017293	CG	3	6	53799	53804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017293	CG	3	6	56956	56961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017293	TG	3	6	57169	57174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017293	GC	3	6	57495	57500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017293	CG	3	6	57697	57702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017293	GC	3	6	57808	57813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017293	GA	3	6	57900	57905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017293	GC	3	6	58418	58423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017293	GC	3	6	58640	58645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017293	GC	4	8	60175	60182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017293	GC	3	6	62428	62433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017293	GC	3	6	62491	62496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017293	AC	3	6	63232	63237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017293	GC	3	6	63626	63631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017293	TG	3	6	64028	64033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017293	GC	3	6	65824	65829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017293	GC	3	6	65839	65844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017293	GC	3	6	66066	66071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017293	GC	4	8	66434	66441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017293	GC	3	6	67177	67182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017293	CA	3	6	67529	67534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017293	GC	3	6	67549	67554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017293	GC	3	6	67740	67745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017293	GC	3	6	67840	67845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017293	GC	3	6	68230	68235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017293	GC	3	6	68437	68442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017293	CG	3	6	68545	68550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017293	AG	3	6	73106	73111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017293	CG	3	6	73203	73208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017293	TG	3	6	81989	81994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017293	GC	3	6	83902	83907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017293	CG	3	6	85827	85832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017293	CG	3	6	85862	85867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017293	CG	3	6	85944	85949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017293	CG	3	6	102868	102873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017293	CG	3	6	103831	103836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017293	AC	3	6	103966	103971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017293	GT	3	6	105830	105835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017293	GA	3	6	105964	105969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017293	GC	3	6	106260	106265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017293	TA	3	6	106617	106622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017293	GC	3	6	106758	106763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017293	GT	3	6	106992	106997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017293	CT	3	6	107119	107124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017293	GC	3	6	110987	110992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017293	GC	3	6	111189	111194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017293	AG	3	6	111352	111357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017293	GC	3	6	114783	114788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017293	TG	3	6	114968	114973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017293	CT	3	6	115229	115234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017293	CA	3	6	116598	116603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017293	GC	3	6	116797	116802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017293	GC	3	6	116847	116852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017293	GC	3	6	117197	117202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017293	CG	3	6	118344	118349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017293	GC	3	6	118381	118386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017293	TG	3	6	121516	121521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017293	GC	4	8	121794	121801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017293	GC	3	6	123033	123038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017293	TG	3	6	124876	124881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017293	GC	3	6	126856	126861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017293	AC	3	6	126950	126955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017293	GC	3	6	128422	128427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017293	GC	4	8	128490	128497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017293	GC	3	6	129018	129023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017293	AC	3	6	129290	129295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017293	GC	3	6	130217	130222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017293	CG	3	6	130630	130635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017293	GC	3	6	135503	135508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017293	GC	3	6	135712	135717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017293	AG	3	6	135746	135751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017293	AC	3	6	136068	136073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017293	CT	3	6	136290	136295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017293	GC	3	6	136404	136409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017293	GC	3	6	136520	136525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.