MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	TCT	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017293	CGG	2	6	120	125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017293	GTT	2	6	172	177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017293	GCA	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017293	GTT	2	6	579	584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017293	CCT	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017293	CGT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017293	GCT	2	6	688	693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017293	GCA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017293	TGC	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017293	GCA	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017293	CAC	2	6	858	863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017293	ACG	2	6	919	924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017293	GGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017293	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017293	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017293	CGA	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017293	TAG	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017293	ACT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017293	GTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017293	AAC	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017293	TGC	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017293	GCA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017293	GGA	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017293	AAC	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017293	ATG	2	6	1568	1573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017293	CTG	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017293	CAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017293	GAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017293	TGC	2	6	2614	2619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017293	AGG	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017293	GCC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017293	ACG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017293	CAG	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017293	TGC	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017293	TGG	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017293	CCT	2	6	3433	3438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017293	TGC	2	6	3465	3470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017293	GCG	2	6	3480	3485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017293	CAA	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017293	ACG	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017293	ACG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017293	TGC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017293	CTT	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017293	GCG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017293	GTT	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017293	ACG	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017293	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017293	ACT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017293	CAA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017293	CGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017293	TGC	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017293	AGC	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017293	TCG	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017293	CTG	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017293	TGC	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017293	GCT	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017293	GAT	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017293	GCT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017293	GAG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017293	AGC	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017293	ACA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017293	GCA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017293	GCC	2	6	5009	5014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017293	TGG	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017293	CGG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017293	TGA	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017293	CGC	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017293	AGC	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017293	TGG	2	6	8161	8166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017293	CTG	2	6	8286	8291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017293	CCT	2	6	8357	8362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017293	TGG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017293	CAG	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017293	GCT	2	6	8533	8538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017293	CCA	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017293	GCT	2	6	8621	8626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017293	CAA	2	6	8675	8680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017293	AGG	2	6	8788	8793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017293	GCC	2	6	8826	8831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017293	CCT	2	6	8853	8858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017293	TGC	3	9	8902	8910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017293	TGC	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017293	GCC	2	6	8951	8956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017293	GCA	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017293	CTG	2	6	9005	9010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017293	CAG	2	6	9050	9055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017293	TAG	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017293	GTC	2	6	9261	9266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017293	CAT	2	6	9566	9571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017293	GCT	2	6	11891	11896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017293	CGC	2	6	11942	11947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017293	CAG	2	6	11967	11972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017293	CGC	2	6	14907	14912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017293	ACC	2	6	14946	14951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017293	CTG	2	6	14987	14992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017293	AGC	2	6	15283	15288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017293	GTA	2	6	15421	15426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017293	GCT	2	6	15521	15526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017293	GCA	2	6	15864	15869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017293	GGC	2	6	15904	15909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017293	GCA	2	6	16039	16044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017293	TGG	2	6	16055	16060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017293	TGC	2	6	16143	16148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017293	ACT	2	6	16355	16360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017293	CGG	2	6	16376	16381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017293	GAA	2	6	16391	16396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017293	GTT	2	6	18108	18113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017293	CGC	2	6	18482	18487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017293	CAC	2	6	21802	21807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017293	GCC	2	6	21969	21974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017293	AGC	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017293	TTG	2	6	26304	26309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017293	GTG	2	6	26336	26341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017293	GGT	3	9	26366	26374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017293	GTG	2	6	26461	26466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017293	GGC	2	6	26491	26496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017293	TGT	2	6	26502	26507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017293	CTA	2	6	26517	26522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017293	GGC	2	6	26554	26559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017293	CCG	2	6	26564	26569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017293	GCA	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017293	TGG	2	6	26833	26838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017293	GCA	2	6	26929	26934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017293	ATA	2	6	27007	27012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017293	CCA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017293	GCA	2	6	27098	27103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017293	GAA	2	6	27157	27162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017293	CAG	2	6	27266	27271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017293	GGA	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017293	GAG	2	6	27634	27639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017293	GAT	2	6	27694	27699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017293	GAA	2	6	27722	27727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017293	TGC	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017293	GTC	2	6	27812	27817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017293	AGG	2	6	27921	27926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017293	GAC	2	6	27932	27937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017293	TCA	2	6	27944	27949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017293	AGC	2	6	28179	28184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017293	AGG	2	6	28207	28212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017293	CCT	2	6	28285	28290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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