MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017293	TGT	2	6	53870	53875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017293	AGC	2	6	54750	54755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017293	GCC	2	6	54779	54784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017293	GCA	2	6	54889	54894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017293	GCA	2	6	54935	54940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017293	GTC	2	6	54995	55000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017293	TAG	2	6	56375	56380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017293	GCCAT	2	10	56417	56426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
509	NC_017293	CTG	2	6	56433	56438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017293	GCG	2	6	56556	56561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017293	ATT	2	6	56566	56571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017293	GCA	2	6	56694	56699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017293	CCA	2	6	56700	56705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017293	AGG	2	6	56800	56805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017293	GCA	2	6	56872	56877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017293	AGG	2	6	56914	56919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017293	CG	3	6	56956	56961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017293	AGC	2	6	57051	57056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017293	GTG	2	6	57088	57093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017293	CGG	2	6	57128	57133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017293	TG	3	6	57169	57174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017293	TGG	2	6	57266	57271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017293	GAC	2	6	57287	57292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017293	AGC	2	6	57378	57383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017293	AGCC	2	8	57453	57460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_017293	GC	3	6	57495	57500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_017293	AAG	2	6	57507	57512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017293	GCG	2	6	57524	57529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017293	GTG	2	6	57575	57580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017293	AACA	2	8	57614	57621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_017293	CG	3	6	57697	57702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017293	AGCGA	2	10	57714	57723	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
533	NC_017293	GC	3	6	57808	57813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017293	CGG	2	6	57837	57842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017293	CTG	2	6	57880	57885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017293	CGC	2	6	57886	57891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_017293	GA	3	6	57900	57905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017293	CATC	2	8	57966	57973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017293	AGA	2	6	58175	58180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017293	TGA	2	6	58265	58270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017293	GC	3	6	58418	58423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017293	CGCACC	2	12	58471	58482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017293	GAC	2	6	58530	58535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017293	GGC	2	6	58574	58579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017293	GCA	2	6	58632	58637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017293	GC	3	6	58640	58645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_017293	GTGC	2	8	58691	58698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_017293	AGC	3	9	58781	58789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017293	ACT	2	6	59793	59798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017293	GCT	2	6	59823	59828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017293	GTT	2	6	59923	59928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017293	GCT	2	6	59929	59934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017293	CAA	2	6	59956	59961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017293	GCC	2	6	60014	60019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017293	CGT	2	6	60058	60063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017293	ATGTA	2	10	60115	60124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017293	GTG	3	9	60146	60154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017293	GC	4	8	60175	60182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_017293	TTG	2	6	60185	60190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017293	TGG	2	6	60223	60228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017293	CAG	2	6	60260	60265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017293	TGGA	2	8	60328	60335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017293	GCG	2	6	60411	60416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017293	ACG	2	6	60487	60492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017293	CTG	2	6	62042	62047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017293	CTAC	2	8	62118	62125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017293	CGT	2	6	62190	62195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017293	CTGC	2	8	62360	62367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017293	CGC	2	6	62383	62388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017293	TGC	2	6	62402	62407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017293	GC	3	6	62428	62433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017293	GAC	2	6	62471	62476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017293	GC	3	6	62491	62496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017293	AGC	2	6	62505	62510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017293	GCAG	2	8	62559	62566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
576	NC_017293	GCA	2	6	62668	62673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017293	CTC	2	6	62698	62703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017293	ACA	2	6	62842	62847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017293	AGG	2	6	62864	62869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017293	ACA	2	6	62873	62878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017293	GACA	2	8	63223	63230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_017293	AC	3	6	63232	63237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017293	ATG	2	6	63253	63258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017293	ATA	2	6	63293	63298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017293	GCAT	2	8	63319	63326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017293	GCA	2	6	63371	63376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017293	CAG	2	6	63488	63493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017293	GCC	2	6	63550	63555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017293	ACC	2	6	63556	63561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_017293	TGC	2	6	63573	63578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017293	GC	3	6	63626	63631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_017293	TAA	2	6	63667	63672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017293	GGC	2	6	63717	63722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017293	GCA	2	6	63751	63756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017293	CCGCAT	2	12	63814	63825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
596	NC_017293	CAG	2	6	63908	63913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017293	ACCAT	2	10	63934	63943	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
598	NC_017293	CCG	2	6	64015	64020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017293	TG	3	6	64028	64033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017293	AGC	2	6	64039	64044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017293	TGC	2	6	64077	64082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017293	CAGCT	2	10	65705	65714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
603	NC_017293	AGTA	2	8	65732	65739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017293	CGA	2	6	65755	65760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017293	CAC	2	6	65761	65766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017293	GC	3	6	65824	65829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_017293	AGC	2	6	65832	65837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017293	GC	3	6	65839	65844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017293	AGC	2	6	65886	65891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017293	CCAGC	2	10	65909	65918	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
611	NC_017293	TGC	2	6	65923	65928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017293	GCT	2	6	65967	65972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017293	ATGC	2	8	66009	66016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017293	GCA	2	6	66024	66029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017293	CAC	2	6	66041	66046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_017293	GC	3	6	66066	66071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_017293	GCGG	2	8	66137	66144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
618	NC_017293	AGC	2	6	66149	66154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017293	TGCAT	2	10	66164	66173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
620	NC_017293	GCAGA	2	10	66184	66193	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_017293	TGC	2	6	66215	66220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017293	GCA	2	6	66296	66301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017293	TCT	2	6	66316	66321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017293	CAG	2	6	66359	66364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017293	GC	4	8	66434	66441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017293	CAG	2	6	66456	66461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017293	GCA	2	6	66544	66549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017293	GCA	2	6	66562	66567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017293	AGC	2	6	66616	66621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017293	GAA	2	6	66627	66632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017293	GCA	2	6	66648	66653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017293	TAC	2	6	66705	66710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017293	CGC	2	6	66748	66753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017293	ACC	2	6	66754	66759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017293	ACG	2	6	66787	66792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017293	GCAAC	2	10	66910	66919	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
637	NC_017293	GCA	2	6	67035	67040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017293	CGGCG	2	10	67041	67050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
639	NC_017293	CAG	2	6	67068	67073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_017293	ACC	2	6	67111	67116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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