MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017291	T	7	7	1021785	1021791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_017291	AAG	2	6	1021824	1021829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017291	CGA	2	6	1021837	1021842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_017291	TC	3	6	1021849	1021854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_017291	GAA	3	9	1021909	1021917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_017291	TA	3	6	1021928	1021933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_017291	ATTT	2	8	1021940	1021947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_017291	T	7	7	1021969	1021975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017291	T	7	7	1022045	1022051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_017291	T	6	6	1022054	1022059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_017291	TAT	2	6	1022152	1022157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017291	T	9	9	1022160	1022168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_017291	TTAA	2	8	1022204	1022211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_017291	CTTCT	2	10	1022244	1022253	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2515	NC_017291	TCCT	2	8	1022280	1022287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_017291	AAATTT	2	12	1022316	1022327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_017291	TCG	2	6	1022515	1022520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_017291	ATA	2	6	1022523	1022528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_017291	CGT	2	6	1022618	1022623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_017291	CTT	2	6	1022629	1022634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_017291	TCT	2	6	1022637	1022642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_017291	CTA	2	6	1022695	1022700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_017291	TC	4	8	1028432	1028439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_017291	AG	3	6	1028531	1028536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_017291	TTAAA	2	10	1029198	1029207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_017291	GGC	2	6	1029242	1029247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2531	NC_017291	TTA	2	6	1029396	1029401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_017291	AACAA	2	10	1029411	1029420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2533	NC_017291	TAG	2	6	1029477	1029482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2539	NC_017291	TA	3	6	1040136	1040141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2545	NC_017291	A	6	6	1040957	1040962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017291	TCTT	2	8	1040963	1040970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2551	NC_017291	ATT	2	6	1043724	1043729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2553	NC_017291	TAGA	2	8	1049426	1049433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017291	T	7	7	1049465	1049471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_017291	ATT	2	6	1053998	1054003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2563	NC_017291	ATAA	2	8	1054067	1054074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017291	ATT	2	6	1054087	1054092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_017291	TACT	2	8	1075299	1075306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2603	NC_017291	ATA	2	6	1080882	1080887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_017291	A	6	6	1080905	1080910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_017291	TCT	2	6	1080913	1080918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2612	NC_017291	CT	3	6	1085436	1085441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_017291	A	6	6	1085449	1085454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017291	CTAT	2	8	1088290	1088297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2623	NC_017291	CAAAG	2	10	1097466	1097475	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2624	NC_017291	CAG	2	6	1097486	1097491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2628	NC_017291	ACAA	2	8	1097584	1097591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_017291	A	6	6	1097612	1097617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_017291	AG	3	6	1097629	1097634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.