MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017291	ACC	2	6	629047	629052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_017291	ATA	2	6	629855	629860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017291	T	6	6	629864	629869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017291	AAT	2	6	629889	629894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017291	ATA	2	6	630053	630058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017291	ATA	2	6	630109	630114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017291	TTAA	2	8	630115	630122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017291	TAAT	2	8	630130	630137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017291	TTC	2	6	631165	631170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017291	CTA	2	6	631188	631193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017291	ACA	2	6	632644	632649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017291	A	6	6	632649	632654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017291	TAT	2	6	632668	632673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017291	T	6	6	632695	632700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017291	CAA	2	6	632704	632709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017291	A	6	6	632728	632733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017291	AAAG	2	8	632747	632754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017291	TAA	2	6	632762	632767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017291	ATTT	2	8	642535	642542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017291	CTT	2	6	642593	642598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017291	TCT	2	6	642603	642608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017291	TC	4	8	642667	642674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017291	TA	3	6	642675	642680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017291	A	6	6	642704	642709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017291	AAC	2	6	642713	642718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017291	ATTA	2	8	642738	642745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017291	ATT	2	6	642763	642768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017291	TA	3	6	642773	642778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017291	TTA	2	6	642803	642808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017291	TTG	2	6	643576	643581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017291	GTT	2	6	643636	643641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017291	AAC	2	6	643652	643657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017291	TGA	2	6	643661	643666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1535	NC_017291	TTA	2	6	643887	643892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1540	NC_017291	A	7	7	646984	646990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1543	NC_017291	GGA	2	6	651279	651284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1545	NC_017291	ATT	2	6	651316	651321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017291	ATCAA	2	10	651389	651398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1553	NC_017291	AT	3	6	652524	652529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017291	T	6	6	652649	652654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017291	A	7	7	652656	652662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_017291	TA	3	6	652783	652788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_017291	A	7	7	653370	653376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017291	T	6	6	653449	653454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017291	TA	3	6	653460	653465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017291	T	7	7	653469	653475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017291	GTT	2	6	653495	653500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_017291	TTG	2	6	654352	654357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017291	TTTTA	2	10	654380	654389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1574	NC_017291	ATA	2	6	654535	654540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_017291	A	8	8	655319	655326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_017291	ATTCT	2	10	658209	658218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1603	NC_017291	AG	3	6	658997	659002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017291	TA	3	6	659053	659058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017291	AAATAC	2	12	659064	659075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1607	NC_017291	AAT	2	6	659581	659586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017291	TTA	2	6	659604	659609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017291	TAA	2	6	659626	659631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017291	CAATCT	2	12	659650	659661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017291	TAG	2	6	659664	659669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017291	CATT	2	8	659679	659686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_017291	TAT	2	6	660572	660577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017291	TGA	2	6	660580	660585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017291	TCTTA	2	10	661746	661755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1618	NC_017291	CA	3	6	661763	661768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_017291	AAATA	2	10	661777	661786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017291	A	7	7	661786	661792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017291	T	6	6	661809	661814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_017291	CT	4	8	661831	661838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1634	NC_017291	TCA	2	6	665898	665903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017291	AAAAT	2	10	666621	666630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017291	TTAAT	2	10	666638	666647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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