MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017291	T	7	7	425047	425053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017291	AAGA	2	8	425057	425064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017291	GTC	2	6	425077	425082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017291	CTG	2	6	425107	425112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017291	AGG	2	6	425116	425121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017291	AAG	2	6	425184	425189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017291	TTA	2	6	425204	425209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017291	AAC	2	6	425308	425313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017291	A	6	6	425325	425330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017291	TAT	2	6	425383	425388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017291	CAA	2	6	425400	425405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017291	AGG	2	6	425428	425433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017291	T	6	6	425822	425827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017291	TTA	2	6	425829	425834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017291	TAT	2	6	427061	427066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017291	T	8	8	427066	427073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017291	AAT	2	6	427090	427095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017291	ATT	2	6	427115	427120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017291	GA	3	6	427149	427154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017291	TGT	2	6	427156	427161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017291	ATT	2	6	432678	432683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017291	ATA	2	6	432685	432690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017291	TTG	2	6	433213	433218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017291	GTC	2	6	433228	433233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017291	ACGA	2	8	433269	433276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017291	GAT	2	6	433373	433378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1028	NC_017291	TAT	2	6	433472	433477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017291	TCAT	2	8	433488	433495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017291	GAG	2	6	435365	435370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017291	ATT	2	6	435387	435392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017291	T	8	8	435438	435445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017291	TTTA	2	8	435474	435481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017291	T	7	7	437803	437809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017291	A	7	7	437810	437816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_017291	AG	3	6	444401	444406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017291	TGAG	2	8	444454	444461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017291	CT	3	6	444472	444477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_017291	AG	3	6	445046	445051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_017291	TA	3	6	445589	445594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017291	TTTA	2	8	445622	445629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_017291	TAT	2	6	446893	446898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_017291	CT	4	8	460730	460737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1106	NC_017291	ATAC	2	8	462490	462497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017291	TCT	2	6	463011	463016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017291	TAT	2	6	463036	463041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_017291	ATA	2	6	463064	463069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017291	TAA	2	6	463112	463117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017291	TAA	2	6	465917	465922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017291	AATT	2	8	465924	465931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017291	TAA	2	6	465939	465944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017291	ATT	2	6	465957	465962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_017291	AG	3	6	467559	467564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017291	ATGTA	2	10	467568	467577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017291	T	7	7	467586	467592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017291	A	8	8	467602	467609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017291	T	8	8	467619	467626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_017291	AG	3	6	474130	474135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017291	TCA	2	6	474192	474197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_017291	AACTT	2	10	474223	474232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_017291	T	6	6	474244	474249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017291	A	6	6	474278	474283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017291	TGA	2	6	474291	474296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017291	TGAGA	2	10	474331	474340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017291	TGC	2	6	474355	474360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_017291	AGT	2	6	475421	475426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017291	TA	3	6	475444	475449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017291	TAAAT	2	10	475496	475505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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