MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017291	GTC	2	6	211077	211082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017291	T	6	6	211166	211171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017291	GTTT	2	8	211875	211882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017291	T	6	6	211894	211899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017291	TGA	2	6	215326	215331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017291	TAA	2	6	215363	215368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017291	T	6	6	215396	215401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017291	AT	3	6	215441	215446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017291	GA	3	6	215501	215506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017291	GT	3	6	215541	215546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017291	CT	3	6	215578	215583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_017291	T	6	6	215606	215611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017291	T	6	6	215669	215674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017291	T	6	6	215715	215720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017291	A	6	6	215766	215771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017291	AG	3	6	215805	215810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017291	TC	3	6	215864	215869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017291	ATA	2	6	222915	222920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017291	AG	3	6	222923	222928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017291	AAGA	2	8	222930	222937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017291	AGA	2	6	225893	225898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017291	ATAAA	2	10	225899	225908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017291	A	6	6	225920	225925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017291	T	8	8	225975	225982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017291	G	6	6	226040	226045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017291	CTT	2	6	226366	226371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017291	AACA	2	8	226748	226755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_017291	ATTTT	2	10	226756	226765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017291	TTA	2	6	226766	226771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017291	A	8	8	226804	226811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017291	TAA	2	6	226829	226834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017291	TAAAGA	2	12	226841	226852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017291	TAA	2	6	226865	226870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017291	A	6	6	226909	226914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017291	A	6	6	228295	228300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017291	T	7	7	228301	228307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017291	AAG	2	6	228334	228339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017291	TAT	2	6	228350	228355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017291	T	6	6	229238	229243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017291	ATA	2	6	229258	229263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017291	CCT	2	6	229732	229737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017291	ATA	2	6	229760	229765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017291	T	8	8	229807	229814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017291	A	6	6	232238	232243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017291	ATTA	2	8	232252	232259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017291	TA	4	8	232258	232265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017291	T	7	7	232269	232275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017291	T	6	6	232306	232311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017291	GAT	2	6	232323	232328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_017291	GAT	2	6	232380	232385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017291	T	6	6	235976	235981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017291	AG	3	6	237004	237009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017291	AT	3	6	237074	237079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017291	CTA	2	6	237183	237188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017291	CTTG	2	8	238178	238185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017291	GAAT	2	8	238229	238236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017291	GAA	3	9	238243	238251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017291	T	6	6	238266	238271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017291	AAG	2	6	238275	238280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017291	T	7	7	238290	238296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017291	AAG	2	6	238329	238334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017291	ACC	2	6	238348	238353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017291	AATT	2	8	238368	238375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017291	GAT	2	6	238409	238414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017291	TTTC	2	8	238468	238475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017291	GTT	2	6	238496	238501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017291	A	8	8	238536	238543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017291	AGA	2	6	238578	238583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017291	ATTATA	2	12	239710	239721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_017291	TAT	2	6	239809	239814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017291	ATAA	2	8	239850	239857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017291	GA	3	6	239892	239897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017291	A	6	6	239927	239932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017291	CAA	2	6	240013	240018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017291	GCTT	2	8	240028	240035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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588	NC_017291	TAT	2	6	241117	241122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017291	TCAT	2	8	241129	241136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017291	ATA	2	6	241144	241149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_017291	TTGAAT	2	12	244023	244034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017291	AGGA	2	8	244059	244066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017291	AG	3	6	244067	244072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017291	T	7	7	244081	244087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017291	AAG	2	6	247857	247862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017291	T	6	6	250228	250233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017291	AAT	2	6	252320	252325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017291	T	8	8	252336	252343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017291	TTG	2	6	253035	253040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017291	TGA	2	6	253088	253093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017291	T	6	6	253119	253124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017291	T	7	7	253168	253174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017291	T	6	6	253190	253195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017291	A	7	7	253198	253204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017291	TAT	2	6	255847	255852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017291	TTG	2	6	255877	255882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017291	TTTAA	2	10	255889	255898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017291	AAGAT	2	10	255963	255972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017291	T	6	6	261587	261592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017291	GT	3	6	261610	261615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017291	ATT	2	6	261728	261733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_017291	ATATAA	2	12	261775	261786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017291	T	7	7	261803	261809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_017291	ATT	2	6	263042	263047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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622	NC_017291	T	8	8	263067	263074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017291	GTT	2	6	266597	266602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017291	T	7	7	266647	266653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017291	GTTC	2	8	266716	266723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017291	TC	3	6	266722	266727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017291	A	6	6	266733	266738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017291	AT	4	8	266760	266767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017291	TAAT	2	8	266819	266826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017291	AATT	2	8	266834	266841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017291	GAAGA	2	10	267657	267666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017291	T	8	8	267694	267701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017291	GGGAAA	2	12	267742	267753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017291	GAC	2	6	267769	267774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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636	NC_017291	ATT	2	6	267874	267879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017291	T	7	7	267900	267906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017291	TAAT	2	8	267911	267918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017291	TTA	2	6	267939	267944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017291	TTC	2	6	267953	267958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017291	GAA	2	6	267972	267977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017291	TG	3	6	268010	268015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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