MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 3010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017290	A	6	6	210442	210447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017290	GTC	2	6	211079	211084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017290	T	6	6	211168	211173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017290	GTTT	2	8	211877	211884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017290	T	6	6	211896	211901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017290	TGA	2	6	215328	215333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017290	TAA	2	6	215365	215370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017290	T	6	6	215398	215403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017290	AT	3	6	215443	215448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017290	GA	3	6	215503	215508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017290	GT	3	6	215543	215548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017290	CT	3	6	215580	215585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017290	T	6	6	215608	215613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017290	T	6	6	215671	215676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017290	T	6	6	215717	215722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017290	A	6	6	215768	215773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017290	AG	3	6	215807	215812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017290	TC	3	6	215866	215871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017290	ATA	2	6	222917	222922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017290	AG	3	6	222925	222930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017290	AAGA	2	8	222932	222939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017290	AGA	2	6	225895	225900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017290	ATAAA	2	10	225901	225910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017290	A	6	6	225922	225927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017290	T	8	8	225977	225984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017290	G	6	6	226042	226047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017290	CTT	2	6	226368	226373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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529	NC_017290	ATTTT	2	10	226758	226767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017290	TTA	2	6	226768	226773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017290	A	8	8	226806	226813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017290	TAA	2	6	226831	226836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017290	TAAAGA	2	12	226843	226854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017290	TAA	2	6	226867	226872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017290	A	6	6	226911	226916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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538	NC_017290	AAG	2	6	228336	228341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017290	TAT	2	6	228352	228357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_017290	ATA	2	6	229260	229265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_017290	ATA	2	6	229762	229767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017290	T	8	8	229809	229816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017290	A	6	6	232240	232245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017290	ATTA	2	8	232254	232261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017290	TA	4	8	232260	232267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017290	T	7	7	232271	232277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017290	T	6	6	232308	232313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017290	GAT	2	6	232325	232330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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552	NC_017290	GAT	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017290	T	6	6	235978	235983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017290	AG	3	6	237006	237011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017290	AT	3	6	237076	237081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017290	CTA	2	6	237185	237190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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558	NC_017290	GAAT	2	8	238231	238238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017290	GAA	3	9	238245	238253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_017290	AAG	2	6	238277	238282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017290	T	7	7	238292	238298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017290	AAG	2	6	238331	238336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017290	ACC	2	6	238350	238355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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566	NC_017290	GAT	2	6	238411	238416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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568	NC_017290	GTT	2	6	238498	238503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017290	A	8	8	238538	238545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017290	AGA	2	6	238580	238585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017290	ATTATA	2	12	239712	239723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017290	A	6	6	239747	239752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017290	CAA	2	6	240015	240020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_017290	TAC	2	6	248047	248052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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611	NC_017290	T	6	6	253193	253198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017290	A	7	7	253201	253207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017290	TAT	2	6	255850	255855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017290	TTG	2	6	255880	255885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017290	TTTAA	2	10	255892	255901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017290	AAGAT	2	10	255966	255975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017290	T	6	6	261590	261595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_017290	ATATAA	2	12	261778	261789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017290	T	7	7	261806	261812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017290	TAAA	2	8	263032	263039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017290	ATT	2	6	263045	263050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_017290	GTT	2	6	266600	266605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_017290	AATT	2	8	266837	266844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017290	GAAGA	2	10	267660	267669	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017290	T	7	7	267903	267909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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