MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 2901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017289	GTC	2	6	427748	427753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017289	CTG	2	6	427778	427783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017289	AGG	2	6	427787	427792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017289	AAG	2	6	427855	427860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017289	TTA	2	6	427875	427880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017289	AAC	2	6	427979	427984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017289	A	6	6	427996	428001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017289	TAT	2	6	428054	428059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017289	CAA	2	6	428071	428076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017289	AGG	2	6	428099	428104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017289	T	6	6	428493	428498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017289	TTA	2	6	428500	428505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017289	TAT	2	6	429732	429737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017289	T	8	8	429737	429744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017289	AAT	2	6	429761	429766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017289	ATT	2	6	429786	429791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017289	GA	3	6	429820	429825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017289	TGT	2	6	429827	429832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017289	ATT	2	6	435349	435354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017289	ATA	2	6	435356	435361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017289	TTG	2	6	435884	435889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017289	GTC	2	6	435899	435904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017289	ACGA	2	8	435940	435947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_017289	GAT	2	6	436044	436049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017289	TTTC	2	8	436105	436112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017289	TAT	2	6	436143	436148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017289	TCAT	2	8	436159	436166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_017289	GAG	2	6	438036	438041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017289	ATT	2	6	438058	438063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017289	T	8	8	438109	438116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017289	TTTA	2	8	438145	438152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017289	T	7	7	440474	440480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017289	A	7	7	440481	440487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017289	GA	3	6	440555	440560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_017289	CT	3	6	447143	447148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_017289	AG	3	6	447717	447722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017289	T	6	6	447723	447728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017289	TGA	2	6	447781	447786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017289	A	8	8	447788	447795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_017289	TA	3	6	448260	448265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017289	TTTA	2	8	448293	448300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_017289	TAT	2	6	449564	449569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017289	A	6	6	449579	449584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017289	A	6	6	449601	449606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017289	ATT	2	6	449617	449622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017289	CAT	2	6	460188	460193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1102	NC_017289	CT	4	8	463530	463537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1107	NC_017289	AAT	2	6	465844	465849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017289	ATA	2	6	465864	465869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017289	TAA	2	6	465912	465917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017289	AATT	2	8	468724	468731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017289	TAA	2	6	468739	468744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017289	ATT	2	6	468757	468762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017289	ATT	3	9	468764	468772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_017289	ATGTA	2	10	470368	470377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017289	T	7	7	470386	470392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017289	A	8	8	470402	470409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017289	T	8	8	470419	470426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_017289	TCA	2	6	476992	476997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_017289	AACTT	2	10	477023	477032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1130	NC_017289	TGAGA	2	10	477131	477140	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017289	TGC	2	6	477155	477160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1133	NC_017289	AGT	2	6	478221	478226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017289	TA	3	6	478244	478249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017289	TAAAT	2	10	478296	478305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017289	GAT	2	6	478325	478330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017289	T	6	6	478343	478348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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