MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 2901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017289	GTC	2	6	211081	211086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017289	T	6	6	211170	211175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017289	GTTT	2	8	211879	211886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017289	T	6	6	211898	211903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017289	AAG	2	6	215293	215298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017289	TGA	2	6	215330	215335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017289	TAA	2	6	215367	215372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017289	T	6	6	215400	215405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017289	AT	3	6	215445	215450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017289	GA	3	6	215505	215510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017289	GT	3	6	215545	215550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017289	CT	3	6	215582	215587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017289	T	6	6	215610	215615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017289	T	6	6	215673	215678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017289	T	6	6	215719	215724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017289	A	6	6	215770	215775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017289	AG	3	6	215809	215814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017289	TC	3	6	215868	215873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017289	ATA	2	6	222919	222924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017289	AG	3	6	222927	222932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017289	AAGA	2	8	222934	222941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017289	AGA	2	6	225897	225902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017289	ATAAA	2	10	225903	225912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017289	A	6	6	225924	225929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017289	T	8	8	225979	225986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017289	G	6	6	226044	226049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017289	CTT	2	6	226370	226375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017289	AACA	2	8	226752	226759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_017289	ATTTT	2	10	226760	226769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017289	TTA	2	6	226770	226775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017289	A	8	8	226808	226815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017289	TAA	2	6	226833	226838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017289	TAAAGA	2	12	226845	226856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017289	TAA	2	6	226869	226874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017289	A	6	6	226913	226918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017289	A	6	6	228299	228304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017289	T	7	7	228305	228311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017289	AAG	2	6	228338	228343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017289	TAT	2	6	228354	228359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017289	T	6	6	229242	229247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017289	ATA	2	6	229262	229267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017289	CCT	2	6	229736	229741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017289	ATA	2	6	229764	229769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017289	T	8	8	229811	229818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017289	A	6	6	232242	232247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017289	ATTA	2	8	232256	232263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017289	TA	4	8	232262	232269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017289	T	7	7	232273	232279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017289	T	6	6	232310	232315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017289	GAT	2	6	232327	232332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017289	GCG	2	6	232341	232346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017289	GAT	2	6	232384	232389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017289	T	6	6	235980	235985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017289	AG	3	6	237008	237013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017289	AT	3	6	237078	237083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017289	CTA	2	6	237187	237192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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558	NC_017289	GAAT	2	8	238233	238240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017289	GAA	3	9	238247	238255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017289	T	6	6	238270	238275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017289	AAG	2	6	238279	238284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017289	T	7	7	238294	238300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017289	AAG	2	6	238333	238338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017289	ACC	2	6	238352	238357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017289	AATT	2	8	238372	238379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017289	GAT	2	6	238413	238418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017289	TTTC	2	8	238472	238479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017289	GTT	2	6	238500	238505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017289	A	8	8	238540	238547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017289	AGA	2	6	238582	238587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017289	ATTATA	2	12	239714	239725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017289	A	6	6	239749	239754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017289	CTT	2	6	239786	239791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017289	TAT	2	6	239813	239818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017289	ATAA	2	8	239854	239861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017289	GA	3	6	239896	239901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017289	A	6	6	239931	239936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017289	GCA	2	6	239959	239964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017289	CAA	2	6	240017	240022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017289	GCTT	2	8	240032	240039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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586	NC_017289	TAG	2	6	240971	240976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_017289	TAT	2	6	241121	241126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017289	TCAT	2	8	241133	241140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_017289	ATA	2	6	241148	241153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017289	TGT	2	6	242669	242674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017289	TTGAAT	2	12	244027	244038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017289	AGGA	2	8	244063	244070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017289	AG	3	6	244071	244076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017289	T	7	7	244085	244091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017289	ACA	2	6	249760	249765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017289	AAT	2	6	250174	250179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017289	GAA	2	6	252291	252296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017289	AAT	2	6	252324	252329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017289	T	8	8	252340	252347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017289	TTG	2	6	253039	253044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017289	TGA	2	6	253092	253097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_017289	T	7	7	253172	253178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017289	T	6	6	253194	253199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017289	A	7	7	253202	253208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017289	TAT	2	6	255851	255856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017289	TTG	2	6	255881	255886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017289	TTTAA	2	10	255893	255902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017289	AAGAT	2	10	255967	255976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017289	T	6	6	261591	261596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017289	GT	3	6	261614	261619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017289	ATT	2	6	261732	261737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017289	ATATAA	2	12	261779	261790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017289	T	7	7	261807	261813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017289	TAAA	2	8	263033	263040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017289	ATT	2	6	263046	263051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017289	AG	3	6	263062	263067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017289	T	8	8	263071	263078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017289	GTT	2	6	266601	266606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017289	T	7	7	266651	266657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_017289	TC	3	6	266726	266731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017289	A	6	6	266737	266742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017289	AT	4	8	266764	266771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017289	TAAT	2	8	266823	266830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017289	AATT	2	8	266838	266845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017289	GAAGA	2	10	267661	267670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017289	T	8	8	267698	267705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017289	GGGAAA	2	12	267746	267757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017289	GAC	2	6	267773	267778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_017289	ATT	2	6	267878	267883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017289	T	7	7	267904	267910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017289	TAAT	2	8	267915	267922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017289	TTA	2	6	267943	267948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017289	TTC	2	6	267957	267962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_017289	GAA	2	6	267976	267981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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