MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017287	AAG	2	6	363430	363435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017287	AT	3	6	367857	367862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017287	TA	3	6	370498	370503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017287	GAATA	2	10	371458	371467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017287	CTA	2	6	371489	371494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017287	AG	3	6	371504	371509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017287	ATTTTT	2	12	371518	371529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017287	TAA	2	6	372255	372260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017287	T	8	8	372278	372285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017287	TTAA	2	8	372306	372313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017287	TCT	2	6	372334	372339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017287	TCG	2	6	374821	374826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017287	TAG	2	6	374863	374868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017287	AAT	2	6	374876	374881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017287	AT	3	6	374898	374903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017287	AAT	2	6	374909	374914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017287	A	6	6	374974	374979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017287	A	8	8	375016	375023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017287	TTC	2	6	375038	375043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017287	AAT	2	6	375061	375066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017287	T	7	7	375075	375081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017287	TG	3	6	375147	375152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017287	A	6	6	375161	375166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017287	T	6	6	375186	375191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017287	T	6	6	375274	375279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017287	A	7	7	375285	375291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017287	CAT	2	6	376097	376102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017287	CAT	2	6	376133	376138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017287	AACT	2	8	376165	376172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017287	TGT	2	6	376242	376247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017287	ATT	2	6	376264	376269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017287	CT	3	6	376474	376479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017287	GTG	2	6	376481	376486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017287	AAC	2	6	380790	380795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017287	ATG	2	6	380815	380820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017287	TGT	2	6	386760	386765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017287	GAG	2	6	386784	386789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017287	T	8	8	386790	386797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017287	T	6	6	386816	386821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017287	TAA	2	6	386932	386937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017287	TCG	2	6	386944	386949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017287	TA	3	6	387019	387024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017287	ATA	2	6	387085	387090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017287	GTTT	2	8	387152	387159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017287	A	6	6	387189	387194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017287	A	6	6	387223	387228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017287	TAAT	2	8	389850	389857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017287	ATT	2	6	389866	389871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017287	AAGA	2	8	389885	389892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017287	ATTA	2	8	389910	389917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017287	T	8	8	389928	389935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017287	AGA	2	6	390036	390041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017287	CACTA	2	10	390108	390117	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_017287	A	7	7	390709	390715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017287	T	6	6	390717	390722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017287	CAA	2	6	390750	390755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017287	GTTTC	2	10	391208	391217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1059	NC_017287	TAG	2	6	391242	391247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017287	A	6	6	391253	391258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017287	T	7	7	394093	394099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017287	GAC	2	6	394685	394690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017287	AAAATC	2	12	396526	396537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_017287	GTA	2	6	396543	396548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017287	TTG	2	6	396610	396615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017287	TAA	2	6	397348	397353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017287	TTTAA	2	10	397355	397364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017287	CAT	2	6	398329	398334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017287	GTA	2	6	398346	398351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017287	A	6	6	400015	400020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017287	TTG	2	6	400027	400032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017287	AGC	2	6	400068	400073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017287	T	8	8	401537	401544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017287	GTTT	2	8	401570	401577	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017287	TTAA	2	8	401592	401599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017287	TAAT	2	8	401611	401618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017287	TA	3	6	401619	401624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017287	T	6	6	410686	410691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_017287	T	9	9	413183	413191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017287	A	7	7	413227	413233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017287	AGC	2	6	413312	413317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_017287	GTA	2	6	413509	413514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017287	CTA	2	6	413524	413529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_017287	T	8	8	413769	413776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017287	TG	3	6	413791	413796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017287	AGA	2	6	413860	413865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017287	CTA	2	6	413871	413876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017287	ATTA	2	8	417834	417841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017287	GAA	2	6	420450	420455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017287	CAAT	2	8	420485	420492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_017287	A	7	7	420504	420510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017287	CAG	2	6	420511	420516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017287	GAT	2	6	420517	420522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_017287	TAG	2	6	421602	421607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_017287	AATA	2	8	421659	421666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017287	TC	3	6	421682	421687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_017287	GTA	2	6	424876	424881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1116	NC_017287	GACTGT	2	12	424936	424947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1119	NC_017287	T	7	7	425136	425142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_017287	CAA	2	6	425149	425154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1124	NC_017287	CTTT	2	8	425360	425367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_017287	T	8	8	425399	425406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017287	A	6	6	425414	425419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017287	GTAA	2	8	425442	425449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017287	CGG	2	6	425457	425462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017287	TTTA	2	8	425495	425502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017287	AT	3	6	425565	425570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017287	GAA	2	6	425608	425613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017287	T	7	7	427795	427801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017287	AAGA	2	8	427805	427812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017287	GTC	2	6	427825	427830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017287	CTG	2	6	427855	427860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017287	AGG	2	6	427864	427869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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