MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017287	TAT	2	6	228258	228263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017287	T	6	6	229146	229151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017287	ATA	2	6	229166	229171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017287	CCT	2	6	229640	229645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_017287	ATA	2	6	229668	229673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017287	T	8	8	229715	229722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017287	A	6	6	232146	232151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017287	ATTA	2	8	232160	232167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017287	TA	4	8	232166	232173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017287	T	7	7	232177	232183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017287	T	6	6	232214	232219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017287	GAT	2	6	232231	232236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017287	GCG	2	6	232245	232250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017287	GAT	2	6	232288	232293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017287	T	6	6	235884	235889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017287	AG	3	6	236912	236917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017287	AT	3	6	236982	236987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017287	CTA	2	6	237091	237096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017287	CTTG	2	8	238086	238093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017287	GAAT	2	8	238137	238144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017287	GAA	3	9	238151	238159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017287	T	6	6	238174	238179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017287	AAG	2	6	238183	238188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017287	T	7	7	238198	238204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017287	AAG	2	6	238237	238242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017287	ACC	2	6	238256	238261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017287	AATT	2	8	238276	238283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017287	GAT	2	6	238317	238322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017287	TTTC	2	8	238376	238383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017287	GTT	2	6	238404	238409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017287	A	8	8	238444	238451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017287	AGA	2	6	238486	238491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017287	ATTATA	2	12	239618	239629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017287	A	6	6	239653	239658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017287	CTT	2	6	239690	239695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017287	T	6	6	240079	240084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017287	GTTT	2	8	240807	240814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017287	TAG	2	6	240875	240880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017287	A	7	7	240967	240973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017287	AG	3	6	241009	241014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017287	TAT	2	6	241025	241030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017287	TCAT	2	8	241037	241044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_017287	ATA	2	6	241052	241057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017287	CGT	2	6	241073	241078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017287	TGT	2	6	242573	242578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017287	TTGAAT	2	12	243931	243942	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017287	AGGA	2	8	243967	243974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017287	AG	3	6	243975	243980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017287	T	7	7	243989	243995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017287	AAG	2	6	247765	247770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017287	AAT	2	6	250078	250083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017287	T	6	6	250136	250141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017287	GAA	2	6	252195	252200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017287	AAT	2	6	252228	252233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017287	T	8	8	252244	252251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017287	TTG	2	6	252943	252948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017287	TGA	2	6	252996	253001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017287	T	6	6	253027	253032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017287	T	7	7	253076	253082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017287	T	6	6	253098	253103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017287	A	7	7	253106	253112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017287	TAT	2	6	255755	255760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017287	T	6	6	261495	261500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017287	GT	3	6	261518	261523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017287	ATT	2	6	261636	261641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017287	A	6	6	261662	261667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017287	ATATAA	2	12	261683	261694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017287	T	7	7	261711	261717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017287	TAAA	2	8	262937	262944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017287	ATT	2	6	262950	262955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017287	GTT	2	6	262971	262976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017287	T	8	8	262975	262982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017287	GTT	2	6	266505	266510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017287	T	7	7	266555	266561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017287	GTTC	2	8	266624	266631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_017287	TC	3	6	266630	266635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017287	A	6	6	266641	266646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017287	AT	4	8	266668	266675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017287	TAAT	2	8	266727	266734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017287	AATT	2	8	266742	266749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017287	GAAGA	2	10	267565	267574	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017287	T	8	8	267602	267609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017287	GGGAAA	2	12	267650	267661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017287	GAC	2	6	267677	267682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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586	NC_017287	ATT	2	6	267782	267787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017287	T	7	7	267808	267814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017287	TAAT	2	8	267819	267826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017287	TTA	2	6	267847	267852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017287	TTC	2	6	267861	267866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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592	NC_017287	TG	3	6	267918	267923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017287	TAAA	2	8	267933	267940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017287	A	8	8	271299	271306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017287	ATT	2	6	271388	271393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017287	TTA	2	6	272647	272652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_017287	TAAAA	2	10	274580	274589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017287	T	6	6	274595	274600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017287	A	6	6	274618	274623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017287	T	6	6	274801	274806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017287	T	6	6	274814	274819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017287	AGG	2	6	274829	274834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017287	TCT	2	6	274843	274848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017287	GTT	2	6	274855	274860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017287	GAT	2	6	276245	276250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017287	CTT	2	6	276282	276287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017287	AAG	2	6	276296	276301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017287	GAA	2	6	276526	276531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017287	T	6	6	276599	276604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017287	AAAT	2	8	276606	276613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017287	TTA	2	6	276625	276630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017287	TG	3	6	276702	276707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017287	AAG	2	6	277462	277467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017287	AGA	2	6	277495	277500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017287	AGA	2	6	277508	277513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017287	GT	3	6	277544	277549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017287	TAAGAA	2	12	277569	277580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017287	T	7	7	281117	281123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017287	TACT	2	8	281135	281142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_017287	AATT	2	8	281156	281163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017287	AAG	2	6	282034	282039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017287	TC	3	6	282046	282051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017287	ATT	2	6	282083	282088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017287	TA	3	6	282095	282100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017287	GTTT	2	8	282108	282115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017287	ATT	2	6	282169	282174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017287	A	6	6	285181	285186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017287	TTA	2	6	285195	285200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017287	T	7	7	285241	285247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017287	AAT	2	6	289736	289741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017287	TGT	2	6	289754	289759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017287	ATTT	2	8	289761	289768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017287	TAAT	3	12	289808	289819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017287	ATTTT	2	10	289825	289834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017287	T	6	6	289831	289836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017287	T	6	6	289838	289843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017287	GAT	2	6	289873	289878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017287	TAGA	2	8	291645	291652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_017287	TCT	2	6	291703	291708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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