MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TTGT	2	8	10	17	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017282	ATCT	2	8	240	247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017282	TTTG	2	8	508	515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017282	ACTT	2	8	813	820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017282	AAAT	2	8	1483	1490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017282	ATTT	2	8	1866	1873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017282	ATCT	2	8	1959	1966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017282	AGAT	2	8	1979	1986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017282	ATTG	2	8	2171	2178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017282	ATTT	2	8	2181	2188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017282	GTTC	2	8	2426	2433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017282	ATTA	2	8	5325	5332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017282	ACCC	2	8	6380	6387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017282	TTTA	2	8	8856	8863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017282	AAAT	2	8	10693	10700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017282	TTTA	2	8	29096	29103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017282	AATT	2	8	29492	29499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017282	ATCA	2	8	30619	30626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017282	AAGA	2	8	31033	31040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017282	TAAA	2	8	31556	31563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017282	TCAT	2	8	31578	31585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017282	CAAG	2	8	31783	31790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017282	CGAA	2	8	31825	31832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017282	AAAT	2	8	32896	32903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017282	TTAT	2	8	34074	34081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017282	CTTT	2	8	40178	40185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017282	TTCT	2	8	40450	40457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017282	TTTC	2	8	40542	40549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017282	TGAA	2	8	41256	41263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017282	TTTA	2	8	41420	41427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017282	CAAG	2	8	41649	41656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017282	TGTA	2	8	42039	42046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017282	TAAT	2	8	42250	42257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017282	TGTT	2	8	42410	42417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017282	TTTA	2	8	42665	42672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017282	TTCT	2	8	43096	43103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017282	AAAT	2	8	43184	43191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.