MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 3801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017281	TGC	2	6	399982	399987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017281	AG	3	6	400002	400007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017281	CTT	2	6	402359	402364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017281	A	7	7	402403	402409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017281	AG	3	6	402420	402425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017281	T	6	6	403919	403924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017281	TTA	2	6	403964	403969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017281	GATA	2	8	403972	403979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017281	TA	3	6	405162	405167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017281	TTAA	2	8	405168	405175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017281	TTAA	2	8	405189	405196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017281	T	8	8	405213	405220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017281	AT	3	6	405263	405268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017281	T	6	6	405277	405282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017281	ATTT	2	8	405286	405293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017281	TAT	2	6	405294	405299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017281	ATCT	2	8	405304	405311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017281	CTTAT	2	10	405322	405331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_017281	T	6	6	405334	405339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017281	GTTT	2	8	405392	405399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017281	ATT	3	9	405445	405453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017281	T	7	7	405456	405462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017281	T	6	6	409921	409926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017281	T	8	8	410173	410180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017281	T	6	6	412367	412372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017281	TAT	2	6	412382	412387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017281	TTAA	2	8	412411	412418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017281	T	7	7	412427	412433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017281	ATT	2	6	412466	412471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017281	AATT	2	8	412480	412487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017281	TCAAA	2	10	412492	412501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_017281	A	7	7	412514	412520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017281	T	6	6	412531	412536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017281	AGA	2	6	412564	412569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017281	ATG	2	6	412584	412589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017281	AGA	2	6	412661	412666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017281	A	6	6	412672	412677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017281	ACA	2	6	413024	413029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017281	AT	3	6	413095	413100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017281	TAT	2	6	413124	413129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017281	AAT	2	6	413172	413177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017281	GAT	2	6	413271	413276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017281	ATA	2	6	413281	413286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017281	TA	3	6	413285	413290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017281	AT	3	6	413306	413311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017281	AGT	2	6	413337	413342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017281	ATA	2	6	413377	413382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017281	ATG	2	6	413395	413400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017281	AACT	2	8	413420	413427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_017281	TAAGGA	2	12	413450	413461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017281	AAGGT	2	10	413488	413497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017281	GATT	2	8	413555	413562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017281	A	6	6	413573	413578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017281	AGCG	2	8	413585	413592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_017281	GAT	2	6	413669	413674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017281	TAC	2	6	413683	413688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017281	TTTG	2	8	413713	413720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017281	ATA	2	6	413766	413771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017281	AGG	2	6	413782	413787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017281	CTG	2	6	413811	413816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017281	AAT	3	9	413852	413860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017281	AGA	2	6	413890	413895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017281	ATT	2	6	413946	413951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017281	TTA	2	6	413964	413969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017281	CAAAT	2	10	413979	413988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_017281	AGT	2	6	413990	413995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017281	TTGT	2	8	414042	414049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017281	A	7	7	414177	414183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017281	TTGGT	2	10	414184	414193	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017281	ATAGA	2	10	414198	414207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017281	TA	3	6	414269	414274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017281	TA	3	6	414359	414364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017281	GATGG	2	10	414465	414474	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017281	CTG	2	6	414483	414488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017281	GAAG	2	8	414518	414525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017281	T	6	6	414560	414565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017281	A	6	6	414592	414597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017281	ATAA	2	8	414623	414630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017281	A	6	6	416669	416674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017281	TAA	2	6	416675	416680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017281	TAA	3	9	416684	416692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017281	TG	3	6	416701	416706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017281	TA	3	6	416708	416713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017281	T	7	7	417045	417051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017281	AT	3	6	417053	417058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017281	ATT	2	6	417072	417077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017281	TA	4	8	417087	417094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017281	ATA	2	6	418608	418613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017281	T	6	6	418681	418686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017281	TA	3	6	422568	422573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017281	TTA	2	6	424195	424200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017281	A	7	7	424238	424244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017281	TAT	2	6	426519	426524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017281	T	6	6	426524	426529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017281	ATT	2	6	426589	426594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017281	A	7	7	426605	426611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017281	TAAAT	2	10	431136	431145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017281	TA	3	6	431173	431178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017281	ATA	2	6	433887	433892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017281	ATA	2	6	433903	433908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017281	A	6	6	433942	433947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017281	T	10	10	433960	433969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017281	AGC	2	6	434017	434022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017281	AGC	2	6	434032	434037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017281	ATTT	2	8	434070	434077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017281	CTG	2	6	434161	434166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017281	CAC	2	6	434199	434204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_017281	AAT	2	6	434289	434294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017281	TA	3	6	434338	434343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017281	TGT	2	6	434358	434363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017281	A	6	6	434473	434478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017281	TA	3	6	434480	434485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017281	TTGCT	2	10	434496	434505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_017281	ATTT	2	8	434508	434515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017281	T	6	6	434513	434518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017281	GGA	2	6	434523	434528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017281	TAA	2	6	435736	435741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017281	T	6	6	435767	435772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017281	T	6	6	437988	437993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017281	A	6	6	438024	438029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017281	T	6	6	438037	438042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017281	AGA	3	9	439027	439035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017281	TCT	2	6	439050	439055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017281	T	7	7	439055	439061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017281	TCT	2	6	439082	439087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017281	T	6	6	439087	439092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017281	TTTTAT	2	12	448609	448620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017281	T	6	6	448634	448639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017281	TAT	2	6	448668	448673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017281	TTA	2	6	448674	448679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017281	T	7	7	448689	448695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017281	TAA	2	6	448711	448716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017281	T	7	7	448754	448760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017281	T	6	6	448778	448783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017281	TA	3	6	448785	448790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017281	AT	3	6	448792	448797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017281	TA	3	6	448803	448808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017281	TTA	2	6	457070	457075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_017281	ATG	2	6	457093	457098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_017281	ATT	2	6	457182	457187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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