MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017279	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017279	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017279	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017279	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017279	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017279	TATAT	2	10	38744	38753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017279	CTTTT	2	10	39031	39040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017279	CTTTT	2	10	39201	39210	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017279	GGTAA	2	10	39513	39522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017279	TCGTG	2	10	40309	40318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017279	TCTTT	2	10	41337	41346	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017279	TAACT	2	10	41351	41360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017279	CCGTA	2	10	43195	43204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017279	AGCTT	2	10	52180	52189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017279	AAAAT	2	10	66746	66755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017279	ATTAC	2	10	67102	67111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017279	AAAAT	2	10	67808	67817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017279	TCTCT	2	10	76681	76690	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017279	TAGGA	2	10	83417	83426	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017279	AAAAT	2	10	83443	83452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017279	ATTTT	2	10	83453	83462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017279	TTAAT	2	10	84178	84187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017279	TATTT	2	10	84246	84255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017279	TATAA	2	10	84263	84272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017279	TAAAA	2	10	89011	89020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017279	TTGGC	2	10	94372	94381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017279	AAGAT	2	10	94459	94468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017279	TTAAT	2	10	146558	146567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	TATTT	2	10	152051	152060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	TTATT	2	10	166262	166271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017279	TATTT	2	10	179284	179293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017279	TAAAA	2	10	189474	189483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017279	AAAAT	2	10	193642	193651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017279	AAGTG	2	10	196529	196538	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017279	AGGAT	2	10	196789	196798	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017279	TAAAA	2	10	203643	203652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017279	TAGAT	2	10	213323	213332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017279	AAAAT	2	10	228770	228779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017279	TAAAT	2	10	233521	233530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017279	CATAA	2	10	239101	239110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017279	CTATT	2	10	245588	245597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017279	ATATT	2	10	250084	250093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017279	ATTAA	2	10	253362	253371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017279	TTAAT	2	10	255277	255286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017279	AAGTA	2	10	272618	272627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017279	ATAAA	2	10	273639	273648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017279	AATTT	2	10	281562	281571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017279	TTAAA	2	10	306511	306520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017279	GAGTA	2	10	313153	313162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017279	TTTTA	2	10	325428	325437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017279	ATTAA	2	10	341500	341509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017279	ATTAA	2	10	343993	344002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017279	CTTTT	2	10	398561	398570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017279	CTTTT	2	10	398731	398740	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017279	GGTAA	2	10	399043	399052	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017279	TCGTG	2	10	399839	399848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017279	TCTTT	2	10	400867	400876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017279	TAACT	2	10	400881	400890	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017279	CCGTA	2	10	402725	402734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017279	CTTAT	2	10	409826	409835	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017279	ATTTT	2	10	414353	414362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017279	TCAAA	2	10	416996	417005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017279	AAGGT	2	10	418011	418020	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017279	CAAAT	2	10	418503	418512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017279	TTGGT	2	10	418708	418717	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017279	ATAGA	2	10	418722	418731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017279	GATGG	2	10	418989	418998	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017279	TAAAT	2	10	435659	435668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017279	TTGCT	2	10	439021	439030	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017279	TTTAT	2	10	461778	461787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017279	GATTT	2	10	462301	462310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017279	TTTTA	2	10	469845	469854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017279	TTGTG	2	10	470064	470073	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017279	CTTTT	2	10	470217	470226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017279	AAAAT	2	10	514761	514770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017279	GTTTT	2	10	517854	517863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017279	AAATA	2	10	518163	518172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017279	CATTC	2	10	518880	518889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017279	TTTTA	2	10	527170	527179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017279	AAAAT	2	10	527204	527213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017279	AATTA	2	10	529664	529673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017279	AAAAG	2	10	533077	533086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017279	ATCTT	2	10	533208	533217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017279	TTTGA	2	10	544825	544834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017279	ATTTG	2	10	545985	545994	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017279	TAAAA	2	10	559847	559856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017279	GATAA	2	10	583029	583038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017279	GAAAA	2	10	600600	600609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017279	TTTGC	2	10	604121	604130	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017279	AATTA	2	10	620166	620175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017279	TTTAA	2	10	629107	629116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017279	ATTTT	2	10	631033	631042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017279	AGAAA	2	10	631753	631762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017279	TGCTT	2	10	637198	637207	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017279	ATTTA	2	10	643525	643534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017279	TAAAA	3	15	659670	659684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017279	ATAAA	2	10	660493	660502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017279	ATTTA	2	10	662079	662088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017279	TTTAA	2	10	669408	669417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017279	TAAAA	2	10	692480	692489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017279	AAAAT	2	10	692550	692559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017279	TTTTA	2	10	692638	692647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017279	TTGTA	2	10	697819	697828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017279	CTTTT	2	10	699848	699857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017279	CTTTT	2	10	700018	700027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017279	GGTAA	2	10	700330	700339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017279	TCGTG	2	10	701126	701135	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017279	TCTTT	2	10	702154	702163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017279	TAACT	2	10	702168	702177	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017279	CCGTA	2	10	704012	704021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017279	TTTAT	2	10	706023	706032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017279	TAAAT	2	10	706291	706300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017279	AATTA	2	10	706315	706324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017279	TTTTA	2	10	706419	706428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017279	GCAAA	2	10	707110	707119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017279	AATCA	2	10	707248	707257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017279	AAAGC	2	10	707764	707773	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017279	ATTTT	2	10	708819	708828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017279	ATTAA	2	10	709063	709072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017279	AATAA	2	10	714929	714938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017279	ATTTA	2	10	717703	717712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017279	TTTTC	2	10	748063	748072	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017279	ATTTT	2	10	809742	809751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017279	TTTTA	2	10	813733	813742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017279	ATTCA	2	10	816367	816376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017279	AGGTT	2	10	818385	818394	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017279	AAAAT	2	10	826451	826460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017279	AAAAT	2	10	857338	857347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017279	ATTTT	2	10	863002	863011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017279	AAAAT	2	10	895259	895268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017279	TTAAT	2	10	907237	907246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017279	ATAAA	2	10	909828	909837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017279	AATTA	2	10	931825	931834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017279	TAAAA	2	10	931867	931876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017279	TAAAA	2	10	960463	960472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017279	TTTAT	2	10	966288	966297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017279	TTAAT	2	10	971387	971396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017279	TCCCT	2	10	1047140	1047149	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017279	TATAT	2	10	1048566	1048575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017279	TTTTA	2	10	1054000	1054009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017279	AGTTT	2	10	1114031	1114040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017279	ATTTT	2	10	1118224	1118233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017279	TCATA	2	10	1124189	1124198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017279	TAAAA	2	10	1126594	1126603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017279	TTTTA	2	10	1131673	1131682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017279	TTTAT	2	10	1153372	1153381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017279	AAACT	2	10	1153401	1153410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.