MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017279	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017279	TAAT	2	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017279	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017279	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017279	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017279	TGAT	2	8	27383	27390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017279	AAGG	2	8	29727	29734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017279	TTAT	2	8	37645	37652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017279	CTAT	2	8	39249	39256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017279	ATTT	2	8	41123	41130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017279	CAAG	2	8	41279	41286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017279	TAGC	2	8	41944	41951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017279	CTTA	2	8	42606	42613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017279	AAAG	2	8	42677	42684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017279	AGTA	2	8	42737	42744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017279	TAAT	2	8	42860	42867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017279	GGAT	2	8	43130	43137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017279	GGTG	2	8	43215	43222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017279	TCCC	2	8	43357	43364	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017279	TCGT	2	8	43905	43912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017279	ATTT	2	8	44924	44931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017279	TAAA	2	8	56701	56708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017279	TAAA	2	8	61557	61564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017279	GATT	2	8	66800	66807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017279	ATTT	2	8	67035	67042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017279	AGAA	2	8	67137	67144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017279	TCTT	2	8	67827	67834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017279	AATT	2	8	68756	68763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	AAAT	2	8	70411	70418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	GTTT	2	8	72075	72082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017279	TATT	2	8	73697	73704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017279	ATTT	2	8	79992	79999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017279	AAAT	2	8	80025	80032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017279	TTTA	2	8	82194	82201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017279	TTTA	2	8	83499	83506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017279	TAAA	2	8	89094	89101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017279	ATCA	2	8	94423	94430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017279	AATT	2	8	95244	95251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017279	ATTT	2	8	95291	95298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017279	TAAA	2	8	95300	95307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017279	TAAA	2	8	96121	96128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017279	AGGA	2	8	100928	100935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017279	ATTA	2	8	118918	118925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017279	AAGG	2	8	133235	133242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017279	ATTT	2	8	146528	146535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017279	ATTA	2	8	146699	146706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017279	CTTT	2	8	152027	152034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017279	CAAA	2	8	165620	165627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017279	TTAA	2	8	165655	165662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017279	AAAT	2	8	165671	165678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017279	TAAA	2	8	166277	166284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017279	ATTT	2	8	193664	193671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017279	TTTA	2	8	196067	196074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017279	TAAA	2	8	197222	197229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017279	AGAC	2	8	197472	197479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017279	AAGT	2	8	197925	197932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017279	CAAG	2	8	198418	198425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017279	TAAA	2	8	198480	198487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017279	TAGA	2	8	198705	198712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017279	ACCC	2	8	199255	199262	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_017279	AATC	2	8	199411	199418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017279	TCCT	2	8	199469	199476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017279	TTTA	2	8	201731	201738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017279	CTGT	2	8	202033	202040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017279	TTTG	2	8	202546	202553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017279	AAGA	2	8	202765	202772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017279	ATTT	2	8	203494	203501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017279	TGAT	2	8	210521	210528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017279	TAAA	2	8	210637	210644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017279	ATCA	2	8	211279	211286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017279	CAAG	2	8	211925	211932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017279	TTTA	2	8	212231	212238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017279	AAAT	2	8	213289	213296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017279	CAAG	2	8	213611	213618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017279	TAAA	2	8	213781	213788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017279	TAAA	2	8	218054	218061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017279	TAAA	2	8	218107	218114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017279	TAAA	2	8	223046	223053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017279	TAAA	2	8	223867	223874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017279	GGTT	2	8	223953	223960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017279	TTTA	2	8	228712	228719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017279	ATTA	3	12	229310	229321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017279	TTGA	2	8	233203	233210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017279	TAAT	2	8	233222	233229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017279	ATTT	2	8	233422	233429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017279	ATTA	2	8	233509	233516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017279	TAAA	2	8	236344	236351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017279	TTTG	2	8	236377	236384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017279	GTTT	2	8	249919	249926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017279	TCCC	2	8	250003	250010	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017279	TTGA	2	8	250053	250060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017279	AAAT	2	8	259613	259620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017279	CTTT	2	8	269563	269570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017279	TTAA	2	8	271268	271275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017279	ATTG	2	8	272099	272106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017279	GCAA	2	8	272194	272201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017279	ATCC	2	8	272756	272763	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017279	ATGA	2	8	277841	277848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017279	AAGT	2	8	277851	277858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017279	AATA	2	8	298589	298596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017279	AAAG	2	8	306503	306510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017279	TAAA	2	8	318807	318814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017279	ATTT	2	8	320035	320042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017279	TAAA	2	8	328767	328774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017279	ATAA	2	8	330550	330557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017279	ATTA	2	8	330588	330595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017279	ATTT	2	8	330618	330625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017279	TAAA	2	8	335463	335470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017279	TATT	2	8	344007	344014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017279	TTTA	2	8	376283	376290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017279	TAAA	2	8	385495	385502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017279	AAGG	2	8	388123	388130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017279	TTTA	2	8	388558	388565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017279	ATTA	2	8	391767	391774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017279	TTTA	2	8	391809	391816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017279	AAGT	2	8	393137	393144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017279	AATT	2	8	393151	393158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017279	AATT	2	8	393185	393192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017279	CTAT	2	8	398779	398786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017279	ATTT	2	8	400653	400660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017279	CAAG	2	8	400809	400816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017279	TAGC	2	8	401474	401481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017279	CTTA	2	8	402136	402143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017279	AAAG	2	8	402207	402214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017279	AGTA	2	8	402267	402274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017279	TAAT	2	8	402390	402397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017279	GGAT	2	8	402660	402667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017279	GGTG	2	8	402745	402752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017279	TCCC	2	8	402887	402894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017279	TCGT	2	8	403435	403442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017279	TTAC	2	8	404407	404414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017279	GATA	2	8	408478	408485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017279	TTAA	2	8	409674	409681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017279	TTAA	2	8	409695	409702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017279	ATTT	2	8	409791	409798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017279	ATCT	2	8	409808	409815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017279	GTTT	2	8	409896	409903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017279	TTAA	2	8	416915	416922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017279	AATT	2	8	416984	416991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017279	TTGA	2	8	417587	417594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017279	AACT	2	8	417943	417950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017279	GATT	2	8	418078	418085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017279	CAAG	2	8	418106	418113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017279	TTTG	2	8	418237	418244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017279	ATTT	2	8	418265	418272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017279	GAAG	2	8	419042	419049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017279	ATAA	2	8	419147	419154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017279	ATTT	2	8	438593	438600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017279	ATTT	2	8	439033	439040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.