MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	GGTAA	2	10	11052	11061	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017179	AGGAG	2	10	11432	11441	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017179	TCGTG	2	10	11843	11852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017179	GGGAG	2	10	13121	13130	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017179	TAAGT	2	10	13646	13655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017179	TAAGC	2	10	14067	14076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017179	AAGAT	2	10	15375	15384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017179	GGTAA	2	10	16345	16354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017179	AGGAG	2	10	16725	16734	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017179	TCGTG	2	10	17136	17145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017179	CTTGC	2	10	17689	17698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017179	GGGAG	2	10	18512	18521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017179	TAAGT	2	10	19037	19046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017179	TAAGC	2	10	19458	19467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017179	AAGAT	2	10	20766	20775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017179	TTAAA	2	10	23020	23029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017179	AAAAT	2	10	24624	24633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017179	GATAA	2	10	24659	24668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017179	GGTAA	2	10	30665	30674	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017179	AGGAG	2	10	31045	31054	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017179	TCGTG	2	10	31456	31465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017179	GGGAG	2	10	32734	32743	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017179	TAAGT	2	10	33259	33268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017179	TAAGC	2	10	33680	33689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017179	AAGAT	2	10	34988	34997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017179	TAATA	2	10	35258	35267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017179	AAAAT	2	10	35998	36007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017179	ATTAA	2	10	36891	36900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017179	AAAAT	2	10	37829	37838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017179	ATTTA	2	10	38111	38120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017179	ATTAA	2	10	38816	38825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017179	TATAG	2	10	50681	50690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017179	AATAT	2	10	53198	53207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017179	TTATT	2	10	57840	57849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017179	ATAAG	2	10	57875	57884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017179	ATTAT	2	10	66712	66721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017179	TAAAA	2	10	72472	72481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017179	TTGAA	2	10	74737	74746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017179	ATAAA	2	10	75695	75704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017179	TAAAA	2	10	76866	76875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017179	AAAAT	2	10	76905	76914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017179	ATAAG	2	10	81869	81878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017179	AGCAA	2	10	83803	83812	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017179	TATAA	2	10	84155	84164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017179	AATTT	2	10	87871	87880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017179	ATATT	2	10	94248	94257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017179	TAAAA	2	10	97739	97748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017179	AAAAT	2	10	111402	111411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017179	GTTAA	2	10	131875	131884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017179	AATAA	2	10	131897	131906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017179	ATTTT	2	10	131996	132005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017179	TATAA	2	10	132096	132105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017179	TAAAA	2	10	133108	133117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017179	GGTAA	2	10	133534	133543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017179	AGGAG	2	10	133914	133923	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017179	TCGTG	2	10	134325	134334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017179	CTTGC	2	10	134878	134887	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017179	GGGAG	2	10	135723	135732	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017179	TAAGT	2	10	136248	136257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017179	TAAGC	2	10	136669	136678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017179	AAGAT	2	10	137977	137986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017179	AAGTT	2	10	138279	138288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017179	GGTAA	2	10	139111	139120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017179	AGGAG	2	10	139491	139500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017179	TCGTG	2	10	139902	139911	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017179	CTTGC	2	10	140455	140464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017179	GGGAG	2	10	141300	141309	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017179	TAAGT	2	10	141825	141834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017179	TAAGC	2	10	142246	142255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017179	AAGAT	2	10	143554	143563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017179	GGTAA	2	10	149620	149629	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017179	AGGAG	2	10	150000	150009	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017179	TCGTG	2	10	150411	150420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017179	CTTGC	2	10	150964	150973	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017179	GGGAG	2	10	151809	151818	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017179	TAAGT	2	10	152334	152343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017179	TAAGC	2	10	152755	152764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017179	AAGAT	2	10	154063	154072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017179	GGTAA	2	10	155033	155042	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017179	AGGAG	2	10	155413	155422	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017179	TCGTG	2	10	155824	155833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017179	CTTGC	2	10	156377	156386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017179	GGGAG	2	10	157324	157333	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017179	TAAGT	2	10	157849	157858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017179	TAAGC	2	10	158270	158279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017179	AAGAT	2	10	159578	159587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017179	CAATT	2	10	160287	160296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017179	ATCTA	2	10	161249	161258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017179	TTATA	2	10	163801	163810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017179	TAATT	2	10	163945	163954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017179	TTTGT	2	10	173060	173069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017179	GATAA	2	10	173273	173282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017179	AATTA	2	10	179469	179478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017179	TATAA	2	10	179601	179610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017179	AGTAA	2	10	181882	181891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017179	AATTT	2	10	184779	184788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017179	TAAAA	2	10	184810	184819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017179	ATTAA	2	10	216335	216344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017179	TATAA	2	10	216535	216544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017179	TATAT	2	10	217068	217077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017179	TTAAC	2	10	217085	217094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017179	AATAT	2	10	217780	217789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017179	AAATA	2	10	218038	218047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017179	TAAAA	2	10	218815	218824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017179	TATTC	2	10	219577	219586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017179	ATTTT	2	10	219687	219696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017179	ATTTT	2	10	219712	219721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017179	ATTTA	2	10	219726	219735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017179	TTATA	2	10	219771	219780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017179	GAAAG	2	10	223057	223066	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017179	AAAGT	2	10	224942	224951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017179	TAATA	2	10	228215	228224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017179	GTATA	2	10	228306	228315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017179	GTATA	2	10	231809	231818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017179	ATATA	2	10	235171	235180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017179	AAAAT	2	10	236715	236724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017179	AATTA	2	10	236988	236997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017179	AAAAT	2	10	237098	237107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017179	TATTT	2	10	237165	237174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017179	TATAT	2	10	250141	250150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017179	TTAAT	2	10	250151	250160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017179	TATAA	2	10	256964	256973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017179	AAGTT	2	10	257137	257146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017179	TTTTG	2	10	266060	266069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017179	TTTTC	2	10	270549	270558	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017179	ATATA	2	10	274388	274397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017179	AGAAA	2	10	297279	297288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017179	TTTTA	2	10	301449	301458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017179	AATTA	2	10	301467	301476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017179	TAATA	2	10	320555	320564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017179	AAATT	2	10	346936	346945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017179	TTTTA	2	10	348462	348471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017179	TATTT	2	10	349616	349625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017179	ATTTA	2	10	352200	352209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017179	AGATA	2	10	352506	352515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017179	ATATA	2	10	352999	353008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017179	AATTT	2	10	360265	360274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017179	CTTTT	2	10	362659	362668	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017179	TAAAA	2	10	372231	372240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017179	TAACT	2	10	378613	378622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017179	ATTTT	2	10	378859	378868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017179	TTATT	2	10	380994	381003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017179	CTATA	2	10	381182	381191	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017179	ATATT	2	10	381324	381333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017179	TAAAT	2	10	381558	381567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017179	ATAAA	2	10	381755	381764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017179	TTATA	3	15	384941	384955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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