MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	TCATT	2	10	13453	13462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017096	CTAAA	2	10	29745	29754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017096	CATCG	2	10	46875	46884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017096	ATTTT	2	10	58774	58783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017096	TCTCT	2	10	59063	59072	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017096	AACAG	2	10	60597	60606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017096	AATTT	2	10	60621	60630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017096	GAAAA	2	10	61990	61999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017096	AAAGG	2	10	62784	62793	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017096	GAAAA	2	10	69701	69710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017096	TTTAT	2	10	70271	70280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017096	TTTTG	2	10	70500	70509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017096	TTTAT	2	10	74866	74875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017096	ATTTT	2	10	79204	79213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017096	TTTAT	2	10	79356	79365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017096	TTAAA	2	10	86945	86954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017096	ATTTA	2	10	93788	93797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017096	GCCAA	2	10	97019	97028	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017096	TCGCG	2	10	98935	98944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017096	CGTAA	2	10	109781	109790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017096	CAAAC	2	10	131387	131396	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017096	GGAAG	2	10	133238	133247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017096	CAAAC	2	10	136435	136444	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017096	TAAGA	2	10	146344	146353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017096	TTAAA	2	10	178585	178594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017096	TTCTT	2	10	181186	181195	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017096	TAATA	2	10	181500	181509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017096	TTTGT	2	10	183685	183694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017096	GGATA	2	10	186579	186588	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017096	CTTTT	2	10	203131	203140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017096	AGCGA	2	10	203284	203293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017096	TATTT	2	10	203735	203744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017096	TAATA	2	10	203969	203978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017096	AAATT	2	10	215658	215667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017096	GATTT	2	10	222764	222773	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017096	CTTTT	2	10	226266	226275	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017096	ATTTT	2	10	241899	241908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017096	AATAA	2	10	243610	243619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017096	ATTAT	2	10	244536	244545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017096	AAAAC	2	10	244684	244693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017096	ATTTT	2	10	251504	251513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017096	TTTTA	2	10	251524	251533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017096	GCTTA	2	10	269583	269592	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017096	GGAGA	2	10	270698	270707	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017096	AAGAG	2	10	270957	270966	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017096	ACCCT	2	10	271491	271500	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_017096	TTTTG	2	10	274858	274867	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017096	AATAG	2	10	302250	302259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017096	AATAT	2	10	320167	320176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017096	TAAAA	2	10	325783	325792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017096	GAATT	2	10	336428	336437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017096	GTAGC	2	10	358752	358761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017096	TCATT	2	10	374656	374665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017096	ATTTT	2	10	374813	374822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017096	ATTTA	2	10	390186	390195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017096	TATAT	2	10	392084	392093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017096	TGAAA	2	10	392189	392198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017096	TTATA	2	10	427300	427309	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017096	AATAT	2	10	450364	450373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017096	TAAAA	2	10	450431	450440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017096	ATATA	2	10	460018	460027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017096	AGCGA	2	10	464212	464221	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017096	ATTAT	2	10	472989	472998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017096	AGCGA	2	10	483558	483567	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017096	GAAAA	2	10	485693	485702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017096	TTTTC	2	10	494475	494484	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017096	AGCAA	2	10	504509	504518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017096	ATTTT	2	10	508935	508944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017096	TTTTC	2	10	508948	508957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017096	CCTTT	2	10	519916	519925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017096	AATAT	2	10	526976	526985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017096	TCGTG	2	10	542483	542492	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017096	GGGAG	2	10	543654	543663	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017096	TTAAA	2	10	607714	607723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017096	ATTTT	2	10	607919	607928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017096	TATAT	2	10	607952	607961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017096	CTTTT	2	10	628807	628816	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017096	TTCCT	2	10	629295	629304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017096	TTTCT	2	10	629395	629404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017096	TATAA	2	10	638569	638578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017096	ATTTT	2	10	642444	642453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017096	ATTTT	2	10	644778	644787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017096	ATTTT	2	10	645057	645066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017096	AAATT	2	10	663244	663253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017096	ATTAT	2	10	680017	680026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017096	CAATA	2	10	697840	697849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017096	GTTTG	2	10	697888	697897	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017096	ATATT	2	10	809749	809758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017096	AATAA	2	10	834866	834875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017096	TTTAT	2	10	835063	835072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017096	TACCT	2	10	866229	866238	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017096	ATTTC	2	10	866425	866434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017096	TTTTG	2	10	866632	866641	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017096	AATTA	2	10	880889	880898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017096	GAAAA	2	10	906849	906858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017096	CTTAA	2	10	908496	908505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017096	TCATT	2	10	922534	922543	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017096	AAAAT	2	10	925306	925315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017096	ATAAA	2	10	925956	925965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017096	CAATT	2	10	943832	943841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017096	TAATA	2	10	944268	944277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017096	TTTCT	2	10	971683	971692	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017096	GAAAA	2	10	977293	977302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017096	GTTTG	2	10	1007419	1007428	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017096	TTCTT	2	10	1010548	1010557	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017096	CCTTC	2	10	1010616	1010625	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017096	TAAAC	2	10	1026863	1026872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017096	TTTTC	2	10	1026941	1026950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017096	AAATT	2	10	1131395	1131404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017096	ATATT	2	10	1151685	1151694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017096	ACCTC	2	10	1225413	1225422	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017096	ATAAA	2	10	1225424	1225433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017096	TTATC	2	10	1254732	1254741	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017096	TTGTT	2	10	1254803	1254812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017096	TTATA	2	10	1255576	1255585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017096	TAAAA	2	10	1263493	1263502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017096	AGCGA	2	10	1268623	1268632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017096	TAAAA	2	10	1277390	1277399	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017096	TCGCT	2	10	1294838	1294847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017096	AATGA	2	10	1295036	1295045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017096	TTTAG	2	10	1295104	1295113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017096	TTTTA	2	10	1320766	1320775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017096	CGAAT	2	10	1324299	1324308	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017096	ATAAG	2	10	1346851	1346860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017096	ATATT	2	10	1359942	1359951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017096	AAAAC	2	10	1363462	1363471	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017096	TCATT	2	10	1371788	1371797	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017096	AATAC	2	10	1385531	1385540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017096	TTTAT	2	10	1402170	1402179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017096	CCCTC	2	10	1402245	1402254	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
131	NC_017096	AATTA	2	10	1419021	1419030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017096	AAAGG	2	10	1423231	1423240	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017096	AGGTG	2	10	1454009	1454018	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017096	TATTT	2	10	1457166	1457175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017096	TATAT	2	10	1474034	1474043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017096	TTATA	2	10	1484606	1484615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017096	TAAAA	2	10	1520377	1520386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.