MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 7689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	CAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017079	ACA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017079	CTC	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017079	TTC	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017079	TGT	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017079	TCC	2	6	8625	8630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017079	AAC	2	6	13155	13160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017079	CTG	2	6	14512	14517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017079	TGT	2	6	14523	14528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017079	TCC	2	6	15947	15952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017079	AGG	2	6	16077	16082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017079	AAG	2	6	17184	17189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017079	GGA	2	6	20034	20039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017079	AGC	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017079	GTC	2	6	21463	21468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017079	GAG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017079	GAG	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017079	GGC	2	6	25393	25398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017079	GCC	2	6	25407	25412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017079	CGC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017079	TCC	2	6	31779	31784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017079	TAC	2	6	31923	31928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017079	CAT	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017079	GAA	2	6	32039	32044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017079	AAT	2	6	33628	33633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017079	CGG	2	6	33680	33685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017079	CAG	2	6	33829	33834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017079	CAG	2	6	33836	33841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017079	TGT	2	6	33906	33911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017079	TGG	2	6	34027	34032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017079	AAG	2	6	35045	35050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017079	GAT	2	6	36132	36137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017079	GAG	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017079	GTG	2	6	38407	38412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017079	CCA	2	6	38422	38427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017079	ACA	2	6	39053	39058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017079	CGA	2	6	39070	39075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017079	TCC	2	6	39225	39230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017079	CAT	2	6	42076	42081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017079	TTC	2	6	42188	42193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017079	AGG	2	6	42204	42209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017079	GGC	2	6	45863	45868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017079	GCG	2	6	45873	45878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017079	AAC	2	6	48187	48192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017079	CAT	2	6	49118	49123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017079	CGG	2	6	49127	49132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017079	AAC	2	6	49139	49144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017079	GAT	2	6	52892	52897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017079	AAG	2	6	54861	54866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017079	TGG	2	6	55221	55226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017079	CAG	2	6	55281	55286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017079	CTT	2	6	55390	55395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017079	AGG	2	6	55432	55437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017079	GGA	2	6	58012	58017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017079	ATA	2	6	60582	60587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017079	GGC	2	6	60597	60602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017079	TCC	2	6	66757	66762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017079	CAT	2	6	66797	66802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017079	AGG	3	9	66844	66852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017079	TGA	2	6	71836	71841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017079	ACA	2	6	71927	71932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017079	TTC	2	6	71982	71987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017079	TCC	2	6	72608	72613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017079	CCT	2	6	72711	72716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017079	TAT	2	6	72895	72900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017079	AGA	2	6	73000	73005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017079	GAA	2	6	73021	73026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017079	GGA	2	6	73096	73101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017079	GTT	2	6	75721	75726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017079	CTT	2	6	78065	78070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017079	CAC	2	6	78109	78114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017079	ACC	2	6	78119	78124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017079	AAG	2	6	78153	78158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017079	GTG	2	6	78248	78253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017079	TCT	2	6	78274	78279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017079	GTG	2	6	78292	78297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017079	AGA	2	6	78298	78303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017079	GCT	2	6	82131	82136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017079	CAC	2	6	82870	82875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017079	GTG	2	6	82942	82947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017079	GCA	2	6	82955	82960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017079	GGA	2	6	82979	82984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017079	GCG	2	6	85065	85070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017079	AAG	2	6	87563	87568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017079	GCA	2	6	87596	87601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017079	TTG	2	6	87656	87661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017079	GCG	2	6	87711	87716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017079	ACA	2	6	91691	91696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017079	CTG	2	6	91698	91703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017079	GAA	2	6	91730	91735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017079	AAC	2	6	91773	91778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017079	CCT	2	6	91904	91909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017079	CTA	2	6	92485	92490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017079	CGA	2	6	92617	92622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017079	GAT	2	6	92682	92687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017079	CTG	2	6	96244	96249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017079	CCG	2	6	96266	96271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017079	ATG	2	6	96291	96296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017079	GCA	2	6	96373	96378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017079	TTC	2	6	96399	96404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017079	GCT	2	6	116629	116634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017079	GGT	2	6	116661	116666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017079	ACA	2	6	116740	116745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017079	CTT	2	6	116766	116771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017079	GCA	2	6	116955	116960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017079	GCT	2	6	117035	117040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017079	CAG	2	6	117078	117083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017079	CCA	2	6	117190	117195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017079	TGA	2	6	117356	117361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017079	AGA	2	6	117362	117367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017079	CAT	2	6	120183	120188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017079	ATA	2	6	121340	121345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017079	CAG	2	6	121350	121355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017079	TCT	2	6	121375	121380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017079	TTC	2	6	123134	123139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017079	CGG	2	6	126218	126223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017079	CCG	2	6	126259	126264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017079	ACC	2	6	126317	126322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017079	AGA	2	6	128763	128768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017079	GAG	2	6	131535	131540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017079	GAG	2	6	131549	131554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017079	GAC	2	6	135292	135297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017079	GTT	2	6	135300	135305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017079	TTG	2	6	135339	135344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017079	ACG	2	6	135438	135443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017079	ATG	2	6	135486	135491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017079	GCC	2	6	135955	135960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017079	GAG	2	6	146224	146229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017079	CAA	2	6	146351	146356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017079	ATT	2	6	146370	146375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017079	TCA	3	9	146914	146922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017079	AGC	2	6	146936	146941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017079	GTT	2	6	146942	146947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017079	TGT	2	6	147045	147050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017079	ATC	2	6	148519	148524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017079	GCA	2	6	148539	148544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_017079	GCC	2	6	150418	150423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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