MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 12768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017079	CGA	2	6	282549	282554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017079	ACA	2	6	282643	282648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017079	AGA	2	6	282661	282666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017079	GCA	2	6	284040	284045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017079	TCCA	2	8	284062	284069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017079	CAAATT	2	12	285388	285399	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_017079	TGC	2	6	285400	285405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017079	ATG	2	6	285424	285429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017079	TTA	2	6	285441	285446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017079	AG	3	6	285481	285486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017079	TAAA	2	8	285502	285509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017079	TGC	2	6	285616	285621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017079	GCC	2	6	285634	285639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017079	GCTG	2	8	288891	288898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017079	TGCC	2	8	289366	289373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_017079	C	6	6	289506	289511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
517	NC_017079	ATG	2	6	289547	289552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017079	CCA	3	9	289565	289573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017079	TTAG	2	8	289574	289581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017079	CT	3	6	289597	289602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_017079	ACC	2	6	289645	289650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017079	AAG	2	6	289651	289656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017079	CAT	2	6	289746	289751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017079	GC	3	6	289809	289814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017079	CGT	2	6	289821	289826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017079	CAT	2	6	289839	289844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017079	CCA	2	6	289967	289972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_017079	CAA	2	6	289986	289991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017079	TGG	2	6	290034	290039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017079	AAT	2	6	290103	290108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017079	GT	3	6	290214	290219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017079	CAA	3	9	290346	290354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017079	CAA	2	6	290623	290628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017079	ATC	2	6	290675	290680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017079	AATTG	2	10	290699	290708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017079	TC	3	6	290748	290753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017079	TAT	2	6	290769	290774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017079	CAT	2	6	290823	290828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017079	CCG	2	6	290964	290969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017079	GTT	2	6	291136	291141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017079	ATC	2	6	291166	291171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017079	GTCG	2	8	291191	291198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_017079	TGA	2	6	291222	291227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017079	GAC	2	6	291253	291258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017079	TCA	2	6	291314	291319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017079	TTA	2	6	291389	291394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017079	CCGG	2	8	291443	291450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_017079	CTTC	2	8	291581	291588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017079	A	6	6	291749	291754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017079	CAG	2	6	291838	291843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017079	CAA	2	6	291859	291864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017079	CAA	2	6	291921	291926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017079	T	6	6	291956	291961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017079	CGTT	2	8	294130	294137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_017079	TCC	2	6	298434	298439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017079	CCT	2	6	301376	301381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_017079	AAC	2	6	303897	303902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017079	TGCGG	2	10	303911	303920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
559	NC_017079	T	6	6	303927	303932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017079	TCA	2	6	303936	303941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017079	AGG	2	6	303997	304002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017079	TGA	2	6	304056	304061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017079	CTC	3	9	304090	304098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017079	CAG	2	6	304101	304106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017079	GACA	2	8	304134	304141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_017079	AC	3	6	304180	304185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017079	A	6	6	304263	304268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017079	ATT	2	6	305569	305574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017079	TCG	2	6	306557	306562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017079	CTG	2	6	308508	308513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017079	T	6	6	308522	308527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017079	ATC	2	6	308558	308563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017079	TGA	2	6	308648	308653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017079	GA	3	6	308652	308657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017079	TGG	2	6	308695	308700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017079	GA	3	6	308716	308721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017079	CGGC	2	8	308749	308756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_017079	ATTC	2	8	311447	311454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_017079	AGA	2	6	311566	311571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_017079	CG	4	8	313182	313189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_017079	TCC	2	6	313203	313208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_017079	GTC	2	6	317137	317142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017079	CG	3	6	317148	317153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017079	ATG	2	6	317159	317164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_017079	T	6	6	317234	317239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017079	A	6	6	317315	317320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017079	CGC	2	6	317321	317326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_017079	GCG	2	6	317337	317342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017079	GGTG	2	8	317402	317409	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017079	ATC	2	6	317505	317510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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595	NC_017079	A	6	6	319595	319600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017079	CCTCG	2	10	319629	319638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
597	NC_017079	GCA	2	6	319652	319657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017079	CTA	2	6	319746	319751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017079	GGA	2	6	319808	319813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017079	GAT	2	6	321375	321380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017079	GAA	2	6	321456	321461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017079	GTT	2	6	321485	321490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017079	CCT	2	6	321498	321503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017079	CGC	2	6	321519	321524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017079	TGA	2	6	321527	321532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017079	TG	3	6	321866	321871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017079	CGCA	2	8	321879	321886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_017079	GC	3	6	321924	321929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017079	GC	3	6	321954	321959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_017079	AAAC	2	8	325307	325314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_017079	CGC	2	6	326879	326884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017079	CTG	2	6	326927	326932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017079	ATCGAG	2	12	326947	326958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_017079	CTAT	2	8	327176	327183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_017079	ACG	2	6	327200	327205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017079	GAG	2	6	328346	328351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017079	ACCAAA	2	12	328365	328376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017079	GCTG	2	8	328476	328483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
619	NC_017079	CAGGC	2	10	328602	328611	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_017079	GC	3	6	328610	328615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017079	GCAA	2	8	328645	328652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_017079	GTA	3	9	329504	329512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017079	CTT	2	6	329513	329518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017079	CAC	2	6	329519	329524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017079	CGC	2	6	329527	329532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017079	GTA	2	6	329555	329560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017079	ATC	2	6	329630	329635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017079	TCCA	2	8	329652	329659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_017079	GT	3	6	329664	329669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017079	ATGCA	2	10	329739	329748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
631	NC_017079	ATCA	2	8	329764	329771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_017079	CTT	2	6	330882	330887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017079	CAC	2	6	330888	330893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017079	CGC	2	6	330896	330901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017079	CCTT	2	8	330979	330986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_017079	ATG	2	6	333464	333469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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